Comparative Molecular Field Analysis zöld: üres, sárga: zsúfolt régiók piros: negatív, kék: pozitív elektrosztatikus potenciál.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Az “sejt gépei” az enzimek
Advertisements

A fehérjék.
Készítette: Bráz Viktória
IZOENZIMEK Definíció: azonos funkció, de: eltérő primer szerkezet,
Hatóanyagok fizikai-kémiai tulajdonságai és a felszívódás összefüggése
Halmazok.
RACIONÁLIS GYÓGYSZERTERVEZÉS MOLEKULASZERKEZETI VONATKOZÁSOK.
Rézcsoport.
majdnem diffúzió kontrollált
Szervetlen kémia Hidrogén
ENZIMOLÓGIA 2010.
Microsoft Access I. Készítette: Rummel Szabolcs
Az elektronika félvezető fizikai alapjai
Foltkeresés tüdő röntgen képeken
Szabadenergia gyors becslése a gyógyszerkutatásban
Jelkondicionálás.
Szerves kémia Szacharidok.
NitrogéN Anyagszerkezet Fizikai ,Kémiai tulajdonságok Előfordulás
Ábrázoló geometria Lukács Imre.
Atomok kapcsolódása Kémiai kötések.
Halmazok Összefoglalás.
Kulcs-zár illeszkedés (Emil Fischer)
ENZIMEK Def: katalizátorok, a reakciók (biokémiai) sebességét növelik
A kompenzálásnak 3 lehetséges módja van: Δ=0 →amikor nincs kompenzálás Δ>0 →a kompenzálás érték pozitív Δ
Szervetlen kémia Hidrogén
4. Félvezetőlézerek Lézerközeg: p-szennyezett és n-szennyezett félvezető anyag közötti határréteg Az elektromos vezetés szilárdtest-fizikai alapjai szükségesek.
Az Enzimek Aktivitás-Kontrolja
FUNKCIONÁLIS DOMAIN-EK
STRONCIUM-ION MEGKÖTŐDÉSÉNEK KINETIKÁJA TERMÉSZETES AGYAGMINTÁKON
ENZIM MODULÁCIÓ.
Nukleotid típusú vegyületek
Önálló labor munka Csillag Kristóf 2005/2006. őszi félév Téma: „Argument Mapping (és hasonló) technológiákon alapuló döntéstámogató rendszerek vizsgálata”
Koaguláció. Kolloid részecske és elektrosztatikus mezője Nyírási sík (shear plane): ezen belül a víz a részecskével együtt mozog Zéta-potenciál: a nyírási.
Kémiai reakciók.
Kémiai kötések.
Aromaticitási indexek
Sav-bázis reakciók BrønstedLowry-féle sav-bázis elmélet
A kén Sulphur (S).
A réz-csoport I. A réz.
A nitrogén és oxidjai 8. osztály.
Kémiai kötések Kémiai kötések.
Az anyagok részecskeszerkezete
A Duna-régió fejlesztése Dávid János. Vízlépcsők a Dunán.
Molekuláris elektronika Hajdu Ferenc Elektronikai Technológia Tanszék 2003.
Molekuláris elektronika Hajdu Ferenc Elektronikai Technológia Tanszék 2003.
A foszfát csoport az S, T és Y oldalláncok hidroxil- csoportjához kapcsolódik.
Enzimreakciók Környezet figyelembe vétele   1 (  1 )-  2 (  2 ), mikor minden fragmens végtelen távolságban van Empirikus vegyértékkötés módszer.
Receptor és szenzor fehérjék számítógépes tervezése Összeállította: Kiss Lóránd 2009.április.24. Bioinformatika szakirodalmi tanulmányok.
A szóráselemzés gondolatmenete
A kvantum rendszer.
48°. 2, Egy 8 cm-es gyújtótávolságú gyűjtő lencsével nézünk egy tárgyat. Hova helyezzük el a tárgyat, hogy az egyenes állású kép a d = 25 cm-es tiszta.
Az anyagok csoportosítása összetételük szerint
Általános kémia előadás Gyógyszertári asszisztens képzés
24. lecke Nuklein- vegyületek. A nukleotidok Összetett szerves vegyületek építőmolekulái: építőmolekulái:  5 C atomos cukor (pentóz)  Ribóz  Dezoxi-ribóz.
A KÉN
Kristályrács molekulákból
Hivatkozások beillesztése, animációk szerkesztése
Másodrendű kötések molekulák között ható, gyenge erők.
ENZIMOLÓGIA.
Molekulák A molekulák olyan kémiai részecskék, amelyekben meghatározott számú atomot kovalens kötés tart össze. pl.: oxigén: O2; víz: H2O; ammónia: NH3;
A bemutatót összeállította: Fogarasi József, Petrik Lajos SZKI, 2011
Sztereokémia.
Jelkondicionálás.
Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása
Az anyagi rendszer fogalma, csoportosítása
Biotechnológia.
Alkossunk molekulákat!
Fehérjék szabályozása II
Minimum és maximum függvények
A normális eloszlásból származó eloszlások
Előadás másolata:

Comparative Molecular Field Analysis zöld: üres, sárga: zsúfolt régiók piros: negatív, kék: pozitív elektrosztatikus potenciál

Illeszkedés a farmakofórhoz piros: proton akceptor (negatív potenciál) zöld: hidrogén-híd akceptor (negatív potenciál) kék: hidrofób régió (kis elektrosztatikus tér)

Keresés adatbázisban

Vezérmolekula

Ligandum alapú szűrés Célfehérje kiválasztvatalálat (IC50, μM) K-csatorna752 (7,7) Dopamin transzporter 7044 (0,5) Urotenzin II91811 (0,4) Muszkarin M31723 (0,2) HIV-1 integráz34010 (1,5)

Lipinski-féle ötös szabály Ha az alábbiak közül legalább két reláció teljesül, rossz a biológiai elérhetőség (bioavailability) l molekulasúly > 500 l oktanol/víz megoszlási hányados > 5 l H-híd donorok száma > 5 l H-híd akceptorok száma > 10

Adatbázis elemzése 82 ezer biológiai hatást mutató molekula adatai hisztogramm: hány molekula mutatja a jelzett tulajdonságot maximum jellegű eloszlások

Molekulasúly

Lipofilicitás

H-híd donorok száma

Elforgatható kötések száma

Gy ű r ű k száma

Racionális gyógyszertervezés Még nem terveztek teljesen új gyógyszermolekulát a számítógépen Sikerek az optimalizációban Az enantiomerek hatása biztosabban felmérhető, mint a racemátoké: törekedni kell a tiszta enantiomerek előállítására.

Racionális gyógyszertervezés Természetes irányvegyületek: agonisták, enzim szubsztrátok, hírvivő molekulák, stb.

HIV-1 proteáz inhibitorok Röntgen-diffrakció és molekulamechanika segítségével elemezték a kötés jellegzetességeit

HIV-1 proteáz inhibitorok enzimreakció átmeneti állapotával analóg szerkezet

További sikerek

Kimerevítés hatása minimalizálja a lehetséges konformációkat kimerevíti az aktív konformációt farmakofór

Kimerevítés hatása