Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota.

Hasonló előadás


Az előadások a következő témára: "Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota."— Előadás másolata:

1 Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota változatlan és a populáció aszinkron) A tenyészet sejttömege az idő függvényében M(t) = M 0 ·e  ·t (a sejtek koreloszlása és ciklus alatti tömegnövekedése ezt nem befolyásolja) Az egyedi sejt tömege az idő függvényében m(t) = m 0 ·e  ·t ??? m 0 a születéskori sejttömeg 0 < t < CT, ahol CT a sejt ciklusideje m(CT) = 2m 0 (tetszőleges monoton függvény elképzelhető) exponenciális-e a növekedés a sejtek életében ???

2 Sejtnövekedési modellek Exponenciális modell: a sejt növekedési sebessége folyamatosan nő → riboszómák száma (Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae ???) Lineáris (multilineáris) modell: a sejt növekedési sebessége állandó → bizonyos esemény(ek)nél ugrásszerű változások (Schizosaccharomyces pombe) CK ha a növekedés lineáris, és a ciklus belsejében nincs sebességváltás ↓ a sejt osztódásakor a növekedési sebességnek ugrásszerűen meg kell duplázódnia ↕ exponenciális növekedés esetében a sejt osztódásakor sincs hirtelen változás

3 A hasadó élesztőgomba, mint a sejtnövekedés modellje Mitózisos (ivartalan) sejtciklus Mitchison, 1957 csak hosszirányú sejtnövekedés → tömeg, térfogat és hossz ~ arányos a ciklus végén a hossznövekedés megszűnik Mitchison & Nurse, 1985 Sveiczer, Novák & Mitchison, 1996 a növekedés mintázata (bi)lineáris a ciklus közepe táján van egy sebességváltási pont (RCP)

4 A hasadó élesztőgomba mitózisos sejtciklusa

5 SG2MG1S RCP2 Idő (min) Sejthossz, L (  m) NETO új régi vég CK A Schizosaccharomyces pombe növekedése RCP3 RCP1

6 DL BL CT 5 min A mikrofotográfia módszere mért változó: a sejthossz (L) a születéstől (BL) az osztódásig (DL) az idő függvényében (0 < t < CT)

7 A mérési pontokra illesztett modellek Lineáris L(t) = a·t + b Exponenciális L(t) = c·e d·t Bilineáris L(t) =  ·ln{exp[  ·(t-  )/  ] + exp[  ·(t-  )/  ]} +  ahol  az RCP pozíciója,  pedig az átmenet élessége A legadekvátabb modell kiválasztási kritériumai Korrelációs koefficiens Reziduális standard deviációs = (SSE/df) 1/2 Akaike információs kritérium AIC = n obs · ln(SSE) + 2n par Schwarz Bayes információs kritérium SBIC = n obs · ln(SSE) + n par · ln(n obs )

8 RCP α 1 = μ m min -1 α 2 = μ m min -1 ε = 9.84 μ m τ = 57.6 min η = 0.01 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (éles bilineáris eset)

9 RCP α 1 = μ m min -1 α 2 = μ m min -1 ε = 10.2 μ m τ = 59.7 min η = μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (sima bilineáris eset)

10 γ = μ m min -1 δ = 7.86 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (lineáris eset)

11 α 1 = μ m min -1 α 2 = μ m min -1 ε = 10.8 μ m τ = 64.3 min η = μ m RCP Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Hasadó élesztő sejtek „átlagos” növekedési mintázata (sima bilineáris)

12 A hasadó élesztő sejtnövekedése általában bilineáris, de gyakran nem éles

13 A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 1. WT cdc2 ts Fantes, P. A. (1977). Control of cell size and cycle time in Schizosaccharomyces pombe. J. Cell Sci. 24,

14 Sveiczer, A., Novak, B. & Mitchison, J. M. (1996). The size control of fission yeast revisited. J. Cell Sci. 109, A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 2.

15 Sveiczer, A., Novak, B. & Mitchison, J. M. (1996). The size control of fission yeast revisited. J. Cell Sci. 109, A méretkontroll a G2 fázis közepén hat → G2 = „sizer + timer” A méretkontroll pozícionálása hasadó élesztőben


Letölteni ppt "Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota."

Hasonló előadás


Google Hirdetések