A P elemek mobilitásának szabályozása

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
BIOTECHNOLÓGIA D MsC gyakorlat
Advertisements

A mutagenezis célja, haszna Mutáció Az egyed megjelenése (fenotípusa) megváltozHAT Ebből visszakövetkeztethetünk a mutációt szenvedett gén funkciójára.
Mol. biol. módszerek Dr. Sasvári Mária
Genetikai vizsgálatok jelentősége
Mutációk.
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
A biológiai óra genetikája. Kezdeti eredmények I. az SCN transzplantációnál szó volt a tau-mutáns hörcsögökről 1985-ben egy Martin Ralph nevű kutató furcsán.
Fonalas fágok I. M13, f1 és fd fágok, genomjuk 98%-ban azonos  rekombinálnak egymással Az érett fágok genomja egyszálú cirkuláris DNS, a sejten belül:
Bakteriális genom térképezés Készítette: Mlinarics Edina IV. Biológus Bioinformatika SZIT.
Az intergénikus régiók és a genom architektúrájának kapcsolata Craig E Nelson, Bradley M Hersh és Sean B Carrol (Genome Biology 2004, 5:R25) Bihari Péter.
Antibiotikumok fejlesztése a genomika segítségével
Strukturális genomika Gyakorlati feladatok. SNP-k és vizsgálatuk Mi az SNP?
Az immunoglobulin szerkezete
Egyéb öröklődési típusok és epigenetika Láng Orsolya október 20.
A Mendel-i öröklődés Falus András
Molekuláris genetika Falus András.
Kedvenc Természettudósom:
A sejtmagon kívüli genom
GENETIKA.
Génexpresszió (génkifejeződés)
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
SV40 infekció transzformált sejt. „korai” gének (early - E) „késői” gének (late - L) 4.7 kb SV40 genom - kicsiny „tanulóvírus” fertőzést követően először.
Mendeli genetika Allél Monohibrid -Dihibrid Autoszóma – alloszóma
Bevezetés a genetikába
Ivari kromoszómás jellegek és humángenetika
Ahhoz, hogy dolgozni tudjunk égy adott génnel, vagy szekvenciával nagy mennyiségű DNS-re van szükségünk, ezért valamilyen módon „klónozni” kell, a gén.
Plazmidok Készítette: Vásárhelyi Miklós. : E. Coli jól használható genetikai kísérletekben: Genomja kicsi(4,2*10 6 bázispár, kb. ezrede az emberének)
Készítette: Leidecker Orsolya
Transzpozonok, tumormarkerek
Készítette: Vancsó Ildikó
Egészségügyi mérnököknek 2010
Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata
Arabidopsis thaliana tip120 inszerciós mutáns jellemzése
Arabidopsis thaliana tip120/cand1 T-DNS inszerciós mutáns jellemzése.
AZ ELLENANYAG SOKFÉLESÉG GENETIKAI HÁTTERE. AZ ELLENANYAGOK SZERKEZETE KOMPLEMENT AKTIVÁCIÓ SEJTHEZ KÖTŐDÉS LEBOMLÁS TRANSZPORT Könnyű lánc (L) Nehéz.
23-mer 12-mer A közbeeső DNS hurok kivágódik A heptamerek és nonamerek visszafelé illeszkednek Az RSS által kialakított alakzat a rekombinázok célpontja.
Hogyan képes a B sejt csak egyfajta könnyű és egyfajta nehéz láncot kifejezni? –Annak ellenére, hogy minden B sejtben egy apai és egy anyai Ig lókusz is.
Az ember egyszerű mendeli genetikája
A genetika (örökléstan) tárgya
A Drosophila szemszín öröklődése
IN VITRO MUTAGENEZIS Buday László.
A P elem technikák: deléció izolálása P elem remobilizációval
A P elemek felfedezése, felépítése és mobilitásuk mechanizmusa
A P elem technikák: enhanszerek és szupresszorok azonosítása
Az eukarióta sejtciklus szabályozása
A P elem technikák: enhanszerek és gének csapdázása
A SEJTCIKLUS ÉS A RÁK KAPCSOLATA
A P elem technikák: génmanipuláció tetszés szerint
Készítette: Czigléczki Gábor
Az egyedfejlődés második rész.
A genom variabilitás orvosi jelentősége Gabor T. Marth, D.Sc. Department of Biology, Boston College Orvosi Genomika kurzus – Debrecen, Hungary,
Sejtek genetikai módosítása (gének bevitele vagy eltávolítása)
Escherichia coli baktérium
lecke A genetikai kódrendszer Gének és allélek.
Vakcinák. Edward Jenner Fekete himlő Tehén himlő Fekete himlő Tehén himlő
Nemi kromoszómák és nemhez kötött öröklődés
Minőségi és mennyiségi jellegek öröklődése
Új molekuláris biológiai módszerek
Géntechnikák labor kiselőadás Készítette: Nagy Zsuzsanna
RNS TUMORVÍRUSOK (Retrovírusok)
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
Új molekuláris biológiai módszerek labor
The lactose (lac) operon - an example for prokaryotic gene regulation
Új molekuláris biológiai módszerek
FOGALMAK DNSasfehérje (szabályozó/szerkezeti)
Molekuláris biológiai módszerek
Molekuláris biológiai módszerek
Új molekuláris biológiai módszerek
EPIGENETIKA OLYAN JELENSÉGEKKEL FOGLALKOZIK, AMELYEK KÖVETKEZTÉBEN
Előadás másolata:

A P elemek mobilitásának szabályozása Génmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák A P elemek mobilitásának szabályozása

A P elemek mobilitásának szabályozása Két szabályozási állapot létezik: az M és a P citotípusnak megfelelő. - kromoszómális és extra-kromoszómális faktorok P citotípusú állatokban a P elemek transzkripciósan szupresszált állapotban vannak: - transzkripciós szabályozás? - poszt-transzkripciós szabályozás? A szabályozási mechanizmus anyai hatást és anyai öröklődést mutat. A P elemek mobilitásának szabályozásában szerepe van az inszerciók genomikus pozícióinak is. A P elemek mobilitása szövetspecifikus. A szabályozási mechanizmus részletei nem ismertek.

P elem függő hibrid diszgenezis Nőstény szülő M P normális normális M M M citotípusú P citotípusú Hím szülő diszgenikus normális P M citotípusú P citotípusú Csak M és P törzsek közötti keresztezés okoz hibrid diszgenezist, de csak akkor, ha a hím származik a P törzsből

A snw genetikai esszé a transzpozáz aktivitás kimutatására X snw Tesztelő törzs snw X : snw sne sn+ +

A P citotípus meghatározásában kromoszómális és extra-kromoszómális faktorok is szerepet játszanak P citotípusú anyai öröklődés M citotípusú anyai öröklődés X DS: 2.2 % DS: 99.8 % DS: 3.9 % DS: 99.5 % DS: 4.2 % DS: 40.4 % DS: 2.4 % G0 G1 G2 Pre-P DS: diszgenikus sterilitás

A P elem mobilitás szövetspecifitását alternatív RNS splicing biztosítja ATG TGA TAA ORF 0 ORF 1 ORF 2 ORF 3 IR AUG UAA AAAA ivarsejt mRNS 87 kD transzpozáz AUG UGA AAAA szomatikus mRNS 66 kD represszor AUG UAA belső deléció AAAA deléciós mRNS 24 kD represszor

A P elemek mobilitásának szabályozása Két szabályozási állapot létezik: az M és a P citotípusnak megfelelő. - kromoszómális és extra-kromoszómális faktorok P citotípusú állatokban a P elemek transzkripciósan szupresszált állapotban vannak: - transzkripciós szabályozás? - poszt-transzkripciós szabályozás? A szabályozási mechanizmus anyai hatást és anyai öröklődést mutat. A P elemek mobilitásának szabályozásában szerepe van az inszerciók genomikus pozícióinak is. A P elemek mobilitása szövetspecifikus. A szabályozási mechanizmus részletei nem ismertek.

P elem transzpozíció gátlásának molekuláris mechanizmusai Transzkripciós Poszt-transzkripciós Tnp 66kD 66kD 66kD aktív Tnp inaktív Tnp

A P elemek mobilitásának szabályozása Két szabályozási állapot létezik: az M és a P citotípusnak megfelelő. - kromoszómális és extra-kromoszómális faktorok P citotípusú állatokban a P elemek transzkripciósan szupresszált állapotban vannak: - transzkripciós szabályozás? - poszt-transzkripciós szabályozás? A szabályozási mechanizmus anyai hatást és anyai öröklődést mutat. A P elemek mobilitásának szabályozásában szerepe van az inszerciók genomikus pozícióinak is. A P elemek mobilitása szövetspecifikus. A szabályozási mechanizmus részletei nem ismertek.

A 66kDa represszor szerepe a P citotípus kialakításában dajkasejtek petesejt follikuláris sejtek P elemek olyan genomikus régióba inszertálódnak, amelyek expresszálódnak az oogenezis folyamán. A 66 kDa represszor fehérje termelődik a dajka és follikuláris sejtekben az oogenezis folyamán. A petesejt felhalmozza a 66 kDa represszor fehérjét, ami gátolja a transzpozáz képződését és aktivitását. A 66 kDa represszor fehérje jelenléte biztosítja a P citotípus anyai hatását és anyai öröklődését.

A P elemek mobilitásának szabályozása Két szabályozási állapot létezik: az M és a P citotípusnak megfelelő. A szabályozási mechanizmus anyai hatást és anyai öröklődést mutat. - kromoszómális és extra-kromoszómális faktorok P citotípusú állatokban a P elemek transzkripciósan szupresszált állapotban vannak: - transzkripciós szabályozás? - poszt-transzkripciós szabályozás? A P elemek mobilitásának szabályozásában szerepe van az inszerciók genomikus pozícióinak is. A P elemek mobilitása szövetspecifikus. A szabályozási mechanizmus részletei nem ismertek.

X P elem transzpozíció gátlásának „trans-silencing” modellje Riporter P elem inszerció P elem inszerció TAS szekvencákban Csökkent riporter expresszió

A P elem technikák: mutagenezis I. Génmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák A P elem technikák: mutagenezis I.

A P elem mutagenezis Először P citotípusú P törzsekkel és vad típusú P elemekkel Mutációk nem stabilak A mutánsok több inszerciót is hordoznak Körülményes a mutációk térképezése, és az érintett gének klónozása Mutagenezis egyetlen P elem felhasználásával A mutagenezis egy-egy speciális P elemet hordozó nőstény és hím keresztezése során játszódik le. Mutátor elemek (nem autonóm) Jumpstarter elemek (nem autonóm) Mutáns vonalak egyetlen random mutátor inszerciót hordoznak. Az érintett gének könnyen azonosíthatók és klónozhatók.

A P-lacW mutátor elem felépítése lacZ mini-white ori amp E B Génexpresszió követését teszi lehetővé Marker gén lehetővé teszi a P elem követését Bakteriális szekvencia a DNS klónozást teszi lehetővé

P elemmel jelölt gének klónozása plazmid menekítési kísérletben EcoRI A gén B gén C gén P elem inszerciósmutáns izolálása EcoRI A gén Genomikus DNS EcoRI emésztése majd ligálása ori amp EcoRI menekítő plazmid baktérium transzformáció és antibiotikum szelekció plazmid DNS izolálása és befogott gének azonosítása

Domináns P elem inszerciós mutánsok izolálása P(w+) mutátor törzs transzpozáz forrás W- P(Δ2-3), Sb X Y TM6, Tb P(w+) P(w+) W- P(Δ2-3), Sb W- X Y W- „jump-starter” hímek Y W- P(w+) P(w+) W- vagy Y w- hímek szűrése domináns fenotípusra

Recesszív P elem inszerciós mutánsok izolálása Y W- P(w+) W- Sco X W- SM5 F2 az előző keresztezésből Y W- P(w+) P(w+) W- X SM5 W- SM5 Szűrés recesszív látható, vagy letális mutációra