Cianobaktériumok izolálása és megszámlálása Készítette: Horváth Attila.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
A vízben oldott oxigén meghatározása
Advertisements

Az élelmiszerek mikrovilága
A DNS „ujjlenyomat” vizsgálat
Élősejtszám meghatározás
Török Ádám Környezettudatos Közlekedés Roadshow,
Karbonát-, foszfát-, nitrátionok
A talajban lévő mobilis foszfor extrakciója
Szabad aminosavak termelésének kimutatása a talajmikroorganizmusok tenyészetében.
A talaj összes nitrogén tartalmának meghatározása
Készítette: Kozma Réka
A talaj mikrobiális biomassza meghatározása fumigációs módszerekkel.
Sav-bázis egyensúlyok
A talaj 3 fázisú heterogén rendszer
A KÉMIAI EGYENSÚLY A REAKCIÓK MEGFORDÍTHATÓK. Tehát nem játszódnak le végig, egyensúly alakul ki a REAKTÁNSOK és a TERMÉKEK között. Egyensúlyban a termékekhez.
ELEKTROKÉMIAI ALAPFOGALMAK
Fermentlevek reológiai viselkedése BIM Alapfogalmak belső súrlódás 1. NEWTON-i fluidumokra τ a fluidumra ható nyírófeszültség (erő/felület)  nyírósebesség,
Egy folyékony mintában valamilyen baktérium koncentrációját szélesztést követően agarlemezes telepszámlálással határozzuk meg. Tízes alapú hígítási sort.
Andráskó Melinda, Huszár László, Korpás Gábor, Környei József
Élősejtszám meghatározás
Gyors mikrobiológiai módszerek
23. Szappanfőzés.
Szilárd AgNO 3, ZnSO 4, kihevített CuSO 4 azonosítása.
25. Nátrium-karbonát, kálium-bromid és kalcium-karbonát azonosítása
Citromsav, Nátrium-acetát és szőlőcukor azonosítása
48. kísérlet Sók azonosítása vizes oldatuk kémhatása alapján
Szükséges Eszközök: gázfejlesztő főzőpoharak fecskendők Anyagok:
A kénsav és sói 8. osztály.
TÁMOP /1-2F Analitika gyakorlat 12. évfolyam Környezeti analitikai vizsgálatok Fogarasi József 2009.
Talajsterilezés Herman Edit. Sterilitás definíciója Külső behatás következtében kialakuló olyan állapot, amiben a vizsgált terület teljesen mikroba-mentes.
Enzimvizsgálati módszerek Kitináz aktivitás mérése
Arginin ammonifikáció Készítette: Vas Nóra. Arginin ammonifikáció Ammonifikáció mérésére szolgáló labor kisérlet Ammonifikáció fontossága:  Ökoszisztémák.
Ureáz aktivitás mérése
Nitrifikáció vizsgálata talajban
Adenozin-trifoszfát az ATP (adenozin-trifoszfát) minden élő szervezetben megtalálható allosztérikus effektorként, csoport-hordozó koenzimként és szubsztrátként.
Lipáz enzimaktivtás mérése
Talajvizsgálat kataláz aktivitás méréssel
FDA hidrolízis aktivitási teszt
Obligát anaerob mikroorganizmusok felszaporítása.
Készítette: Cserdi Péter Környezetmérnök szakos hallgató Szerves foszfor extrakciója talajból.
ATP (Adenozin-trifoszfát) meghatározása talajban - kénsavas, foszfátos extrakciós eljárással Tóth Anna Szilvia.
OECD GUIDELINE FOR THE TESTING OF CHEMICALS Soil Microorganisms: Carbon Transformation Test OECD ÚTMUTATÓ VEGYI ANYAGOK TESZTELÉSÉRE Talaj Mikroorganizmusok:
Munkafüzet feladatainak megoldása 29.old.- 31.old.
Mi a neve az üvegben levő folyadéknak?
Halogének I. Kálium-klorátos gyújtókeverék
Nitrogén I. Cseppfolyós nitrogén Tiszta N2 előállítása NH3 előállítása
Oxigén Oxigén előállítása KClO3-ból O2 előállítása K2Cr2O7-el
Gyakorlati képzés: Genetikai variációk igazolása PCR segítségével.
DNA-Fingerprint1 Polimeráz-láncreakció termékeinek vizsgálata agaróz gélelektroforézissel.
A Föld vízkészlete.
Vízlágyítás. Ca HCO 3 - Ca 2+ + H 2 O + CO 2 + CO 3 2- CaCO 3 képződés Túl sok CO 2 a vízben --> agresszív CO 2 Túl kevés CO 2 a vízben --> CaCO.
1. 2 MICROTESTER ÚJ TECHNIKA A MIKROBIOLÓGIÁBAN Dr. Reichart Olivér Dr. Szakmár Katalin Budapest, február 15. A redox-potenciál mérésen alapuló.
Páciens fertőzések eredetének meghatározása. Összefüggés A fertőzött beteget a kórházban ápolták egy műtétet követően. Az ápolás során minden nap más.
Bakteriális azonosítási folyamat
Antibiogram vizsgálat baktériumtörzsön
1 Polimeráz-láncreakció termékeinek vizsgálata agaróz gélelektroforézissel.
SDS-PAGE Kísérleti protokoll Címkézzen meg 1,5 ml-es zárható tetejű mikrocsöveket a halminták neveivel. 1. Minta előkészítés.
Immunoprecipitation Gyakorlati munka I. rész. Kísérleti protokoll Protokoll.
ELISA gyakorlati menete Gyakorlat, amivel bizonyíthatjuk a HIV fertőzést anti-HIV antitestek bizonyítéka a vérben.
Savak és lúgok. Hogyan ismerhetők fel? Indikátorral (A kémhatást színváltozással jelző anyagok)  Univerzál indikátor  Lakmusz  Fenolftalein  Vöröskáposzta.
SAV – BÁZIS REAKCIÓK KÖZÖMBÖSÍTÉS
Polyacrylamid-Gél Elektroforézis (PAGE)
Mikrobák mennyiségi meghatározása
A GFP in vitro génexpressziója
Tisztítási próba poliakrilamid gélelektroforézissel
Tejsav előállítása Lactobazillus Delbrueckii által
Mi a neve az üvegben levő folyadéknak?
Méréstechnika 1/15. ML osztály részére 2017.
Analitikai számítások a műszeres analitikusoknak
Biohidrogén előállítása
PHB szintézise (PolyHydroxyButyrate)
Előadás másolata:

Cianobaktériumok izolálása és megszámlálása Készítette: Horváth Attila

Cianobaktériumok Prokarióta mikroorganizmusok Fotoszintetizálnak, így O 2 -t termelnek Megjelenési formáik –Egysejtűként –Telepes szerkezetben –Fonalas formában Átlagos sejtméretük 1-6 μm Nitrogén megkötésre képesek -> talaj revitalizációra is szokták alkalmazni

Tálcák előkészítése A cianobaktériumokat szaporítás után konzerválni kell, nem szabad hűtőben tartani, más prokariótákkal ellentétben A következő dián látható 2 közegből egyet kiválasztunk Ezt 121 °C-on 20 percig sterilizáljuk, használat előtt 48 °C-os vízfürdő 4 hígítási tartomány kijelölése, ahol optimális a baktérium számlálás 1 ml kevert szuszpenziót kimérünk egy steril Petri-csészére 1 ml-es steril pipettával, a leghígabb oldattal kell kezdeni Öntsünk 15 ml tápoldatot a Petri-csészére, óvatosan össze kell keverni Ha a tápközeg megszilárdult, fordítsuk meg és tegyük inkubátorba

Alkalmazható tápközegek 1. Tápoldat A (Allen 1968) g NaNO 3 0,039 g K 2 HPO 4 0,075 g MgSO 4 *7H 2 0 0,020 g Na 2 CO 3 0,027 g CaCl 2 0,058 g Na 2 SiO 2 *9H 2 O 0,001 g EDTA 0,006 g citromsav 0,006 g Vas-citrát 1000,000 ml desztillált víz 1,000 ml mikroelem oldat A pH-t 7,8-ra kell beállítani 1 ml mikroelem oldat tartalmazza : 2,8600 g H 3 BO 4 1,8100 g MnCl 2 *7H 2 O 0,2220 g ZnSO 4 *7H 2 O 0,3910 g Na 2 MoO 4 *2H 2 O 0,0790 g CuSO 4 *5H 2 O 0,0494 g Co(NO 3 ) 2 *6H 2 O 1000,000 ml desztillált víz A szilárd táptalaj előállításához 1,5 % autoklávban csírátlanított agart (48 °C) adunk az oldathoz.

Alkalmazható tápközegek 2. Tápoldat B (Castenholz 1970) 0,100 g nitrilo-triecetsav 0,060 g CaSO4*2H20 0,100 g Mg SO4*7H2O 0,008 g NaCl 0,103 g KNO3 0,689 NaNO3 0,111 g NaHPO4 1,000 ml FeCl3 oldat (0,2905 g/l) 0,500 ml mikroelem oldat 1000,000 desztillált víz A pH-t 8,2-re állítjuk NaOH, ami az autokláv után 7,-7,6-ra áll be 1 ml mikroelem oldat tartalmazza : 2,280 g MnSO 4 *H 2 O 0,500 g ZnSO 4 *7H 2 O 0,500 g H 3 BO 4 0,025 g Na 2 MoO 4 *2H 2 O 0,025 g CuSO 4 *5H 2 O 0,045 g CoCl 2 *6H 2 O 0,500 ml H 2 SO ,000 kétszer desztillált víz A szilárd táptalaj előállításához 1,5 % autoklávban csírátlanított agart (48 °C) adunk az oldathoz.

Szilárdított agart tartalmazó Petri- csésze A tápközeg sterilizálása autoklávban 120 °C-on 20 percig zajlik, majd lehűtés 48 °C-ra 15 ml tápoldatot öntsünk minden Petri-csészére és hagyjuk megszilárdulni az agart A csészéket 2 napig pihentetjük szobahőmérsékleten viszonylag védett helyen vagy inkubátorban A nem azonnal felhasznált csészéket hűtőben tárolhatjuk 4 hígítási tartományt jelölünk ki a megfelelő sejtszám meghatározásért 0,1 ml-es alikvot mintákat mérünk ki 3 párhuzamos mérésre minden hígításból, kezdve a leghígabbal Steril üveg szélesztőbottal terítsük szét a szuszpenziót Fordítsuk le a csészét és tegyük inkubátorba

Cianobaktériumok számlálása Legvalószínűbb élősejtszám módszer (Most probable Number Method- MPN) Mikroorganizmusok jelenlétét vagy hiányát vizsgálja a talajok vagy más anyagok egymást követő hígításainak különböző egyedi részeiben Oldatok Megfelelő szubsztrátnak az alábbi tápanyag oldatok egyikét vagy egy másik standard tápanyag oldatot használjunk Bristol oldat (A) -1,0 g NaNO 3 -1,0 g K 2 HPO 4 -0,3 g MgSO 4 7H 2 O -0,1 g NaCl -Nyomnyi FeCl 3 *6H 2 O 800 ml desztillált vízben feoldva és 1000 ml-re feltöltve Wilson oldat (B) -1,00 g Ca(NO 3 ) 2 -0,25 g K 2 HPO 4 -0,25 g MgSO 4 7H 2 O -0,25 g KCl -0,30 g FeCl 3 *6H 2 O 800 ml desztillált vízben feoldva és 1000 ml-re feltöltve

(A) Bristol-oldat –8 unciás csavaros tetejű palack –36 gömbölyű üveggyönggyel –A gyöngyök a talaj aggregátumokat szedik szét –95 ml víz (B) Wilson-oldat –8 unciás csavaros tetejű palack –90 ml víz –Üveggyöngyök nélkül Egy talajmintához szükséges 1 vakminta gyöngyökkel és 7 anélkül

Számlálás előkészítése Minden talajmintához készítsünk 1 vak hígítást 95 ml vízzel és gyönggyel, illetve 7-et gyöngyök nélkül, 90 ml vízzel Zárjuk rá kupakokat, és tegyük 121 °C-os autoklávba, 20 percre, majd hűtsük le szobahőmérsékletre Tegyünk 10 g talajt a 95 ml vizet tartalmazó üres hígításos palackba. 10 percig keverjük vízszintesen a dugattyús keverőben, majd kézzel is rázzuk össze Azonnal mérjünk ki pipettával 10 ml-t a 90 ml-es üres hígításos palackba. -> ez lesz a hígítási tag Folytassuk a hígítást addig, amíg megfelelő tartományt el nem értünk ( hígítás) Minden sikeres hígításból 1ml-t bemérünk a inkubációs-csónakba 4 hétig 22 °C-on inkubáljuk szórt napfény, izzó vagy fluoreszcens fény mellett

A beoltott konténerekben hetente egyszer vizsgáljuk meg a cianobaktérium szaporodását, ami felismerhető felszíni gyűrűk vagy hártyák alapján Mikroszkópban közvetlen vizsgálatot folytathatunk Rögzítsük az egyes hígításokban előforduló baktériumok számát Ebből meghatározható a legvalószínűbb élősejtszám (MPN)