Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Ivarsejtfejlődés Drosophila melanogasterben. Az Escherichia coli biofilm életciklusa. (1) A szabadon élő baktériumok hordozó felületre tapadnak, majd.

Hasonló előadás


Az előadások a következő témára: "Ivarsejtfejlődés Drosophila melanogasterben. Az Escherichia coli biofilm életciklusa. (1) A szabadon élő baktériumok hordozó felületre tapadnak, majd."— Előadás másolata:

1 Ivarsejtfejlődés Drosophila melanogasterben

2 Az Escherichia coli biofilm életciklusa. (1) A szabadon élő baktériumok hordozó felületre tapadnak, majd (2) tapadást elősegítő sejten kívüli állományt fejlesztenek. (3,4) Létrejön a biofilm amely érése során sajátságos alakot vesz fel, és belső testfelépítést alakít ki. (5) A biofilmet alkotó baktériumok osztódása során újra szabadon élő baktériumok jönnek létre, melyek alkalmas környezetben újabb biofilmet fejleszthetnek ki Konfliktus az egyes sejtek között

3 A: Volvocidae ostoros fotoszintetizáló alga család tagjai átmenetet mutatnak az (A) egysejtű, (B,C) sejtdifferenciációt nem mutató többsejtű, valamint (D,E,F) a nagy belső szaporodó (gonídium) és a kicsi külső, steril testi sejtekből álló soksejtes életformák között. Chlamydomonas reinhardtii; B: Gonium pectorale; C: Eudorina elegans; D: Pleodorina californica; E: Volvox carteri; F: Volvox aureus. Nincs konfliktus az egyes sejtek között

4 Érvényes ez a séma a magasabb rendűekre is?

5 1978: emberi sztemsejtek vérből 1981: első egérből származó sztemsejt- tenyészetek 1988: Embrionális sztemsejt-tenyészet hörcsögből 1997: Dolly klónozás (totipotencia) 1997: rák sztemsejtek felefedezése

6

7 Niche

8 Transit amplifying steps

9 Niche Transit amplifying steps Primordial germ cells

10 Cell, Vol. 100, 157–168, January 7, 2000, Stem Cells: Units of Development, Units of Regeneration, and Units in Evolution Irving L. Weissman Stanford University School of Medicine Department of Pathology Stanford University Medical Center Stanford, California 94305–5323

11

12

13

14

15 Drosophila ivarsejt sztemsejt és ivarplazma

16

17 Preformált >

18

19 Preformáció-Epigenezis, melyik az elsődleges? Extavour szerint az epigenezis, az ivarsejtek később tanulják meg magukat ellátni ivarsejtfajtorokkal. Sztemsejt-ivarsejt hasonlóság. Cassandra Extavour szerint is az ivarsejtek egyfajta sztemsejtek. Van erre kísérleti bizonyíték?

20 PNAS November 25, 2003 vol. 100 no Kísérletes bizonyíték az ivarsejt-szemsejt ekvivalencia a Drosophila ivarsejtfejlődés során A poláris plazma vizsgálatával általános ivarsejt jellemzőket vizsgálunk

21 Az ivarsejtek egyfajta sztemsejtek, melyek generációról generációra átadódnak. Az ivarsejtek differenciációja eltér a testi sejtek differenciációjától. Az ivarsejtek esetében inkább egy fejlődéstani alapállapot megőrzéséről van szó.

22

23 Oskar RNS, Staufen fehérje (Anne Ephrussi, Daniel st Johnston)

24 Anterior oskar RNS ektopikus ivarsejteket eredményez (Anne Ephrussi) Lokalizált RNS és annak helyspecifikus transzlációja

25 Klasszikus genetikai megközelítés

26 Az anyai ivarsejtfaktorok hiányában nem fűződnek le embrionális ivarsejtek

27 ampR White ori P transzpozáz rosy LacZ A B Bier et al. Genes Dev (9): A kanamicin R white ori H transzpozáz rosy LacZ B Smith et al Genetics 135: 1063-

28 Az aktin kötő tropomiozin részt vesz az OSKAR fehérje lokalizációban vt Anterior oskar Tropomiozin/TropomiozinTropomiozin/Tropomiozin,Anterior oskar

29 EGFP hs-neo 1 w+w+ nincs polyA SAS SDS nincs promóter saját promóter polyA saját polyA Stop-Start Jankovics Ferenc Lukácsovich Tamás A klaszikus transzpozon rendszerek hatékonyságának növelése géncsapdázással

30 Az oskar fehérje az aktin vázhoz horgonyzódik ki Vad típus Moesin Jankovics Ferienc

31 Genetics 153: (September 1999) An Exploration of the Sequence of a 2.9-Mb Region of the Genome of Drosophila melanogaster M. Ashburner, S. Misra, J. Roote, S. Lewis, R. Blazej, T. Davis, C. Doyle, R. Galle, R. George, N. Harris, G. Yartzell, D. Harvey, L. Hong, K. Houston, R. Hoskins, G. Johnson, C. Martin, A. Moshrefi, M. Palazzolo, M. Reese, A. Spradling, G. Tsang, K. Wan, K. Whitelaw, B. Kimmel, S. Celniker and G.M. Rubin. A contiguous sequence of nearly 3 Mb from the genome of Drosophila melanogaster has been sequenced from a series of overlapping P1 and BAC clones. This region covers 69 chromosome polytene bands on chromosome arm 2L, including the genetically well-characterized "Adh region." A computational analysis of the sequence predicts 218 protein-coding genes, 11 tRNAs, and 17 transposable element sequences. At least 38 of the protein-coding genes are arranged in clusters of from 2 to 6 closely related genes, suggesting extensive tandem duplication. The gene density is one protein-coding gene every 13 kb; the transposable element density is one element every 171 kb. Of 73 genes in this region identified by genetic analysis, 49 have been located on the sequence; P-element insertions have been mapped to 43 genes. Ninety-five (44%) of the known and predicted genes match a Drosophila EST, and 144 (66%) have clear similarities to proteins in other organisms. Genes known to have mutant phenotypes are more likely to be represented in cDNA libraries, and far more likely to have products similar to proteins of other organisms, than are genes with no known mutant phenotype. Over 650 chromosome aberration breakpoints map to this chromosome region, and their nonrandom distribution on the genetic map reflects variation in gene spacing on the DNA. This is the first large-scale analysis of the genome of D. melanogaster at the sequence level. In addition to the direct results obtained, this analysis has allowed us to develop and test methods that will be needed to interpret the complete sequence of the genome of this species. A klasszikus megközelítés korlátai pleiotrópia, redundancia

32 osk mRNS konc. TmII eg9 + TmII el4 osk 54 E(To) TmII eg9 + + TmII el4 osk 54 Jankovics Ferenc Genetikai Interakción alapuló megközelítés

33 Rab11wt Rab11 A Rab11 mutációja az oskar RNS lokalizációs hibáját okozza Jankovics Ferenc

34 A membránfüggő RNS transzport általános modellje The role of membranes and membrane trafficking in RNA localization Robert S. Cohen Biol. Cell (2005) 97, 5–18

35 osk mRNS konc. Hoffman Gyula, Szuperák Milán stau + ; osk TmII mutáció osk TmII ; stau + +

36 Ivarsejthiányos fenotípus penetranciája Megvizsgált mutáns vonalak (600 db Maroy Péter) Szuperák Milán

37 Multiple weak hits confuse complex systems: a transcriptional regulatory network as an example. Agoston V, Csermely P, Pongor S. Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys May;71(5 Pt 1): Epub 2005 May 26. Hálózati szemlélet

38 A fordított genetikai megközelítés

39 CG9924 CG9925 CG15443 Az ivarsejtekben kifejeződő gének azonosítása gcl CG8778 Fly-FISH BDGPegyéb 502 ivarvonalban kifejeződő gén

40 Nature 451, (2008) 21 Ago1 Ago2 Ago3/ Aubergine/ Eszköz: a teljes genom szekvenálás utáni időszak jellegzetes reverz genetikai eljárása az RNSi

41 Jankovics Ferenc, Köllőd Borbála, Henn László, Bujna Ágnes, Kiss Nóra, Velkeyné Krausz Ildikó, Ugrainé Szatmári Margit, Vilmos Péter, Michael Boutros, 500 db ivarplazma RNS elleni dsRNS Injektálás optimalizálása saját készítésű kettős szálú RNS-ekkel (lehet ivarsejtben csendesíteni!) Alkalmas ivarsejt markergén kiválasztása (nosMoe-GFP), mozi optimalizálása Ivarplazma és embrionális ivarsejt RNS-ek keresése adatbázisokból, egyéb irodalomból Elsődleges, második screen

42

43

44 Embrionális ivarsejt-fenotípusok

45 Vasa Traffic jam Fasciclin III fascetto RNAi vadfascetto E07 Here Petefészek Embrió A fascetto fenotípusa lárva korban

46 A soksejtű életforma kialakulása a sztemsejtek kialakulásának köszönhető Az ivarsejtek valójában speciális sztemsejtek Az epigenetikus ivarsejtfejlődés elsődleges a preformált ivarsejtfejlődés az előbbinek egy speciális esete A Drosophila ivarplazmája kiváló modell az ivarsejtfaktorok azonosításához A Drosophila ivarplazma összeszerveződésének kulcseleme az oskar RNS lokalizációja és helyspecifikus transzlációja A genetikai analízis három módszere klasszikus és fordított genetika, genetikai interakciós rendszerek Hálózatokban való gondolkodás szükségessége

47


Letölteni ppt "Ivarsejtfejlődés Drosophila melanogasterben. Az Escherichia coli biofilm életciklusa. (1) A szabadon élő baktériumok hordozó felületre tapadnak, majd."

Hasonló előadás


Google Hirdetések