Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Összetett kísérleti tervek és kiértékelésük:
Advertisements

Kompetitív kizárás vagy együttélés?
Utazás a sejtben Egy átlagos emberi sejt magja megközelítőleg 510-15 gramm mennyiségű és 1,8-2 méter hosszúságú (3000 millió bázispárnyi) DNS-ből,
Sejtmag és osztódás.
Körfolyamatok (A 2. főtétel)
MOZGATÓRENDSZER SZÖVETEI
Programcsomag fejlesztése "multiplex microbead assay" eredmények kiértékelésére •Soft Flow Hungary Kft. •7628 Pécs, Kedves u. 24 Lustyik György
Összetett kísérleti tervek és kiértékelésük: Háromszempontos variancia analízis modellek.
Akvapónia üzemeltetés Aquaponics operation and maintenance
Az enzimek A kémiai reakciók mindig a szabadenergia csökkenés irányába mennek végbe. Miért nem alakul át minden anyag a számára legalacsonyabb energiájú,
Digitális Domborzat Modellek (DTM)
Térbeli niche szegregáció kétfoltos környezetben
Statisztika II. VI. Dr. Szalka Éva, Ph.D..
Differenciál számítás
KÉTÁLLÁSÚ SZABÁLYOZÁS
SPSS többváltozós (lineáris) regresszió (4. fejezet)
SPSS többváltozós regresszió
Diszkriminancia analízis
Dinamikus klaszterközelítés Átlagtér illetve párközelítés kiterjesztése N játékos egy rácson helyezkedik el (periodikus határfeltétel) szimmetriák: transzlációs,
MOZGATÓRENDSZER SZÖVETEI
Kovarianciaanalízis Tételezzük fel, hogy a kvalitatív tényező(k) hatásának azonosítása után megmaradó szóródás egy részének eredete ismert, és nem lehet,
ENZIMEK Def: katalizátorok, a reakciók (biokémiai) sebességét növelik
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VI.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Regresszióanalízis.
1 TARTALOM: 0. Kombinatorika elemei (segédeszközök) 1. Eseményalgebra 2. A valószínűség: a) axiómák és következményeik b) klasszikus (=kombinatorikus)
A mikroba szaporodás alapösszefüggései
Citokinézis Csepregi Anna. Figure 18-2 Essential Cell Biology (© Garland Science 2010) Citokinézis helye a sejtciklusban.
FERMENTÁCIÓS GYAKORLAT
FERMENTÁCIÓS RENDSZEREK MATEMATIKAI MODELLEZÉSE
BIOREAKT-MSc Gombanövekedés kinetikája (Streptomyceták hasonlóan!) Szubmerz fonalas növekedés - mint baktériumok, Monod kinetika….. Felületi kétdimenziós.
FOLYTONOS FERMENTÁCIÓ
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Egyéb fermentációs technikák
FOLYTONOS FERMENTÁCIÓ
5. „Anyagvizsgálat a Gyakorlatban – AGY5” Monor, Június Mi az anyagvizsgálat célja? Mit mérünk? Mi az anyagvizsgálat célja? Mit mérünk? – A.
4. Ismertesse az aminosavak reszolválási módszereit.(5 pont)
Mikrobapopulációk és –sejtek növekedése
Idősor elemzés Idősor : időben ekvidisztáns elemekből álló sorozat
1 Mössbauer-spektrumok illesztése: vonalalak A kibocsátott  -sugárzás energiaspektruma Lorentz-görbe alakú: I : sugárzás intenzitása  : frekvencia 
rész.
Gazdaságstatisztika 11. előadás.
Következtető statisztika 9.
Alapsokaság (populáció)
Lineáris regresszió.
Folytonos eloszlások.
Az eukarióta sejtciklus szabályozása
Szemcsés anyag, ha folyik...
Erőtörvények Tóth Klaudia 9/b..
1.Határozza meg a kapacitást két párhuzamos A felületű, d távolságú fémlemez között. Hanyagolja el a szélhatásokat, feltételezve, hogy a e lemez pár egy.
Egyenes vonalú mozgások
Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Regresszió-számítás március 30. Dr. Varga Beatrix egyetemi.
Valószínűségszámítás II.
Többdimenziós valószínűségi eloszlások
Fraktálok. Motiváció Three-Dimensional Mapping of Dislocation Avalanches: Clustering and Space/Time Coupling Jérôme Weiss and David Marsan Science 3 January.
A sűrűség.
Együttélés fluktuáló környezetben II. Elméleti ökológia szeminárium.
Földstatikai feladatok megoldási módszerei
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
Génexpressziós chipek mérési eredményeinek biklaszter analízise.
Mini-flap projekt Borda-Carnot átmenet 2  BC-átmenet: áramlás irányába bekövetkező hirtelen keresztmetszet- ugrás, cél a közeg lassítása,
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Lineáris regressziós modellek
Mikrobák mennyiségi meghatározása
Trendelemzés előadó: Ketskeméty László
Válogatott fejezetek sejtbiológiából („VFSB”, BSc, biomérnök)
Valószínűségi változó, eloszlásfüggvény
Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése
FOLYTONOS FERMENTÁCIÓ
Velünk élő középkor Forrás:
2. Regresszióanalízis Korreláció analízis: milyen irányú, milyen erős összefüggés van két változó között. Regresszióanalízis: kvantitatív kapcsolat meghatározása.
Dr. Varga Beatrix egyetemi docens
Előadás másolata:

Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota változatlan és a populáció aszinkron) A tenyészet sejttömege az idő függvényében M(t) = M 0 ·e  ·t (a sejtek koreloszlása és ciklus alatti tömegnövekedése ezt nem befolyásolja) Az egyedi sejt tömege az idő függvényében m(t) = m 0 ·e  ·t ??? m 0 a születéskori sejttömeg 0 < t < CT, ahol CT a sejt ciklusideje m(CT) = 2m 0 (tetszőleges monoton függvény elképzelhető) exponenciális-e a növekedés a sejtek életében ???

Sejtnövekedési modellek Exponenciális modell: a sejt növekedési sebessége folyamatosan nő → riboszómák száma (Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae ???) Lineáris (multilineáris) modell: a sejt növekedési sebessége állandó → bizonyos esemény(ek)nél ugrásszerű változások (Schizosaccharomyces pombe) CK ha a növekedés lineáris, és a ciklus belsejében nincs sebességváltás ↓ a sejt osztódásakor a növekedési sebességnek ugrásszerűen meg kell duplázódnia ↕ exponenciális növekedés esetében a sejt osztódásakor sincs hirtelen változás

A hasadó élesztőgomba, mint a sejtnövekedés modellje Mitózisos (ivartalan) sejtciklus Mitchison, 1957 csak hosszirányú sejtnövekedés → tömeg, térfogat és hossz ~ arányos a ciklus végén a hossznövekedés megszűnik Mitchison & Nurse, 1985 Sveiczer, Novák & Mitchison, 1996 a növekedés mintázata (bi)lineáris a ciklus közepe táján van egy sebességváltási pont (RCP)

A hasadó élesztőgomba mitózisos sejtciklusa

SG2MG1S RCP2 Idő (min) Sejthossz, L (  m) NETO új régi vég CK A Schizosaccharomyces pombe növekedése RCP3 RCP1

DL BL CT 5 min A mikrofotográfia módszere mért változó: a sejthossz (L) a születéstől (BL) az osztódásig (DL) az idő függvényében (0 < t < CT)

A mérési pontokra illesztett modellek Lineáris L(t) = a·t + b Exponenciális L(t) = c·e d·t Bilineáris L(t) =  ·ln{exp[  ·(t-  )/  ] + exp[  ·(t-  )/  ]} +  ahol  az RCP pozíciója,  pedig az átmenet élessége A legadekvátabb modell kiválasztási kritériumai Korrelációs koefficiens Reziduális standard deviációs = (SSE/df) 1/2 Akaike információs kritérium AIC = n obs · ln(SSE) + 2n par Schwarz Bayes információs kritérium SBIC = n obs · ln(SSE) + n par · ln(n obs )

RCP α 1 = μ m min -1 α 2 = μ m min -1 ε = 9.84 μ m τ = 57.6 min η = 0.01 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (éles bilineáris eset)

RCP α 1 = μ m min -1 α 2 = μ m min -1 ε = 10.2 μ m τ = 59.7 min η = μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (sima bilineáris eset)

γ = μ m min -1 δ = 7.86 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (lineáris eset)

α 1 = μ m min -1 α 2 = μ m min -1 ε = 10.8 μ m τ = 64.3 min η = μ m RCP Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: Hasadó élesztő sejtek „átlagos” növekedési mintázata (sima bilineáris)

A hasadó élesztő sejtnövekedése általában bilineáris, de gyakran nem éles

A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 1. WT cdc2 ts Fantes, P. A. (1977). Control of cell size and cycle time in Schizosaccharomyces pombe. J. Cell Sci. 24,

Sveiczer, A., Novak, B. & Mitchison, J. M. (1996). The size control of fission yeast revisited. J. Cell Sci. 109, A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 2.

Sveiczer, A., Novak, B. & Mitchison, J. M. (1996). The size control of fission yeast revisited. J. Cell Sci. 109, A méretkontroll a G2 fázis közepén hat → G2 = „sizer + timer” A méretkontroll pozícionálása hasadó élesztőben