A személyre szabott orvoslás csimborasszója: egy új gén azonosítása egyetlen család kedvéért Tory Kálmán, Edgar Otto, Céline Becker, Rémi Salomon, Ahmet.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
2Gyermekegészségügyi Központ Miskolc
Advertisements

Genetikai vizsgálatok jelentősége
A terápia specialitása renális hypertoniában Prof. Dr. de Châtel Rudolf egyetemi tanár Semmelweis Egyetem ÁOK I. sz. Belgyógyászati Klinika, Budapest.
II. sz. Belgyógyászati Klinika
A legfontosabb neurogenetikai betegségek előfordulási gyakorisága
A humán genom projekt.
A universal method for automated gene mapping Peder Zipperlen, Knud Nairz, Ivo Rimann, Konrad Basler, Ernst Hafen, Michael Hengartner and Alex Hajnal Genome.
Real-Time PCR gyakorlati alkalmazások bevezetés Párosítsuk a gélfotóra felvitt mintákat a megfelelő olvadáspontú termékekkel!
Strukturális genomika Gyakorlati feladatok. SNP-k és vizsgálatuk Mi az SNP?
Mendel és a cicusok.
A Mendel-i öröklődés Falus András
GENETIKA- GÉN-ETIKA?? Falus András
Molekuláris genetika Falus András.
RADVÁNSKÝ János1, BAŤOVÁ Monika3, REŠKO Péter1, PÁLFFY Roland2
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Funkcionális emésztőszervi betegségek a családorvosi gyakorlatban
Funkcionális emésztőszervi betegségek a családorvosi gyakorlatban
Fokozott kardiovaszkuláris kockázatú betegek kezelése június Dr. Andréka Péter Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika.
A szívelégtelenség diagnózisa június Dr. Andréka Péter Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika.
A szekunder hyperparathyreosis modern szemlélete
Az anaemia szerepe és jelentősége a betegségek progressziójában
A nephrosis syndroma leggyakoribb okai ( )
Mendeli genetika Allél Monohibrid -Dihibrid Autoszóma – alloszóma
Készítette:Kottlár Dóra
Immunrendszer Betegségei.
Ivari kromoszómás jellegek és humángenetika
A cukorbetegség: világszerte növekvő járvány
Béres J, Vas Sz, Kalmár L, Sényi K, Andrikovics H, Tordai A
Neonatológia, rehabilitáció
Dr. Bárdi Edit DEOEC Gyermekklinika, Haematológiai-Onkológiai Osztály
Az öröklődés - Dedičnosť
Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata
A herediter sensorimotoros neuropathiák (HSMN) – Charcot-Marie-Tooth betegségek (CMT) genetikai háttere Karcagi Veronika FJ Országos Közegészségügyi Központ.
Leigh syndroma A biokémiai vizsgálat irányadó!!!
CPEO differenciáldiagnózisa. Diagnosztikai lépések Encephalo (myo) pathiák ar/admaternális öröklôdés mtDNA génanalízis vagy ? standard vizsgálatokdirekt.
Arabidopsis thaliana tip120 inszerciós mutáns jellemzése
Az ember egyszerű mendeli genetikája
A genetika (örökléstan) tárgya
A mennyiségi jellegeket génkölcsönhatások okozzák
NEPHROLOGIAI KÉPZÉS – CSALÁDORVOS REZIDENSEK SZÁMÁRA
Modern Orvostudományi Technológiák a Semmelweis Egyetemen Terápiás modul Molekuláris medicina Balla András, Erdélyi László, Hunyady László Élettani Intézet.
Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika
Kognitív funkciók genetikai alapjai A genetikai variáció forrásai és vizsgálati lehetőségei Réthelyi János Semmelweis Egyetem, Pszichiátriai és Pszichoterápiás.
Pajzsmirigybetegségek hatása a és csontanyagcserére
ANYAGCSERE CSONTBETEGSÉGEK 2003 SE ÁOK I. Belklinika.
ANYAGCSERE CSONTBETEGSÉGEK Semmelweis Egyetem I. Belklinika.
A P elemek mobilitásának szabályozása
A P elem technikák: enhanszerek és szupresszorok azonosítása
Az egyedfejlődés második rész.
A molekuláris evolúció neutrális elmélete
A genom variabilitás orvosi jelentősége Gabor T. Marth, D.Sc. Department of Biology, Boston College Orvosi Genomika kurzus – Debrecen, Hungary,
Gének, környezet, viselkedés
Cystás vesebetegségek diagnosztikája a genetika tükrében
Álomkórtól az APOL1 nephropathiáig Dr. Tory Kálmán egyetemi adjunktus Semmelweis Egyetem I. sz. Gyermekgyógyászati Klinika, Budapest.
Bödör Csaba MTA-SE Lendület Molekuláris Onkohematológia Kutatócsoport, I. sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet, Semmelweis Egyetem Személyre szabott.
Szimmetriák szerepe a szilárdtestfizikában
Kauzális modellek Randall Munroe.
2.1Jelátalakítás - kódolás
Az úttervezési előírások változásai
Profitmaximalizálás  = TR – TC
A járműfenntartás valószínűségi alapjai
Szerkezetek Dinamikája
BMEGEENATMH Hőátadás.
Csáfordi, Zsolt – Kiss, Károly Miklós – Lengyel, Balázs
Minőségi és mennyiségi jellegek öröklődése
FOGALMAK DNSasfehérje (szabályozó/szerkezeti)
A Fabry terápia fejlődése
A nem meghatározása.
Előadás másolata:

A személyre szabott orvoslás csimborasszója: egy új gén azonosítása egyetlen család kedvéért Tory Kálmán, Edgar Otto, Céline Becker, Rémi Salomon, Ahmet Nayir, Friedhelm Hildebrandt, Corinne Antignac, Sophie Saunier Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika Inserm U983, Hôpital Necker, Paris

A gyermekgyógyászat sajátosságai A személyre szabott terápia ritka. Számos (~3000) mendeli öröklésmenetű betegség génje (és patomechanizmusa) nem ismert. A gén azonosításával a patomechanizmust is megismerhetjük : a kettő kapcsolata itt egyértelmű (ez nem polimorfizmus!)

Nephronophthisis Krónikus tubulointerstitialis nephropathia Autoszómális recesszív, komplett penetrancia Rendszerint az első két évtizedben vezet veseelégtelenséghez A gyermekkori krónikus veseelégtelenség 6-10%-áért felelős (!)

A nephronophthisis genetikailag igen heterogén – az esetek ~40%-ában még nem ismert a mutáns gén NPHP1 – 40% NPHP2 NPHP5 NPHP4 NPHP3 NPHP8 NPHP6

Cél: új nephronophthisis-gén identifikálása

Family 161 0,006% = 200kb

Results of Affymetrix 50k xba chip array

Chr8 (144Mb) Lod score: 3,6 76.6Mb 1 gén (HNF4G), nincs mutáció 2 gén, nincs mutáció 10Mb 2 gén, nincs mutáció 76.6Mb Lod score: 1,9+ 1 mikroszatellita marker homozigóta 6 gén, nincs mutáció az első kettőben 102Mb Lod score: 3,7 3 gén, nincs mutáció 102Mb

Chr8 (144Mb) Lod score: 3,6 76.6Mb 1 gén (HNF4G), nincs mutáció 2 gén, nincs mutáció 10Mb 2 gén, nincs mutáció 76.6Mb Lod score: 1,9+ 1 mikroszatellita marker homozigóta 6 gén, nincs mutáció az első kettőben de végül mutáció a harmadikban!: MKS3 102Mb Lod score: 3,7 3 gén, nincs mutáció 102Mb

A megtalált mutáció édesapa: c.2431 G>A, het édesanya: c.2431 G>A, het első érintett gyermek: c.2431 G>A, hom második érintett gyermek: c.2431 G>A, hom harmadik érintett gyermek: c.2431 G>A, hom kontroll

c.2431G>A - Mutáció vagy SNP? Nukleotid Fehérje Kontroll Polyphen SIFT evolúciós konz. c.2431G>A, hom p.G811S 0/147 török, 0/188 más nemzetiségű kontroll 1,72 (possibly damaging) nem tolerált (C. elegans)

Az NPHP11 (MKS3) mutációjának frekvenciája nephronophthisis + májfibrosis: 5/62 (8%) nephronophthisis májfibrosis nélkül: 0/105

Változatos pleiotropia – MKS3 Idegrendszer Vese Máj Egyéb Szindróma Smith et al., Nat Genet, 2006 Meckel-Gruber szindróma

Változatos pleiotropia – MKS3 Idegrendszer Vese Máj Egyéb Szindróma Smith et al., Nat Genet, 2006 Meckel-Gruber szindróma Baala et al, Am J Hum Genet, 2007 Joubert szindróma

Változatos pleiotropia – MKS3 Idegrendszer Vese Máj Egyéb Szindróma Smith et al., Nat Genet, 2006 Meckel-Gruber szindróma Baala et al, Am J Hum Genet, 2007 Joubert szindróma Brancati et al., Hum Mutat, 2008 COACH szindróma

Változatos pleiotropia – MKS3 Idegrendszer Vese Máj Egyéb Szindróma Smith et al., Nat Genet, 2006 Meckel-Gruber szindróma Baala et al, Am J Hum Genet, 2007 Joubert szindróma Brancati et al., Hum Mutat, 2008 COACH szindróma Otto et al., J Med Genet, 2009 - Boichis betegség

Különböző típusú mutációk a különböző kórképekben mindkét allél funkcióvesztett a két allél legalább egyike hypomorph mindkét allél hypomorph

A kódolt fehérje, a meckelin Smith et al., Nat Genet, 2006

Összefoglalás Azonosítottuk a 11. nephronophthisis gént. A kódolt fehérje, a meckelin egy csillófehérjét kódol. Különböző súlyosságú mutációi más-más kórképhez vezetnek. Az exom-szekvenálás révén fel fog gyorsulni az új gének azonosítása mendeli kórképekben.

Köszönöm Inserm U983, Necker Corinne Antignac Sophie Saunier Rémi Salomon Marie-Claire Gubler Tiphanie Lacoste Olivier Gribouval Audrey Pawtowski Vincent Morinière Marion Delous Flora Silbermann

Az MKS3 allélok és a fenotípus közötti kapcsolat vad típus hypomorph funkcióvesztett MKS3 allél

Közös fenotípus – különböző gének AHI1 PKD1 BBS9 Közös gén – különböző fenotípusok INVS NEK8 ARL6 DPP3 BBS4 BBS5 BBS6 BBS7 GLIS2 BBS10 BBS12 BBS13 IQCB1 NPHP1 PKHD1 NPHP3 NPHP4 CEP290 ARL13B INPP5E CC2D2A TRIM32 TMEM216 TTC8 RPGRIP1l TMEM67

Nincs Joubert-szindrómára utaló örlőfog-jel a vizsgált betegben pozitív kontroll F161-nincs őrlőfog-jel

A pozícionális klónozás 50% 25% 12.5% x 12.5% = 1,5% A gén-vadászat módszere a pozícionális klónozás volt. A pozícionáls klónozás recesszív betegségekben döntően vérrokon családok analízisén alapszik. Vérrokon családokban feltételezzük, hogy a gyermek azért szenved egy recesszív betegségben, mert a szülei rokonok, és hordoznak egy közös őstől örökölt mutációt. A beteg gyermek tehát ugyanazt a mutációt örökli két oldalról. A mutáció és az azt körülvevő génszakasz, allél ezért ugyanaz lesz, tehát a gyermek ezen a szakaszon homozigóta lesz. A pozícionális klónozás abból indul ki, hogy a mutáció olyan területen kell elhelyezkedjen, ahol az apai és anyai allél ugyanaz, tehát, ahol a gyermek homozigóta minden polmorfizmusra. A pozícionális klónozás annál effektívebb, minél kisebb ez a terület. Példaképpen nézzük meg, hogy ebben a beteg gyermekben statisztikailag mekkora terület lesz homozigóta egy dédapai allélra. 0,9% = 26Mb

Az esetek felében változatos extra-renális tünetek társulnak a nephronohthisishez Joubert szindróma – 15% Csont – 6% Izolált nephronophthisis – 53% Máj – 8% Finalement, d'autres symptômes extra-renaux comme la surdité, l'apraxie oculomotrice de type Cogan ou autres symptômes neurologiques sont décrits dans 4% des cas. Il faut noter que cette classification est très artificielle, et différente association de ces symptômes extra-renaux, et leur variable sévérité aboutit à une hétérogénéité clinique encore plus complexe. Retinopathia (Senior-Løken szindróma) – 14% Egyéb – 4%

Hogyan magyarázható a nephronophthisis kifejezett fenotípus-variabilitása genetikailag? Genetikai heterogenitás A mutáció típusa Második-locus mutációk/polimorfizmusok

A cisztás vesebetegségek genetikai heterogenitásának és a fenotípusok divergenciájának köszönhetően a genotípus-fenotípus korreláció nem kézenfekvő! Genes PKHD1 PKD1 PKD2 NPHP1 INVS NPHP3 NPHP4 IQCB1 CEP290 GLIS2 RPGRIP1l NEK8 MKS3 BBS1 BBS2 INP55E Clinical diagnoses Neonatal polycystic kidney disease Juvenile/adolescent nephronophthisis Infantile nephronophthisis Senior-Loken syndrome Joubert syndrome Meckel Gruber syndrome Bardet-Biedl syndrome Genes ARL6 BBS4 BBS5 MKKS BBS7 TTC8 B1 BBS10 TRIM32 BBS12 BBS13 AHI1 TMEM216 CC2D2A ARL13B