GPU párhuzamosítási lehetőségek az agyi aktivitás forráslokalizáció probléma megoldásában Juhász Zoltán Pannon Egyetem, Veszprém

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Nagyfeloldású Mikroszkópia Dr. Szabó István 14. 3D Tomográfia és képalkotás TÁMOP C-12/1/KONV projekt „Ágazati felkészítés a hazai ELI.
Advertisements

IBM Software Group ® Tartalomkezelés és egységes hozzáférés a vállalati adatvagyonhoz Kovács László IBM SWG.
A Non-Profit teljesítménymérés problémái (mérési és fejlesztési lehetőség) Márkus Gábor CVS, PVM, TVM, igazgató Stúdium Kft. Oktatás és Projekt menedzsment.
Elhárító mechanizmusok. A szorongásról A szorongás két típusa ( ) A szorongás két típusa ( ) reális szorongás neurotikus szorongás: a.
MI A SEO? KÜLSŐS SEO CÉG VAGY SAJÁT SZAKEMBER? MIKOR MELYIKET VÁLASSZAM, ELŐNYÖK/HÁTRÁNYOK Horváth Ernő – WebSEO Kft
Követelményelemzés – követelményspecifikáció A szoftverfejlesztés kapcsán az elemzés speciálisan egy kezdeti szakaszt jelöl, amelynek alapvető feladata.
Muzeális gyűjtemények kezelése Huntéka rendszerben Informatio Medicata 2012 Simon András Monguz Kft.
1 Az önértékelés mint projekt 6. előadás 1 2 Az előadás tartalmi elemei  A projekt fogalma  A projektek elemei  A projekt szervezete  Projektfázisok.
„ Tágas városom kis lakásra cserélem” Hajléktalanok önálló lakhatásának elősegítése, munkaerő-piaci integrációjának megalapozása TÁMOP /
FELSŐOKTATÁSI INTÉZMÉNYEK WEBOMETRICS RANGSORÁNAK VIZSGÁLATA GOOGLE PAGERANK TEKINTETÉBEN DOSz – Tavaszi Szél Konferencia 2016 Losonczi György.
GUARDING YOUR BUSINESS ■ Linux disztribúciók és FreeBSD az upstream szemszögéből Czanik Péter Community manager syslog-ng upstream.
XXIV. Országos Jegyző-Közigazgatási Konferencia Wi-Fi és HD kamerarendszer Borbély Olivér
NIIF grid projktek: eredmények, trendek, tervek
Szécsi László 3D Grafikus Rendszerek 15. előadás
Dobrik-Lupták Sára szeptember 19.
Számítógépes szimuláció
11/2/2017 Horváth Botond, Dunaújvárosi Főiskola, Informatika Biztonság Labor Konzulens Dr. Leitold Ferenc, Hadarics Kálmán “Nemcsak azokkal a sebezhetőségekkel.
Lieszkovszky József Pál (PhD hallgató, RGDI
Adóhatósági tapasztalatok az e-kereskedelem ellenőrzése során
Frekvencia függvényében változó jellemzők mérése
STRATÉGIAI ÉS ÜZLETI TERVEZÉS 9. előadás
Programstruktúrák.
Általános célú számítások a GPU-n
Folyamatmanagement eszközök hódítása Teremts rendet a káoszból PPM-el
Innováció a vezetési tanácsadásban
Számítógép generációk
A CMMI modell alkalmazása SOA-környezetben
Az IM csomópont funkciója, főbb tervezési kérdései
Mikrovezérlők alkalmazástechnikája laboratóriumi gyakorlat
A Dél-Alföldi régió innovációs képessége
Észlelés és egyéni döntéshozatal, tanulás
TIA A termelésinformatika alapjai
Ács Szabina Kommunikáció és Médiatudomány
Nagyrugalmas deformáció – fenomenológia Vázlat
A MOTIVÁCIÓ SZEREPE ÉS HATÁSKÖRE A KÖZOKTATÁSBAN ÉS A FELSŐOKTATÁSBAN
Az ifjúsági közösségek szerepe a helyi kulturális életben
Nagyméretű kópiaszám változás (CNV) detekciója teljes genom asszociációs vizsgálatokban Az ábrán egy kromoszómán (alsó sáv) mért intenzitások aránya (B.
Követelményelemzés Cél: A rendszer tervezése, a feladatok leosztása.
Szoftver vizualizáció
Innovációs képesség és jólét összefüggései
A külső környezet elemei
ADAT ÉS TECHNOLÓGIA ORIENTÁLT MARKETING TEVÉKENYSÉG, VÉGE A MEGÉRZÉSEK ÉS AZ ÉRZELMI ALAPÚ DÖNTÉSHOZATALNAK.
Chapter 2 Human Information Processing
Business Mathematics
A számítógép felépítése
A Cisco Systems Munkaerőpiac a hálózati szegmensben
Diplomás kompetenciák elégedettség a munkával
STRUKTURÁLT SERVEZETEK: funkció, teljesítmény és megbízhatóság
Az internet minőségi információ halmazainak feltárásáról
Kábelhiba keresés az ELQ 35 - el
Szoftverrobotok vs biorobotok Bemutatkozik Albert, a vállalati robot
Patkány EEG.
Tájékoztatás a évi Országos Statisztikai Adatfelvételi Program (OSAP) teljesüléséről az Országos Statisztikai Tanács és a Nemzeti Statisztikai Koordinációs.
Önkormányzati adattárház
A számítógép története
beruházás-tervezési ABCD
SZAKKÉPZÉSI ÖNÉRTÉKELÉSI MODELL I. HELYZETFELMÉRŐ SZINT FOLYAMATA 8
A szállítási probléma.
I. HELYZETFELMÉRÉSI SZINT FOLYAMATA 3. FEJLESZTÉSI FÁZIS 10. előadás
Tesztgenerálás a gyakorlatban Az IntelliTest és ami mögötte van
Dr. Vasas Lívia, PhD december
A humán genom projekt.
Mintaillesztés Knuth-Morris-Pratt (KMP) algoritmus
OVIDIUS Info-Service Co Ltd.
Webarchívum mint a tudományos kutatások tárgya
Kábelhiba keresés az ELQ 30 - al
Kábelhiba keresés az ELQ 30A+ - al
AZ ORSZÁGOS KOMPETENCIAMÉRÉSEK MEGSZERVEZÉSE A TANODÁBAN
SPORTDiscus with Full Text Semmelweis Egyetem Központi Könyvtár 2012
Az operációs rendszer definíciója
Előadás másolata:

GPU párhuzamosítási lehetőségek az agyi aktivitás forráslokalizáció probléma megoldásában Juhász Zoltán Pannon Egyetem, Veszprém

ENIAC CSI projekt CSI – Central nervous System Imaging

Structure of project modules

EEG képalkotás

Projekt célok Epilepszia gócok lokalizálása – Interiktális tüskék azonozítása és a tüskéket generáló agyi területek azonosítása Forward/inverse probléma  Ekvivalens dipólus keresése  Lokalizációs algoritmusok vizsgálata  Lokalizációs hiba elemzése

Időproblémák Model of the head tissue properties Model of the head tissue properties

Forward megoldás futási ideje Realisztikus fejmodell, 1 dipólus:5 perc Gömbmodell, N dipólus: runtime [sec] number of dipolesMatlabCoptimised C

SOLO screenshot

Forward megoldó GPU-n Speedup with respect to number of dipolesMatlabCoptimised C Egyrétegű gömbmodell (384 GPU cores), 2500 and dipoles  180 és 480 msec  C/Matlab (5/300 sec 50/3000 sec) 4-rétegű modell implementálása folyamatban – Gyorsabb szekvenciális algoritmus

Dipólus keresés

Implementációs kérdések Párhuzamosítás Dipólus x elektróda Bemenő adatok: fejmodell, elektróda geometria, mért potenciál, dipólus pozíciók és orientáció Memória Device,constant,shared? Stream feldolgozás jCUDA

Intracraniális electródák vizualizációja Current results Future work

Sokcsatornás EKG diagnosztika

Összefoglalás SOLO szoftver első változat EEG jelek és skalp potenciál megjelenítése  Felületi Laplace operátor (current source density)  3D egyedi páciens modell vizualizálás  Gömbi fejmodell integrálva, közel valós idejű forward megoldó6 msec 2500 dipólusra További tervek  Gömbi és realisztikus fejmodell alapú lokalizációs algoritmusok párhuzamosítása  MR képmegjelenítő, videó monitorozás funkció  Inverz megoldók vizsgálata, implementálása

Forward megoldás futási ideje Realisztikus fejmodell, 1 dipólus:5 perc Gömbmodell, N dipólus: runtime [sec] number of dipolesMatlabCoptimised C