KÓRHÁZI ACINETOBACTER BAUMANNII TÖRZSEK JELLEMZÉSE

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
„az emberek hazudnak, de a bizonyítékok nem”
Advertisements

A projekt eredményei, előnyök, változások (3) Dr. Kajdi FerencDr. Martin Polovka Dr. Schmidt RezsőGyőri Tibor Schiller OttíliaTeschner-Kovács Zsófia Dr.
dr. BALLA TÜNDE, dr. BORSICS KÁLMÁN
Hypertoniás sóoldat inhalációjának hatásossága RSV bronchiolitisben
KŐVIRÁG 6.
Bakteriális genom térképezés Készítette: Mlinarics Edina IV. Biológus Bioinformatika SZIT.
Real-Time PCR gyakorlati alkalmazások bevezetés Párosítsuk a gélfotóra felvitt mintákat a megfelelő olvadáspontú termékekkel!
Strukturális genomika Gyakorlati feladatok. SNP-k és vizsgálatuk Mi az SNP?
Ozsváth Károly TF Kommunikációs-Informatikai és Oktatástechnológiai Tanszék.
Molekuláris genetika Falus András.
A PMP22 gén mutációs analízise
Az ipari növekedés mai területi folyamatai
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
Buccalis kenet a connexin-26 gén 35delG mutációjának non-invazív szűrésére kisgyermekeken Torkos Attila 1,2, Magnus Teschner 2, Peter Erfurt 2, Gerrit.
2009. november 26. Transzgének expressziós profiljának felvétele Transzgének expressziós profiljának felvétele Kukoricabogár- és herbicid-rezisztens növények.
Géntechnikák Labor FÁG DISPLAY
DNS amplifikáció pl . DNS szekvenálásnál nagy jelentősége van
Drogok fejlesztésének lépései: preklinikai, és I, II, III, IV fázisok
Falvai Judit, Lichtenberger György, Süveges Kinga, Szűcs Erika:
Szüle Endre Dr. Pest megyei Flór Ferenc Kórház, Urológiai Osztály
A baktériumok törzse.
Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata
A herediter sensorimotoros neuropathiák (HSMN) – Charcot-Marie-Tooth betegségek (CMT) genetikai háttere Karcagi Veronika FJ Országos Közegészségügyi Központ.
Mindig az a drága, ami többe kerül? Kis Zoltán Balassa János Kórház.
Kalamár-Birinyi Edit Kórházhigiénés Osztály
UROINFECTIO HÚGYúTI FERTŐZÉSEK.
Phytophthora fajok hatása az erdei fák egészségi állapotára Nyugat-Magyarországi Egyetem Erdőmérnöki Kar Erdő- és Faanyagvédelmi Intézet.
1, GÉNKÖNYVTÁRAK ALKALMAZÁSA
IN VITRO MUTAGENEZIS Buday László.
Az App jelentősége ma Dr. Sárközi Rita SZIE-ÁOTK, Járványtani és Mikrobiológiai Tanszék Budapest, november 22.
1 kissi_DNN_2011 CAxP Orsz.Vizsg_ Kalcium-foszfát ásványianyagcsere és kezelésének jelenlegi hazai helyzete dializáltakban CAXP-HU_NMSZG-MANET_1/2010.
Infekciókontroll a rehabilitációs ellátás során
Az antibiotikum használattal összefüggő Cl
A magyarországi infekciókontrollról
Ápolói teljesítmény és terhelés összehasonlító vizsgálata avagy: Miért is vagyunk leterheltek? Pap-Szekeres Anita Magyar Kórházszövetség XXVII.
Összehasonlító környezet- mikrobiológiai vizsgálatok a Böddi-szék vizében egy alga tömegprodukció idején Czeibert Katalin Témavezető: Dr. Borsodi Andrea.
Escherichia coli baktérium
Extranodalis non Hodgkin malignus lymphomák Valasinyószki Erika 1, Erős Melinda 1, Hamvas József 2, Dombi Péter 1 Szent Borbála Kórház Onko-haematologia.
Molekuláris klónozás a gyakorlatban. CRISPR/Cas rendszerek Adaptív bakteriális immunitás Idegen nukleinsavak ellen ( pl. vírusok) Ezek integrálása a genomba,
Rezisztencia helyzet változása, új szempontok, új antibiotikumok Dr. Szabó Judit egyetemi docens Debreceni Egyetem KK. Orvosi Mikrobiológiai Intézet, Debrecen.
A levegőfertőtlenítés jelentősége Uzsoki Utcai Kórház Tüdőbelgyógyászati osztály.
Centralizáció és specializáció az Onkológiai sebészetben
Dr. Oroszi Beatrix Főosztályvezető
Hazai kórházi-járványügyi helyzetkép: adatok és aktualitások
FLAVOBACTERIUM OKOZTA MEGBETEGEDÉS HAZAI HALFAJOKBAN
Az első észleléstől az intenzív osztályig Diagnosztikus lehetőségek
MAGYARORSZÁGI STREPTOCOCCUS PYOGENES TÖRZSEK VIRULENCIÁJÁNAK ÉS GENETIKAI ROKONSÁGÁNAK VIZSGÁLATA KRUCSÓ BARBARA1, DR GACS MÁRIA2, DR LIBISCH BALÁZS2,,
Johan Béla Országos Epidemiológiai Központ
A településhierarchia és a településhálózat
NYME Savaria Egyetemi Központ, Vas Megyei Markusovszky Kórház
Polimeráz Láncreakció:PCR, DNS ujjlenyomat
KÓRHÁZI JÁRVÁNYBÓL SZÁRMAZÓ ACINETOBACTER BAUMANNII
Perinatalis Intenzív Centrumokból származó ESBL-termelő Klebsiella törzsek komplex epidemiológiai tipizálása Damjanova, I., Tóth, Á., Pászti, J., Jakab,
Fágtípusok, antibiotikum rezisztenciák és az 1-es típusú integronok jelenléte ban izolált humán eredetű, nem-typhoid Salmonella törzsek esetében.
Dr. Füzi Miklós1, Prof. Dr. Ludwig Endre2, Prof. Dr.Szabó Dóra1
Géntechnikák labor kiselőadás Készítette: Nagy Zsuzsanna
Molekuláris biológiai módszerek
Brachmann Krisztina Országos Epidemiológiai Központ
PNEUMOCOCCUS MENINGITIS
Új molekuláris biológiai módszerek
Az invazív meningococcus-betegség járványügyi helyzete Magyarországon,
A regisztrált bűncselekmények száma Komárom-Esztergom megyében, 2009
Virológiai detektívmunka: a kanyaró nyomában (Morbilli – in flagranti)
Új molekuláris biológiai módszerek
ASPERGILLUS FLAVUS ÉS FUSARIUM SPP. ELŐFORDULÁSA HAZAI KERESKEDELMI FORGALOMBAN KAPHATÓ FŰSZERPAPRIKA MINTÁKBAN Készítette: Lehotkai Péter
PEST MEGYE BŰNÜGYI HELYZETE 2012
Készítette: Koleszár Gábor
Az első észleléstől az intenzív osztályig Diagnosztikus lehetőségek
GYAKORLATI ÚTMUTATÓ A TESZTELÉS FOLYAMATA
Dr. Szabó Bálint Gergely Infektológus szakorvosjelölt
Előadás másolata:

KÓRHÁZI ACINETOBACTER BAUMANNII TÖRZSEK JELLEMZÉSE Krucsó Barbara, Pászti Judit,   Országos Epidemiológiai Központ 2005.

Az Acinetobacter baumannii néhány jellemzője fakultatív patogén baktérium, leggyakrabban intenzív terápiás osztályokon hospitalizált betegek infekciója során kap jelentőséget, a következő nozokomiális infekciók kialakításáért felelős: bacteraemia, húgyúti infekciók, másodlagos meningitis, pneumonia, egy magyarországi felmérés alapján intenzív osztályokon a környezeti mintákban előforduló második leggyakoribb kórokozó, a törzsekre magasfokú rezisztencia jellemző

Mi is lenne tipizálásunk célja : epidemiológiai oknyomozás: mi a terjedés módja és forrása Munkánk során 9 különböző forrásból származó 109 izolátum vizsgálatát végeztük el , melyek kórházi környezetből, nozokomiális megbetegedésekből származtak. járvány (2 vagy több összefüggő eset) során izolált törzsek járványügyileg összefüggőeknek tekinthetőek-e; az epidemiológiai vizsgálat során vett higiénés mintákból izolált törzsek megegyeznek-e a betegekből származó törzsekkel; a járványt követő időszakban izolált törzsek megegyeznek-e a járvány törzzsel; a különböző tipizálási módszerek összehasonlítása

A vizsgált Acinetobacter baumannii törzsek megoszlása minta forrás szerint

Milyen tipizálási módszert válasszunk? -a tipizálhatóság nem 100%-os -a fágok és antiszérumok széleskörben nem hozzáférhetőek -jelenleg nem vagy csak kevés helyen alkalmazzák -járvány esetén a törzsek gyors elkülönítésére szolgál szero- és fágtipizálás biokémia, antibiotikum érzékenységi vizsgálat plazmidprofil analízis, protein profil analízis, PCR-különböző primerekkel (REP, AP, ERIC, DAF4) PFGE-különböző restrikciós enzimekkel(ApaI, SmaI) AFLP, ribotipizálás -jelenleg ritkán vagy nem alkalmazzák -jó reprodukálhatóság, tipizálhatóság -viszont pénz, esetenként időigényesek

A. baumannii törzsek ERIC PCR mintázata (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus PCR) Nem ismert szekvenciák amplifikációján alapul. Az eltérő mintázatokat típusokba (pl.:A, B, C), és altípusokba soroltuk (pl.:A1, A2). A típusok elkülönítése a kapott termékek száma, és elhelyezkedése alapján történt. 2 csík különbség már új típust jelent. bp bp 2645 1605 1198 676 517 676 460 396 350 517

ERIC PCR vizsgálatok eredményei és azok megoszlása mintaforrás szerint

A.baumannii törzsek PFGE (pulzáltatott-mezejű gélelektroforézis) mintázata M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 M Kromoszómális DNS emésztése ApaI restrikciós enzimmel. A törzsek további diszkriminálását teszi lehetővé. Acinetobacter baumannii esetén ApaI enzimmel ~15-20 fragmentet kapunk. kb B D 436,5 388 339,5 291 242,5 194 145,5 97 48,5

….és a gél alapján készített családfa A típusok, altípusok elkülönítése a fragmentek száma és elhelyezkedése alapján történt. Egy PFGE típust alkotnak azok a törzsek, melyek 80%-nál nagyobb genetikai hasonlóságot mutatnak.

Acinetobacter PFGE vizsgálat eredménye, a B és D típus izolálása Magyarországon Komárom-Esztergom megye hemokultura 2004 Pest megye járvány: vér, liquor, orr, torok,seb, genny környezeti minták 2002-2003 Hajdú-Bihar megye környezeti minták: textília, levegő orr, torok 2002        Heves megye halmozódás: vér, liquor 2002 -B típus -D típus

Összefoglalás Mind a B, mind a D pulzótípusú A. baumannii klón előfordult a beteganyagból és a környezeti szűrés során izolált törzsek között is. Molekuláris epidemiológiai módszerek alkalmazásával igazoltuk 2002-2004 között genetikailag rokon Acinetobacter baumannii törzsek előfordulását. Munkánk felhívja a figyelmet un. ’virulensebb’ klónok perzisztálására, és a kórházi higiéné fokozott betartására.