1. 2 MICROTESTER ÚJ TECHNIKA A MIKROBIOLÓGIÁBAN Dr. Reichart Olivér Dr. Szakmár Katalin Budapest, 2012. február 15. A redox-potenciál mérésen alapuló.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Adatelemzés számítógéppel
Advertisements

Triclops HW-SW rendszer - 3D felület modellezés Patkó Tamás - Hexium Kft. Radványi András - MTA SzTAKI.
Élősejtszám meghatározás
Programcsomag fejlesztése "multiplex microbead assay" eredmények kiértékelésére •Soft Flow Hungary Kft. •7628 Pécs, Kedves u. 24 Lustyik György
1. 2 A MICROTESTER GYAKORLATI ALKALMAZÁSA Dr. Szakmár Katalin Budapest, február 15.
Az ötlettől a projekttervig
Dinamikus állománymérési módszerek fejlesztése
Hogyan működik az elektronikus nyelv
REDOX-POTENCIÁL MÉRÉSEN ALAPULÓ GYORS MIKROBIOLÓGIAI MÓDSZER
Áramlástan mérés beszámoló előadás
Biológiai monitoring és mintavétel
2012. április 26. Dülk Ivor - (I. évf. PhD hallgató)
Áramlástan mérés beszámoló előadás
Antibiotikumok kimutatása a talajból
Bevezetés a gépi tanulásba február 16.. Mesterséges Intelligencia „A számítógépes tudományok egy ága, amely az intelligens viselkedés automatizálásával.
KOMETABOLIZMUS. A fogalom tisztázása Régóta ismert tény, hogy a mikroorganizmusok képesek átalakítani szerves vegyületeket, de a termék felhalmozódik.
Mindenki az egyenes illesztést erőlteti. Kell olyan ábra ahol 1 ismeretlen pont van Kell olyan ábra ami a görbék párhuzamos lefutását mutatja Kell olyan.
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VII.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Mintavétel Mintavétel célja: következtetést levonni a –sokaságra vonatkozóan Mintavétel.
HACCP-előírások, alapvető higiéniai követelmények a vendéglátó üzletekben. Szoboszlai Gyula.
Redoxi-reakciók, elektrokémia Vizes elektrolitok
Előadó: Prof. Dr. Besenyei Lajos
Adatgyűjtés, mérési alapok, a környezetgazdálkodás fontosabb műszerei
Az elemek lehetséges oxidációs számai
2009. november 26. Transzgének expressziós profiljának felvétele Transzgének expressziós profiljának felvétele Kukoricabogár- és herbicid-rezisztens növények.
Élelmiszeranalitika előadás
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban folytatás...
Egy folyékony mintában valamilyen baktérium koncentrációját szélesztést követően agarlemezes telepszámlálással határozzuk meg. Tízes alapú hígítási sort.
STATISZTIKA II. 3. Előadás Dr. Balogh Péter egyetemi adjunktus Gazdaságelemzési és Statisztikai Tanszék.
MEGÚJULÓ ENERGIAFORRÁSOK BIOMASSZA
Az anaerob rothasztók ellenőrzése és biokémiai jellemzése
Élősejtszám meghatározás
Gyors mikrobiológiai módszerek
Limulus-test A név egy alsóbbrendű tengeri rák latin nevéből ered; Limulus polyphemus. A Limulus-test segítségével a Gram-negatív baktériumok által termelt.
Animált bemutató, ajánlott bekapcsolni a diavetítést (pl. az F5-öt megnyomni) Utána szóközzel v. PageUp PageDown gombokkal léptetni.
ALKALMAZÁSOK ÉS LEHETŐSÉGEK Dr. Fekete András egyetemi tanár BCE Élelmiszertudomány Kar Fizika-Automatika Tanszék.
Javaslatok további alkalmazásokra Szöllősi Dániel PhD hallgató.
Gyümölcslevek, ásványvíz, üdítők, tejtermékek
ELŐNYÖK ÉS LIMITÁCIÓK MOLEKULÁRIS MIKROBIOLÓGIAI VIZSGÁLATI MÓDSZEREK ALKALMAZHATÓSÁGA A BIOREMEDIÁCIÓBAN Balázs Margit.
Szerves talajszennyező anyagok fázisok közötti megoszlása és biológiai hozzáférhetősége Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Mezőgazdasági Kémiai.
Talajsterilezés Herman Edit. Sterilitás definíciója Külső behatás következtében kialakuló olyan állapot, amiben a vizsgált terület teljesen mikroba-mentes.
FDA hidrolízis aktivitási teszt
ATP (Adenozin-trifoszfát) meghatározása talajban - kénsavas, foszfátos extrakciós eljárással Tóth Anna Szilvia.
OECD GUIDELINE FOR THE TESTING OF CHEMICALS Soil Microorganisms: Carbon Transformation Test OECD ÚTMUTATÓ VEGYI ANYAGOK TESZTELÉSÉRE Talaj Mikroorganizmusok:
Makai M.: Transzport51 A koordinátázás kérdése Ha a világban meg kell adni egy helyet: fizikai koordináták (x,y,z) (origó és egység) postai címzés pl.
Dinamikus állománymérési módszerek
Két kvantitatív változó kapcsolatának vizsgálata
Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Mintavételes Eljárások.
Dr. Takács Attila – BME Geotechnikai Tanszék
TEROTECHNOLÓGIA Az állóeszközök újratermelési folyamata.
A számítógépes elemzés alapjai
Hága Péter ELTE, Komplex Rendszerek Fizikája Tanszék Statisztikus Fizikai Nap Budapest.
A cél-meghatározási, projektdefiniálási fázis Készítette: Szentirmai Róbert (minden jog fenntartva)
Potenciometria Elektroanalitika fogalma, Potenciometria fogalma, mérőcella felépítése, mérő- és összehasonlító elektródok, Közvetlen és közvetett potenciometria.
Környezetvédelmi analitika
Enzimkinetika Komplex biolabor
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Az ötlettől a projekttervig
Mikrobák mennyiségi meghatározása
Szervetlen vegyületek
Proteomika, avagy a fehérjék „játéka”
Filep Ádám, Dr. Mertinger Valéria
Scale-up kevert és levegőztetett bioreaktorokra Esettanulmány
Munkagazdaságtani feladatok
Méréstechnika 15. ML osztály részére 2017.
A évi kompetenciamérés FIT-jelentéseinek új elemei
Munkagazdaságtani feladatok 3
Áramlástan mérés beszámoló előadás
Áramlástan mérés beszámoló előadás
Antibiotikumok kimutatása a talajból
Előadás másolata:

1

2 MICROTESTER ÚJ TECHNIKA A MIKROBIOLÓGIÁBAN Dr. Reichart Olivér Dr. Szakmár Katalin Budapest, február 15. A redox-potenciál mérésen alapuló gyors vizsgálati módszer elméleti háttere

3 Probléma: Klasszikus tenyésztéses módszerek időigénye nagy (1 -3 nap). A nagy időigény miatt az eredmények nem csatolhatók vissza a technológiába.Cél: Durva mikrobiológiai problémák gyors kiszűrése Gyors tételminősítés Átmeneti tárolási idő csökkentéseMegoldás: Gyors mikrobiológiai vizsgálati módszerek MIKROBIOLÓGIAI MINŐSÉG-ELLENŐRZÉS PROBLÉMÁI

4 Élő és holt sejtek együttes számának meghatározása: Direkt számlálás (csak tiszta folyadékban alkalmazható) Számlálókamra Flow cytometer Turbiditásmérés (csak tiszta folyadékban alkalmazható) ATP mérés (mikrobiális és élelmiszer eredetű ATP elkülönítése nehéz) Élősejtszám meghatározása: Impedancia mérésen alapuló módszerek Malthus Rabit Bactrac Redox-potenciál mérése GYORS MÉRÉSI MÓDSZEREK

A BCE ÉTK Fizika- és Automatizálás Tanszék és a SZIE ÁOTK Élelmiszer-higiéniai Tanszék kutatói által kifejlesztett és szabadalmaztatott eljárás.MicroTester REDOXPOTENCIÁL MÉRÉSEN ALAPULÓ VIZSGÁLATI MÓDSZER

Gyors módszer, különösen nagy mikroba-számú minták esetében. Egyszerű mérési technika. Szabványos táptalajok használhatók. A redox-görbe alakjából következtetni lehet a mikroba- csoportra. Nagyon széles ( ) sejtszám-tartományban hígítás nélkül alkalmazható. Különösen célszerű membrán-szűréses módszer kiértékelésére. MIT TUD A MICROTESTER?

7 Direkt mérés: Szaporodás közvetlen detektálása a táptalaj redox- potenciál változása alapján Indirekt mérés: Szaporodás detektálása a CO 2 termelés alapján A MICROTESTER ALKALMAZÁSI LEHETŐSÉGEI

Elméleti alapok: A szaporodás energiaforrása a biológiai oxidáció, ami a környezetben redukciót eredményez. Biológiai rendszerekre jellemző általános redox reakció: [Oxidant] + [H + ] + n e - [Reductant] Nernst egyenlet: DIREKT MÉRÉS

9 A REDOX-POTENCIÁL VÁLTOZÁSÁVAL A SZAPORODÁS NYOMON KÖVETHETŐ

10 KÜLÖNBÖZŐ BAKTÉRIUMOK REDOX-GÖRBÉI

11 MICROTESTER MÉRŐBERENDEZÉS (16 csatorna)

12 MICROTESTER MÉRŐCELLÁK direkt mérőcellakémcső cella indirekt mérőcella

Lemezöntés, szélesztés Látható telepek kialakulása –Különálló (feltételezetten 1 telepképző egységből kiinduló), kb – 10 7 sejtből álló populáció. Határhígítás (MPN) Látható zavarosodás kialakulása, steril csövek jelenléte. –Néhány (max. 10) sejtből kb sejt/ml sűrűségű populáció. A SZAPORODÁS DETEKTÁLÁSA TENYÉSZTÉSES MÓDSZEREKNÉL

A redox-potenciál változásának sebessége haladja meg az előírt kritikus értéket. Detektációs kritérium:Detektációs kritérium: pl: |dE/dt|> 0,5 mV/min Mikroorganizmustól és tápoldattól függően 0,4 – 1,0 mV/min közötti érték. A SZAPORODÁS DETEKTÁLÁSA REDOX-POTENCIÁL MÉRÉSNÉL

15 A REDOX-GÖRBE JELLEMZŐ PARAMÉTEREI

MICROTESTER DETEKTÁCIÓS KRITÉRIUMOKHOZ TARTOZÓ MIKROBASZÁMOK

Detektációs idő (Time To Detection, TTD): Detektációs idő (Time To Detection, TTD): a detektációs kritérium eléréséig szükséges idő. Lemezöntés, szélesztés Látható telepek kialakulása (10 6 –10 7 sejt) 1 sejtből indulva Független a kiinduló mikrobaszámtól. Határhígítás (MPN) Látható zavarosodás kialakulása ( sejt/ml) 1-10 sejtből indulva Független a kiinduló mikrobaszámtól. TENYÉSZTÉSES MÓDSZEREKHEZ TARTOZÓ DETEKTÁCIÓS IDŐK

10 6 –10 7 sejt/ml koncentráció elérése az inokulumról indulva. A kiindulási sejtszám függvénye. Meghatározva a TTD és a kiindulási sejtkoncentráció közötti összefüggést, kalibrációs görbe alapján a kiindulási mikrobák száma (lgNo) TTD méréssel becsülhető. MICROTESTER DETEKTÁCIÓS IDŐK

19 A KIINDULÁSI SEJTSZÁM HATÁSA A REDOX-GÖRBÉRE

20 KALIBRÁCIÓS GÖRBE

Jelenlét/hiány próba: Minta közvetlen beoltása Nagyságrendi becslés (Titer): Hígítási sor készítése, mérés Eredmény megadása nagyságrendként MPN módszer: Hígítási sor készítése Hígításonként beoltások Kiértékelés automatikusan MÉRÉSI MÓDSZEREK KALIBRÁCIÓS GÖRBE NÉLKÜL

Kalibrációs görbe felvétele: Telepszám és TTD összefüggés meghatározása. Egyenlet betáplálása a gépbe. Mikroba (telepképző egység) szám meghatározás: Közvetlenül a mintából. Előzetesen hígított mintából. Előzetesen koncentrált (membránszűrt) mintából.Probléma: Csak akkor alkalmazható, ha a mikroflóra összetétele ismert és van kalibrációs görbénk. MÉRÉS ELŐZETESEN FELVETT (KÜLSŐ) KALIBRÁCIÓS GÖRBE ALAPJÁN

MPN módszeren alapuló kiértékelés: Hígítási sor készítése hígításonként egy, vagy több leoltással. Redox-görbék felvétele. A TTD értékek meghatározása. (Ha szükséges.) Szaporodást mutató és nem mutató hígítási szintek alapján az MPN érték meghatározása. Az MPN érték és a különböző hígítási szintekhez tartozó TTD értékek ismeretében a kalibrációs görbe felvétele. A kalibrációs görbe alapján a hasonló minták mikrobaszámának kiszámítása. MÉRÉS MINTÁBÓL FELVETT (BELSŐ) KALIBRÁCIÓS GÖRBE ALAPJÁN

24 ESCHERICHIA COLI BELSŐ KALIBRÁCIÓS GÖRBÉJÉNEK FELVÉTELE 1.

25 ESCHERICHIA COLI BELSŐ KALIBRÁCIÓS GÖRBÉJÉNEK FELVÉTELE 2.

26 ESCHERICHIA COLI BELSŐ KALIBRÁCIÓS GÖRBÉJÉNEK FELVÉTELE 3.

Elméleti alapok: A szaporodás során keletkező CO 2 -ot lúgban elnyeletjük és az oldat redox-potenciál változását mérjük. Az elnyelető oldatban a potenciál-meghatározó összefüggés: INDIREKT MÉRÉS

28 INDIREKT MÉRÉS

29 INDIREKT MÉRÉS KALIBRÁCIÓS GÖRBÉJE

30 Kísérletileg beállított koncentrációkkal az összefüggés jól reprodukálhatóan mérhető. Megfelelő koncentrációjú lúgoldat alkalmazásával a redox-potenciál változásából az elnyelt CO 2 mennyisége számítható. Alapul szolgálhat a képződő CO 2 mennyiségi meghatározásához (BOI mérés). Nagy BOI értékek esetén a predikció jelentős időmegtakarítást tesz lehetővé. INDIREKT MÉRÉS

31 BOI BECSLÉSE INDIREKT MÉRÉS ALAPJÁN

32 BOI PREDIKCIÓ REDOX-POTENCIÁL MÉRÉS ALAPJÁN

33 MICROTESTER MÉRŐBERENDEZÉS (32 csatorna)

34 MICROTESTER MÉRŐBERENDEZÉS (2 csatorna)

35 validálva akkreditálva A redox-potenciál mérésen alapuló gyors vizsgálati módszer validálva, és élelmiszeripari vizsgálatokra akkreditálva van.

36 Köszönöm a figyelmet! Budapesti Corvinus Egyetem Élelmiszertudományi Kar – Fizika-Automatika Tanszék Microtest Kft.