Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport

Hasonló előadás


Az előadások a következő témára: "Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport"— Előadás másolata:

1 Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport http://ramet.elte.hu/~viktor

2 Mire megyünk labor nélkül? + = ? Modellezés matematikai modell számítógépes szimuláció Adatelemzés

3 Molekuláktól az emberig Molekuláris folyamatok Szervezeten belüli folyamatok Populációs szintű folyamatok

4 A HIV eredete(i) Több független átugrás 4 sikeres csoport:  HIV-1 M és O csoportja  HIV-2 A és B csoportja Több sikertelen csoport

5 Járványos törzsek: szűk időablak Az összes sikeres HIV-csoport a 20. század első felében ugrott át emberre. HIV-csoportUtolsó közös ősReferences HIV-1 group M 1920 (1902-39) 1937 (1925-49) Salemi et al. (2000) 1931 (1915-41) Korber et al. (2000) 1921 (1908-33) 1902 (1873-1922) 1908 (1884-1924) Worobey et al. (2008) HIV-1 group O 1920 (1890-1940) Lemey et al. (2004) 1905 (1866-1938) Wertheim & Worobey (2009) HIV-1 group N1963 (1948-77) Wertheim & Worobey (2009) HIV-2 group A 1940 (1924-56) Lemey et al. (2003) 1932 (1906-55) Wertheim & Worobey (2009) HIV-2 group B 1945 (1931-59) Lemey et al. (2003) 1935 (1907-61) Wertheim & Worobey (2009)

6 Az időzítés problémája Előbb miért nem? „Bushmeat” vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta Forrás: Nature 455, 605. Urbanizáció, megnövekedett mobilitás stb.

7 Az időzítés problémája Előbb miért nem? „Bushmeat” vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta Forrás: Nature 455, 605. Urbanizáció, megnövekedett mobilitás stb. Később miért nem?

8 Hipotézis A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló Akut fertőzés Körülmetélés Genitális fekélyt okozó fertőzések - Genital ulcer disease (GUD) Ugyanezek a tényezők lehettek fontosak a HIV járvány indulásakor. A HIV-járvány epicentrumai különösen kedvező feltételeket kínáltak a heteroszexuális terjedésnek.

9 Szimuláció: a HIV korai terjedése Milyen tényezők segíthették a HIV- járvány elindulását? Egyed alapú modell Szexuális háló Sztochasztikus folyamatok

10 Esettanulmány: Kinshasa A HIV-1 M világjárvány epicentruma Adatgyűjtés Tudományos irodalom (orvosi, virológiai, etnográfiai stb.) Eredeti levéltári kutatás

11 Esettanulmány: Kinshasa

12 Szimulációs modell: paraméterek A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) Genitális fekélyek (GUD) Akut fertőzés Körülmetélés Kezdetben alacsony hatékonyság

13 Szimulációs modell: szexuális háló Stabil linkek Rövid távú linkek CSW linkek részletes paraméterek

14 Szimulációs modell: a HIV terjedése 1. HÉT

15 Szimulációs modell: a HIV terjedése 2. HÉT

16 Szimulációs modell: a HIV terjedése 3. HÉT

17 Eredmények: történeti szcenáriók 1919-ben és 1929-ben különösen kedveztek a feltételek a HIV terjedésének. 1000 futtatás minden szcenárióra

18 Eredmények: mely tényezők voltak fontosak? A GUD-prevalencia volt messze a legerősebb tényező.

19 Következtetések A HIV-járvány elindulásában kulcsszerepe lehetett a gyarmati központokban kialakult GUD-járványoknak. Az „időablakot” valószínűleg a GUD-járványok visszaszorítására indított kezelési kampányok zárták be a 30-as évek közepén. A körülmetélés és a populációméret/szerkezet valószínűleg a GUD-gyakoriságon keresztül közvetett hatást fejtett ki. A nemi fekélyt okozó betegségek kontrollja kulcsfontosságú újabb HIV-törzsek kialakulásának megakadályozásában.

20

21 Köszönetnyilvánítás Funding: João Dinis de Sousa Philippe Lemey Anne-Mieke Vandamme


Letölteni ppt "Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport"

Hasonló előadás


Google Hirdetések