A molekuláris evolúció neutrális elmélete

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Események formális leírása, műveletek
Advertisements

I. előadás.
Mutációk.
Elektroforézis Általában agaróz a hordozó
A humán genom projekt.
A T sejtek ontogenezise III. Matkó János,
Klasszikus genetika és evolúciógenetika
Populációk tájban: Habitat-szelekció és metapopulációk
Molekulák forgási színképei
A pontcsoportok elmélete – az AO-k szimmetriája és más alkalmazások
Drozophila jó modellállat, mert:
Strukturális genomika Gyakorlati feladatok. SNP-k és vizsgálatuk Mi az SNP?
Becsléselméleti ismétlés
Az immunoglobulin szerkezete
Genetikus algoritmusok
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VII.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Mintavétel Mintavétel célja: következtetést levonni a –sokaságra vonatkozóan Mintavétel.
Molekuláris genetika Falus András.
Antigén receptorok Antitest, T sejt receptor A repertoire (sokféleség) kialakulása Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Falus András.
IRE 5 /18/ 1 Óbudai Egyetem, NIK Dr. Kutor László2011. TÁMOP – I ntelligens R endszerek E lmélete 5.
Kedvenc Természettudósom:
Az Örökítőanyag.
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Evolúciósan stabil stratégiák előadás
Mendeli genetika Allél Monohibrid -Dihibrid Autoszóma – alloszóma
Öröklődés molekuláris alapjai
Kvantitatív módszerek 7. Becslés Dr. Kövesi János.
A kutya és az ember evolúciója: Viselkedési és genetikai párhuzamok 2006 MTA Genetika és az emberi változékonyság Miklósi Ádám ELTE Etológia Tsz Együttműködő.
Kvantitatív módszerek 8. Hipotézisvizsgálatok I. Nemparaméteres próbák Dr. Kövesi János.
Gazdasági növekedés hosszú- és rövidtávon
Aszexuális, szimpatrikus speciáció
Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata
Arabidopsis thaliana tip120 inszerciós mutáns jellemzése
Az evolúció genetikai alapjai
AZ ELLENANYAG SOKFÉLESÉG GENETIKAI HÁTTERE. AZ ELLENANYAGOK SZERKEZETE KOMPLEMENT AKTIVÁCIÓ SEJTHEZ KÖTŐDÉS LEBOMLÁS TRANSZPORT Könnyű lánc (L) Nehéz.
C mIg H mIg L TCR  TCR  T-SEJT  C V Antigén receptor TCR A B- ÉS T-SEJTEK ANTIGÉN FELISMERŐ RECEPTORAI HASONLÓ SZERKEZETŰEK TCR =  +  A.
Kvantitatív módszerek
A genetika (örökléstan) tárgya
Domináns episztázis – lovak
Problémás függvények : lokális optimalizáció nem használható Globális optimalizáció.
Versengő társulások Mi történik egy olyan térbeli modellben, ahol sok stratégia létezik? Lokálisan csak a stratégiák kis hányada lehet jelen. => az evolúciós.
Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika
Hipotézis vizsgálat (2)
Alapsokaság (populáció)
IN VITRO MUTAGENEZIS Buday László.
A SEJTCIKLUS ÉS A RÁK KAPCSOLATA
A P elem technikák: génmanipuláció tetszés szerint
Az evolúció fényében Szathmáry Eörs Collegium Budapest ELTE.
EVOLÚCIÓ.
Molekuláris rátermettség tájképek Kun Ádám. Rátermettség tájkép  Minden genotípushoz rendeljünk egy fenotípust  Minden fenotípushoz rendeljünk egy valósz.
Az evolúciókutatás eszközei Kun Ádám. Történeti és folyamat szemlélet  Evolúció történeti szemlélete: Az evolúció tárgya az élet keletkezésének, a fajok.
I. előadás.
Receptor és szenzor fehérjék számítógépes tervezése Összeállította: Kiss Lóránd 2009.április.24. Bioinformatika szakirodalmi tanulmányok.
Szelekció II. Örökléstani alkalmazások Farkas János Az alapprobléma megtalálható W. Feller: Bevezetés a valószínűségszámításba és alkalmazásaiba.
A genom variabilitás orvosi jelentősége Gabor T. Marth, D.Sc. Department of Biology, Boston College Orvosi Genomika kurzus – Debrecen, Hungary,
Evolúciós Genom Biológia Gabor T. Marth, D.Sc. Department of Biology, Boston College Orvosi Genomika kurzus – Debrecen, Hungary, May 2006.
GÉNEK ÉS VISELKEDÉS.
A negyedik halmazállapot: A Plazma halmazállapot
Informatikai Rendszerek Tervezése 5. Előadás: Genetikus algoritmusok Illyés László Sapientia - Erdélyi Magyar TudományEgyetem (EMTE) Csíkszereda IRT.-5.
Együttélés fluktuáló környezetben II. Elméleti ökológia szeminárium.
Elméleti módszerek a fehérjekutatásban Fuxreiter Mónika Enzimológiai Intézet.
Honalapító őseink genetikai öröksége Kristóf Zoltán, 2013.
DNS szintézis, replikáció Információ hordozó szerep bizonyítéka Avery-Grifith kísérlet Bakterifágos kísérlet.
Géntechnikák labor kiselőadás Készítette: Nagy Zsuzsanna
lecke A gének megváltozása. A génösszetétel megváltozása
Nagyméretű kópiaszám változás (CNV) detekciója teljes genom asszociációs vizsgálatokban Az ábrán egy kromoszómán (alsó sáv) mért intenzitások aránya (B.
Antigén receptorok Keletkezésük, a sokféleség kialakulása
FOGALMAK DNSasfehérje (szabályozó/szerkezeti)
Komenczi Bertalan Információelmélet
Kockázat és megbízhatóság
Előadás másolata:

A molekuláris evolúció neutrális elmélete Pásztor, 2007. nov.26.

A molekuláris evolúció neutrális elméletének alapfeltevései A mutációk vagy nem hatnak a molekulák működésére, azaz neutrálisak, vagy rontják a működést. A rossz mutánsok hamar kiszelektálódnak (negatív szelekció). A molekuláris polimorfizmus zöme tehát semleges variánsok átmeneti együttes előfordulása → sodródás-mutáció egyensúly alakul ki.

Genetikai sodródás: mintavételi hiba!

Eredmények Ha egy populációban egy allél kezdeti gyakorisága p, akkor annak valószínűsége, h fixálódik:p

A kis populációméret hatásának kisérletes vizsgálata 3./Eredmények

A kis populációméret hatásának kisérletes vizsgálata 4./Eredmények

Eredmények Sok, különböző mutáns esetén egyensúlyban a neutrális allélok fixálódási (lecserélődési) rátája μ., μ:a neutrális mutációk keletkezési rátája génenként és generációnként. Levezetés: 2N μ: új mutánsok száma/generáció Új mutáns kezdeti gyakorisága=fixálódási valószínűsége P(valamelyik új mutáns fixálódik):

A neutrális variánsok megjelenése, kiesése és elterjedése

A neutrális allélok fixálódásához, ill A neutrális allélok fixálódásához, ill. kieséséhez szükséges időtartamok

ADH, nukleotid polimorfizmus, 2

-haemoglobin molekuláris óra K=-ln(1-D): a szekvenciák közt várható különböző pozíciók aránya D:a különböző aa pozíciók empírikus aránya

Empírikus evidenciák Szinoním és nem-szinoním bp cserék rátái Fehérje kódoló génszakaszok

Nukleotid szubsztitúciós ráták Mutációs ráta becslése neutrális modell alapján!

Összefoglalás Ha egy jól funkcionáló molekula már kialakult, a neutrális elmélet alapján értjük, hogyan konzerválódik!