09 – Mérhető tulajdonságok

Kalibrált vs nem kalibrált képek Ismétlés: méretkalibrált? Image/Properties... bitmélység?

Mérés Kijelölés nélkül Kijelöléssel az egész képet méri pont vonal koordináták, fényességérték vonal hossz, szög, stb téglalap terület, középpont koordinátai pixelek fényességének statisztikái stb ovális, szabdkézi, stb. mint a téglalapnál + alakleíró eredmények (roundness, perimeter) stb.

Mérés előkészítése Kép másolása Másolaton a mérendő struktúrák kiemelése, lehetőleg az egész képre alkalmazott változtatásokkal (amit a félév eddigi részében csináltunk) Terület, darab, stb mérhető a másolaton Fényerő és hasonlók mérhetőek a másolat kijelölése alapján a kiindulási képen eredeti thresholdolt másolat

Kijelölés Lehetséges kijelölések téglalap, ovális, jobb egérgombbal további opciók polygon, freehand a szabálytalan struktúrákhoz vonal (+jobb egér!) point, multipoint varázspálca, bináris képeken ez a tökéletes kijelölő eszköz, de szürkeárnyalatoson is segíthet, ott érdemes beállítani az érzékenységét (jobb egér)

ROI Manager t billentyű (esetleg ctrl+t, ha a sima le van tiltva) az adott kijelölést, mint határvonal pontok halmazát kirakja egy ablakba ezt aktiválva minden más képen is, ha a méreteik elérik az x,y koordinátákhoz szükséges nagyságot, akkor megjeleníthető a kijelölés

ROI Manager menü

Add, Update, Rename, Measure, Deselect Flatten elég egyértelmű Flatten A kiválasztás vonalát mint megadott színű pixeleket beleolvasztja a képbe. Feldolgozáshoz nem, publikációs illusztrációhoz hasznos. Show all egyszerre mutatja a képen az összeset Labels a körvonal mellé kiírja a nevét, ami különösen akkor hasznos, ha van nekik

Open Save... Labels List korábban elmentett ROI megnyitása ROI, vagy ROI gyüjtemény elmentése. Figyelem, különböző fileformátumot igényelnek!!! Labels a cimkék tulajdonságait változtatja List eredménytáblába kiírja a kijelölések tulajdonságait

többrétegű képeknél érdemes a kijelölést a réteghez rögzíteni!!! a ROI-k nevei csak akkor lesznek kiírva, ha a bepipáljuk az utolsó négyzetet, egyébként a FIJI által kiosztott számot adja de néha meg nem

Kijelölés küszöbértékkel a thresholdolt képen látszólag ugyanazt választja ki, mintha kézzel egyesével jelölnénk DE...

Mérési beállítások Analyze/Set Measurements... bővebb magyarázat: http://rsbweb.nih.gov/ij/docs/guide/146-30.html#toc-Subsection-30.7 Mérhető paraméterek Eredmény kijelzés paraméterei

Mérés a kijelöléseken A ROI Manager Measure gombjára kattintva Analyze/Measure ekkor az aktív kijelölést méri, vagy ha nincs, akkor az egész képet m billentyű (ctrl + m) Ha több ROI látható, akkor az aktív más színnel jelenik meg, szerencsére

Ereménytábla ?

Eredménytábla File/Save as... Edit Results/Summarize txt, csv copy (másolás excelbe) clear (ez végleg eltüntet mindent, szóval óvatosan) Results/Summarize az összes megjelenített eredmény statisztikai alapadatai

Játszani ismétlés: Image/Properties, Show Info Kijelölések és módosításaik: Rectangle, Oval, Polygon, Freehand, Line, Angle, Point, Wand. A módosításokhoz nem muszáj végigkattintgatni az Edit menüt, a képre jobbkattintás után Control Panel... és ott ki lehet keresni a Selection listát. Edit/Selection/Scale..., Rotate..., Enlarge..., Make Band..., Staighten...(ez vicces), Add to Manager (ctrl+t) + ROI Manager funkciók. Edit/Selection/ Select All, None, Make Inverse, Create Selection és inverz művelete: Create Mask. ROI Manipulations: Fit Spline, Fit Circle, Fit Ellipse, Convex Hull, Area to Line, Make Band, Bounding Box. Edit/Selection/Properties... List Coordinates itt lehet a kiválasztás pontjait kiíratni. Az ÖSSZES ROI Manager funkciót kipróbálni!!!!!!!!! és megérteni!!!!!!!!!!!