Comparative Molecular Field Analysis zöld: üres, sárga: zsúfolt régiók piros: negatív, kék: pozitív elektrosztatikus potenciál
Illeszkedés a farmakofórhoz piros: proton akceptor (negatív potenciál) zöld: hidrogén-híd akceptor (negatív potenciál) kék: hidrofób régió (kis elektrosztatikus tér)
Keresés adatbázisban
Vezérmolekula
Ligandum alapú szűrés Célfehérje kiválasztvatalálat (IC50, μM) K-csatorna752 (7,7) Dopamin transzporter 7044 (0,5) Urotenzin II91811 (0,4) Muszkarin M31723 (0,2) HIV-1 integráz34010 (1,5)
Lipinski-féle ötös szabály Ha az alábbiak közül legalább két reláció teljesül, rossz a biológiai elérhetőség (bioavailability) l molekulasúly > 500 l oktanol/víz megoszlási hányados > 5 l H-híd donorok száma > 5 l H-híd akceptorok száma > 10
Adatbázis elemzése 82 ezer biológiai hatást mutató molekula adatai hisztogramm: hány molekula mutatja a jelzett tulajdonságot maximum jellegű eloszlások
Molekulasúly
Lipofilicitás
H-híd donorok száma
Elforgatható kötések száma
Gy ű r ű k száma
Racionális gyógyszertervezés Még nem terveztek teljesen új gyógyszermolekulát a számítógépen Sikerek az optimalizációban Az enantiomerek hatása biztosabban felmérhető, mint a racemátoké: törekedni kell a tiszta enantiomerek előállítására.
Racionális gyógyszertervezés Természetes irányvegyületek: agonisták, enzim szubsztrátok, hírvivő molekulák, stb.
HIV-1 proteáz inhibitorok Röntgen-diffrakció és molekulamechanika segítségével elemezték a kötés jellegzetességeit
HIV-1 proteáz inhibitorok enzimreakció átmeneti állapotával analóg szerkezet
További sikerek
Kimerevítés hatása minimalizálja a lehetséges konformációkat kimerevíti az aktív konformációt farmakofór
Kimerevítés hatása