Fehérjerétegek leválasztása és vizsgálata MTA-MFA Nyári iskola 2009 Fehérjerétegek leválasztása és vizsgálata Műszaki Fizikai és Anyagtudományi Kutatóintézet (MTA-MFA), Budapest Lovassy László Gimnázium, Veszprém Janosov Milán mentor: Kozma Péter Budapest, 2009.06.25.
Fehérjék Fibrinogén - 45 nm x 9 nm x 6 nm - modell fehérje Flagellin - baktériumok mozgásszervei - 5-20μm hosszú, - 20-25nm átmérőjű - 1500 fordulat / s
Genetikai manipuláció Több tízezer monomer 3 belső domén a polimer szerkezetért felelős A külső domént genetikai módosítjuk Különféle vegyületeket megkötő receptorok
Atomerő mikroszkóp (AFM) AIST-NT SmartSPM™ 1000 Üzemmódok: - ‘contact’ mód - ‘semi-contact mód - ‘non-contact’ mód 10-20 nm görbületi sugarú Si tű
Ellipszometria Spektroszkópiai Ellipszométer (SE) Woollam M2000-DI Ellipszometriai szögek: Ψ , Δ Optikai modell - Cauchy - EMA Számítógépes illesztő algoritmus - spektrum: Ψ , Δ hullámhossz függvényében - modell feltételezése - minimális MSE elérése
Folyadékcella In situ vizsgálatokhoz A folyadék (pl. fehérjeoldat) átáramlik Fehérjeréteg kiválasztása
Optikai modellalkotás Minta Modell
AFM felvételek Fibrinogén Flagellin - Képméret: 1 µm x 1 µm - Felbontás: 512 x 512 - Pásztázási idő: 1 s / sor
SE in-situ kiértékelések Fibrinogén Flagellin de Feijter formula felületi tömegsűrűség
Összefoglalás Folyadékcella fehérje leválsztása, in-situ vizsgálata SE optikai modell megalkotása Felületi tömegsűrűség meghatározása AFM felvételekkel felületi morfológia