Populáció genetika Farkas János 2005..

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Energia, Munka, Teljesítmény Hatásfok
Advertisements

Kompetitív kizárás vagy együttélés?
Nagy fehér cápa.
5. hét: Solow-modell Csortos Orsolya
Fibonacci-sorozat.
A tevékenységhosszak és az erőforrás- mennyiségek kapcsolata Készítette: Szentirmai Róbert (minden jog fenntartva)
Makroökonómia gyakorlat
Testek egyenes vonalú egyenletesen változó mozgása
A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011.
Nemlineáris és komplex rendszerek viselkedése
Dualitás Ferenczi Zoltán
Elektromos ellenállás
MI 2003/ A következőkben más megközelítés: nem közvetlenül az eloszlásokból indulunk ki, hanem a diszkriminancia függvényeket keressük. Legegyszerűbb:
Műveletek logaritmussal
Matematika II. 2. előadás Geodézia szakmérnöki szak 2012/2013. tanév Műszaki térinformatika ágazat őszi félév.
1. A KVANTUMMECHANIKA AXIÓMÁI
Áramlástan mérés beszámoló előadás
Térbeli niche szegregáció kétfoltos környezetben
REAKCIÓKINETIKA BIOLÓGIAI RENDSZEREKBEN
Mozgó Objektumok Detektálása és Követése Robotkamera Segítségével
Az Ökológia biotikus és abiotikus tényezői
Statisztika II. VI. Dr. Szalka Éva, Ph.D..
A KUTYA TOVÁBB.
A ragadozás hatása a zsákmányállatok populációdinamikájára
Operációkutatás Kalmár János, Hiperbolikus és kvadratikus programozás.
Ökológia Fogalma:Az élőlényeknek a környezetükhöz való viszonyát vizsgáló tudomány. Vizsgálatának tárgya: Az ökoszisztéma, az élőhely ( biotóp) és azt.
Gyermekkor és gyermekkortörténet a kezdetektől napjainkig,különös tekintettel a középkór és reneszánsz gyermekképére.
Kutatói pályára felkészítő akadémiai ismeretek modul
KÖZMŰ INFORMATIKA NUMERIKUS MÓDSZEREK I.
Radioaktivitás Bomlási kinetika
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VI.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Regresszióanalízis.
Forgási állapotok kvantummechanikai leírása 1. Forgás két dimenzióban 2. Forgómozgás három dimenzióban; térbeli forgás - Míért fontos ez a témakör? - Miért.
A kvantummechanika alapegyenlete, a Schrödinger-féle egyenlet és a hullámfüggvény Born-féle értelmezése Előzmények Az általános hullámegyenlet Megoldás.
Dinamikai rendszerek kaotikus viselkedése
Aszexuális, szimpatrikus speciáció
1. feladat Makó és Veszprém között a távolság 270 km. Reggel 8-kor elindult egy vonat Makóról 60 km/h sebességgel. 9-kor Veszprémből indult egy gyorsvonat.
2006. március 3. Három négyzet oldalai különböző prím- számok. A két kisebb négyzet kerületének ösz- szege egyenlő a legnagyobb négyzet kerületé- vel;
Idősor elemzés Idősor : időben ekvidisztáns elemekből álló sorozat
Versengő társulások Mi történik egy olyan térbeli modellben, ahol sok stratégia létezik? Lokálisan csak a stratégiák kis hányada lehet jelen. => az evolúciós.
MAKROÖKONOMIA Előadás Szabó Richard BMF KKGK VSZI 1 Makroökonomia Szabó Richard VII.Előadás Növekedés, ciklusok Május.
Következtető statisztika 9.
A sztochasztikus kapcsolatok (Folyt). Korreláció, regresszió
Alapsokaság (populáció)
Két kvantitatív változó kapcsolatának vizsgálata
A HIV-fertőzés alapmodellje Vírusdinamika = a szervezeten belüli folyamatok modellezése.
Molekuláris rátermettség tájképek Kun Ádám. Rátermettség tájkép  Minden genotípushoz rendeljünk egy fenotípust  Minden fenotípushoz rendeljünk egy valósz.
A Van der Waals-gáz molekuláris dinamikai modellezése Készítette: Kómár Péter Témavezető: Dr. Tichy Géza TDK konferencia
1. MATEMATIKA ELŐADÁS Halmazok, Függvények.
Differenciálegyenletek
Kenyér kihűlése Farkas János
MARHAJÁTÉK Számítógépes modellezés Farkas János
HŐTAN 3. KÉSZÍTETTE: SZOMBATI EDIT
Lakosság létszámának változása Farkas János
Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Regresszió-számítás március 30. Dr. Varga Beatrix egyetemi.
A mozgás egy E irányú egyenletesen gyorsuló mozgás és a B-re merőleges síkban lezajló ciklois mozgás szuperpoziciója. Ennek igazolására először a nagyobb.
Populációk jellemzői  populáció: valós szaporodási közösség
Szimuláció.
Variációs elvek (extremális = min-max elvek) a fizikában
Hibaszámítás Gräff József 2014 MechatrSzim.
Rugós inga mozgása Hömöstrei Mihály.
Fenntarthatóság és Káosz
FIBONACCI SOROZAT.
1 Predáció populációdinamikai hatása Def.: olyan szervezet, amely a zsákmányát, annak elfogása után, megöli és elfogyasztja. (Ellentétben: herbivor, parazitoid,
Szimuláció. Mi a szimuláció? A szimuláció a legáltalánosabb értelemben a megismerés egyik fajtája A megismerés a tudás megszerzése vagy annak folyamata.
Enzimkinetika Komplex biolabor
Haladó Pénzügyek Vezetés szervezés MSC I. évfolyam I
Parazitizmus Def.: Olyan szervezetek, amelyek a gazdaállatot nem ölik meg (vagy nem azonnal), de súlyos fitnisz csökkenést okoz(hat)nak. (Az „ideális”
Haladó Pénzügyek Vezetés szervezés MSC I. évfolyam I
EGYENES ARÁNYOSSÁGGAL
Dr. Varga Beatrix egyetemi docens
Előadás másolata:

Populáció genetika Farkas János 2005.

Források Csákány Antal – Dr. Vajda Ferenc: Játékok számítógéppel Szlávi Péter – Zsakó László: Modellcsalád s populációgenetikában Horváth László –Szlávi Péter – Zsakó László: Modellezés & Szimuláció

A fenti formula egy differenciálegyenletet határoz meg. Egyetlen faj esete Jelöljük x(t) -vel egyetlen faj egyedeinek számát a t idő függvényében, akkor az időegység alatt keletkező új egyedek száma: Ez azt jelenti, hogy az új egyedek száma a már életben levő egyedek számával arányos (a). A fenti formula egy differenciálegyenletet határoz meg.

Mindkét oldalt e alapra emelve: Egyetlen faj esete A megoldandó egyenlet egy elsőrendű, szétválasztható változójú differenciálegyenlet, amelynek megoldása: Mindkét oldalt e alapra emelve:

A C konstans a t = 0 feltételből számítható ki Egyetlen faj esete A C konstans a t = 0 feltételből számítható ki Itt x0 a faj egyedeinek induló létszámát jelenti. Látható, ha a pozítív állandó, akkor a faj létszáma exponenciálisan növekszik. Az exponenciális növekedésnek azonban általában vannak korlátai: túlnépesedés, táplálék véges mennyisége, kihalás, ellenség, stb.

Egyetlen faj esete Ezeket a hatásokat jobban figyelembe veszi a következő modell: ahol a és b a folyamat állandó paraméterei. Bár a fenti differenciálegyenlet nemlineáris, szerencsére mégis van analitikus megoldása, így viszonylag könnyen megoldható.

Több faj esete Ha a rendszer egyidejűleg több fajt is tartalmaz, és a fajok versengenek a táplálékforrásokért, akkor két faj esetén a modell: Itt x1(t) és x2(t) jelöli a két különböző fajt. Ezeket az egyenleteket Volterra egyenleteknek nevezik.

Ha az egyik faj a másikból él, akkor két faj esetén a modell: Több faj esete Ha az egyik faj a másikból él, akkor két faj esetén a modell: Ebben az esetben az x1 faj x2 jelenléte nélkül exponenciálisan elszaporodna, x2 pedig x1 jelenléte nélkül kihalna, az x2 tehát „megeszi” x1-et, x1 szolgál táplálékul x2-nek.

Több faj esete - finomítások Tovább finomítható a modell, ha figyelembe veszünk olyan külső tényezőket, amelyek a fajok létszámának alakulását befolyásolhatják. Ilyenek például a termény betakarítás, vadászat, stb. Ekkor egy n fajt tartalmazó rendszerben az i – edik fajra általánosan a következő összefüggés írható fel:

Több faj esete - finomítások Az összefüggés utolsó tagja a kívülről történő beavatkozást jelenti. (Ez nem csak csökkentő célzatú lehet, hanem pozitív irányú változást is jelenthet, pl. ivadéktelepítés, tenyészállatok beszerzése, stb.)

Nyulak és rókák esete A nyulak a rókák nélkül elszaporodnának, a rókák nyulak nélkül kihalnának. A két faj egyedeinek – itt a nyulak számára végzetes – találkozásainak száma a két faj létszámának szorzatától függ. (Ilyen az autóknál a koccanások száma is, amely az autók számának négyzetével arányos)

Nyúl – róka modell A programból jól leolvasható, hogy a nyulak elszaporodását a rókák számának növekedése követi, majd a nyulak kezdenek fogyni, ez azonban a rókák pusztulását eredményezi és így tovább.

Őz - szarvas modell - leírás Egy táblázaton őzek és szarvasok szaporodását figyelhetjük meg. Megadhatjuk kezdeti arányukat, szaporodásuk szabályait (egy párnak mennyi utódja lesz évente [maximum 5]), mozgási területüket, táplálékigényüket. Az egyedszám felső határa a rendelkezésre álló tápláléktól függ, alsó határa pedig attól, hogy van-e két egyed elérhető távolságban (tudnak-e szaporodni). A populációk számát állandóan csökkenti a természetes öregedés, a táplálékhiány, a ragadozók és a vadászok. Ezen paraméterek változtatásával figyeljük meg a két faj létszámának változását.

Őz - szarvas modell - paraméterek Egy szarvas szülőpárnak hány utódja születik (1) Egy őz szülőpárnak hány utódja születik (2) Egy szarvas várható életkora (10) Egy őz várható életkora (6) Egy szarvas mozgási területe mekkora (40 km2) Egy őz mozgási területe mekkora (20 km2) Ebből mekkora a táplálkozási területe (10 km2) Ebből mekkora a táplálkozási területe (3 km2) 100 egyedből hányat lőnek le a vadászok (40) 100 egyedből hányat lőnek le a vadászok (30) 100 egyedből hányat esznek meg a ragadozók (5) 100 egyedből hányat esznek meg a ragadozók (10) Hány szarvas legyen kezdetben (max. 160) Hány őz legyen kezdetben (max. 40)

Zsákmányszerzés modell - leírás A programmal egy ragadozó-zsákmány kölcsönhatást figyelhetünk meg. Megadhatjuk mindkettő születésének és halálozásának szabályait, illetve egymásra hatásukat. (Jel: R - ragadozó, Z - zsákmány). Tapasztalhatjuk, hogy a ragadozókra káros hatással van, ha lassú a szaporodásuk, illetve kevés és lassan szaporodik a zsákmány (kihal vagy nagy az ingadozás). Ha mindkettő gyorsan szaporodik, az nagy instabilitást eredményez. Nagyon sok esetben a két populáció egyedszámának periodikus ingadozását figyelhetjük meg. Ha a két faj kezdeti létszámát arányosan csökkentjük, akkor ez elég hosszú időn át a zsákmány szaporodásának fog kedvezni ( VOLTERRA-elv ).

Zsákmányszerzés - paraméterek Mennyi ragadozó legyen (1-200) Mennyi zsákmány legyen (1-500) Ragadozó évi utódszáma Zsákmány évi utódszáma Ragadozó évi halálozási gyakorisága (0-1) Zsákmány évi halálozási gyakorisága (0-1) Táplálkozási együttható (0-8)

Parazitizmus modell - leírás A programmal egy parazita - gazdaállat kölcsönhatást figyelhetünk meg. Megadhatjuk, hogy a parazita a gazdaállaton milyen ütemben szaporodik (szaporodni csak a gazdaállaton tud), magányosan milyen eséllyel hal meg, a gazdaállat születésének és halálozásának szabályait, mennyire fertőz és mennyivel növeli a halálozási rátát a parazita. Jelölés: P, G, illetve számjegy a fertőzöttekre. Tapasztalhatjuk: kis fertőzöttség stabilan megmarad, nagy pedig periodikus ingadozást okoz. Ha a fertőzés nagyon növeli a halálozást, mégsem szűnik meg, ha a parazita gyorsan szaporodik. A parazita hiába szaporodik gyorsan, ha kevés esélye van fertőzésre, egyébként kipusztíthatja a gazdapopulációt.

Parazitizmus - paraméterek Mennyi állat legyen (1-500) Ebből mennyi fertőzött (1-323) Parazita szaporodási együtthatója (1- …) Gazdaállat évi utódszáma Parazita halálozási gyakorisága (0-1) Gazdaállat halálozási gyakorisága (0-1) Ezt mennyivel növeli meg egy parazita Fertőzési fok (0-1)