Magdics Milán.  BME Irányítástechnika és Informatika Tanszék (IIT)  Tanszékvezető: Dr. Szirmay-Kalos László  Főbb kutatási területek:  Globális illumináció.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Nukleáris Képalkotás 2 Rekonstrukció
Advertisements

Élősejtszám meghatározás
Robotika Helymeghatározás.
Globális illumináció (GI)
2D képszintézis Szirmay-Kalos László. Számítógépes grafika feladata képszintézis Virtuális világ modell modellezés Metafórák: 2D rajzolás világ = sík.
Számítógépes grafika Szirmay-Kalos László
Guszejnov Dávid Fizikus BSc, 2. évfolyam Konzulens: Pokol Gergő
Számítógépes grafika Szirmay-Kalos László
3D képszintézis fizikai alapmodellje
Hatékony gyorsítótár használata legrövidebb utak kereséséhez Bodnár István, Fodor Krisztián, Gyimesi Gábor Jeppe Rishede Thomsen, Man Lung Yiu, Christian.
Orvosi képfeldolgozás
Becquerel I. Curie és Joliot Hevesy György
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VII.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Mintavétel Mintavétel célja: következtetést levonni a –sokaságra vonatkozóan Mintavétel.
Előadó: Prof. Dr. Besenyei Lajos
Számítógépes grafika, PPKE-ITK, Benedek Csaba, D képszintézis 4. előadás.
Számítógépes grafika, PPKE-ITK, Benedek Csaba, 2010 Geometriai modellezés 2. előadás.
Következik a Z-bozonnal történő részletes ismerkedés. Ez lesz a délutáni méréseik tárgya is ! Most igazán tessék figyelni és bátran kérdezni is ! Lesz.
A SPECT képalkotás Szigeti Krisztián. A szeminárium menetrendje dátumtémaelméletiklinikai SPECTSzigeti Krisztián (fizikus)Korom Csaba (orvos,
Pozitron Emissziós Tomográfia - Fizika – Műszaki fejlődési irányok
Készítette: Kosztyán Zsolt Tibor
15. A RÖNTGENDIFFRAKCIÓ.
17. RÖNTGENDIFFRAKCIÓ.
15. A RÖNTGENDIFFRAKCIÓ.
Ülepítés gravitációs erőtérben Fényszórás (sztatikus és dinamikus)
Nominális adat Módusz vagy sűrűsödési középpont Jele: Mo
Intelligens Felderítő Robotok
Pozitronemissziós tomográfia
Auger és fotoelektron spektrumok –az inelasztikus háttér modellezése Egri Sándor Debreceni Egyetem, Kísérleti Fizika Tanszék ATOMKI.
Hipotézis vizsgálat (2)
Makai M.: Transzport51 A koordinátázás kérdése Ha a világban meg kell adni egy helyet: fizikai koordináták (x,y,z) (origó és egység) postai címzés pl.
Grafikus alaphardver Szirmay-Kalos László. Jelfeldolgozási megközelítés modellezés modell képszintézis Digitális kép megjelenítés Analog Digitál Képinformáció.
Térfogatvizualizáció
Térfogatvizualizáció
Számítógépes grafika Bevezetés
3D képszintézis fizikai alapmodellje Szirmay-Kalos László Science is either physics or stamp collecting. Rutherford.
Alapsokaság (populáció)
Lineáris regresszió.
A tomográfia matematikája
Költség-minimalizálás az ellenőrző kártyák alkalmazásánál Feladatmegoldás, kiegészítés.
MTA Wigner Fizikai Kutatóközpont Szilárdtest-fizikai és Optikai Intézet Komplex Folyadékok Osztály Folyadékszerkezet Csoport (Csoportvezető: Pusztai László)
A pozitron sugárzás gyakorlati alkalmazása
Fotorealisztikus képszintézis valós időben Szirmay-Kalos László, Csébfalvi Balázs BME IIT.
Röntgen cső Anód feszültség – + katód anód röntgen sugárzás
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) Intervallumbecslések 2014/
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
Üreges mérőhely üreg kristály PMT Nincs kollimátor!
Egyenes vonalú mozgások
Porozitás szelvények Sűrűségmérés. Porozitás meghatározása – szelvényekből Olyan mérések alapján – ahol a kőzetfizikai paraméterben nagy a kontraszt a.
Számítógépes grafika, PPKE-ITK, Benedek Csaba, 2010 Geometriai modellezés 2. előadás.
Informatikai eszközök a virtuális valóság szolgálatában Hapák József ELTE-IK X. Eötvös Konferencia.
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
Máté: Orvosi képfeldolgozás5. előadás1 Mozgó detektor: előnyHátrány állójó időbeli felbontás nincs (rossz) térbeli felbontás mozgójó térbeli felbontás.
MICA képeken. MICA 1. kísérlet Vettünk 6 db 50x50 pixeles képet. Ezeket 1-1 kétdimenziós sűrűségfügvénynek (2D-hisztogram) fogjuk fel, és importance sampling-gel.
A problémakör vázlatosan:
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
GPU megoldások a Medisónál
GPU alapú fotontranszport nagyfelbontású heterogén közegben BME IIT Szirmay-Kalos László Magdics Milán Tóth Balázs.
Vizualizáció és képszintézis Térfogati fényterjedés Szécsi László.
GPU-alapú SPECT képalkotás Wirth András. SPECT képalkotás Single-Photon Emission Computed Tomography.
Bemutatkozás Magdics Milán Született: Budapest, augusztus 30.
Kinetikus Monte Carlo  Bevezetés  Véletlen bolyongás  Residence time algoritmus.
Számítógépes szimuláció Első előadás Gräff József.
Problémamegoldás és számításos feladatok a fizikatanári gyakorlatban Egy rezgőmozgással kapcsolatos feladat elemzése Radnóti Katalin ELTE TTK.
Kontinuum modellek 1.  Bevezetés a kontinuum modellekbe  Numerikus számolás alapjai.
Számítógépes szimuláció
Vizualizáció és képszintézis
III. előadás.
Tomográfiás rekonstrukció
Gazdaságinformatikus MSc
Előadás másolata:

Magdics Milán

 BME Irányítástechnika és Informatika Tanszék (IIT)  Tanszékvezető: Dr. Szirmay-Kalos László  Főbb kutatási területek:  Globális illumináció  Térfogatvizualizáció  Valósidejű képszintézis  Nemfotorealisztikus megjelenítés  Tomográfiás rekonstrukció (GPGPU)

 PET  Hogyan működik?  Mire jó?  A rekonstrukciós algoritmus vázlata  „GPU-barát” fizikai modellezés  Szóródás modellezése

e-e- e+e+ LOR (Line of Response): y l (Mért adat) Intenzitás: x(v) (pozitron bomlások sűrűsége) Ezt kell meghatároznunk! Radioaktív kontrasztanyag Gamma-fotonok e + (pozitron) e-e-

LOR (Line of Response): y l (Mért adat)  A készülék az egyidejű fotonbecsapódásokat regisztrálja (számolja)  4D adat (modulonként 2-2 koordináta) Intenzitás: x(v) (pozitron bomlások sűrűsége) Ezt kell meghatároznunk!

 A detektorlapokat (panel) gyűrű alakban helyezik el  Minden panelt 2D rácson elhelyezett kristályok alkotnak  Általában CT-vel egybeépítve (pl. PET szóródásmodell)

 Általában olyan (radioaktív) anyagot juttatnak a szervezetbe, amelyet a sejtek az anyagcseréjük során felvesznek (pl. cukor)  Így nyomon követhetővé válik az anyagcsere gyorsasága  Diagnosztika: a daganatos sejtek anyagcseréje jóval intenzívebb  Szervműködés: agyműködés feladatok elvégzése közben  Kisállat PET: gyógyszerkísérletek

?? Becsült LOR-ok Mért LOR-ok „Előrevetítés”: A bomláseloszlás egy becsléséből kiindulva, egy minél pontosabb fizikai modellt alkalmazva kiszámoljuk, hogy mit kellene mérnünk: „Becsült LOR-ok” „Visszavetítés”: A becsült és a tényleges, mért LOR-ok aránya alapján korrigáljuk a bomlássűrűségre adott becslést Pontosabb becslés  ML (Maximum Likelihood) becslés célja: megtalálni azt az x(v) bomláseloszlást, amelyet feltételezve a mérés valószínűsége maximális

Az egészet megismételjük, immáron az új, pontosabb becslésből kiindulva Még pontosabb becslés Pontosabb becslés

 A tér egy adott pontjában keletkezett fotonpár bármely detektorpárba becsapódhat  Egy tipikus készülékben „mindössze” néhány detektor, de néhány (százmillió) detektorpár van  A térfogati adatot egy kb (tízmillió) voxelt tartalmazó 3D-rácsban szeretnénk reprezentálni (pl. 256x256x256 ≈ 16 millió)  Minden iterációban 10 8 x10 7 nagyságrendű számítás!  GPU!

Adott: az intenzitás becslése: Cél: várható beütésszám (y i ) meghatározása, LoR-onként Direkt Monte-Carlo: A térfogatot fontosság szerint mintavételezi (x(v)), szimulálja a fotonok útját, az út végén regisztrálja a becsapódás helyét Intuitív, „könnyű” leprogramozni A fizikai jelenségek (pl. szóródás) modellezése azok pontos lemásolásával történhet

Thread GPU memória Thread „Lövés”: GPU-n nem hatékony! Atomi összeadás!

A detektorfelületet mintavételezzük, összegyűjtjük a mintapontokat összekötő utak hozzájárulását Megj: ez (még) mellőzi a szóródást és egyéb fizikai hatásokat x(v) Ray-marching D1 D2 Térszög (D1 D2)

Thread Koherens olvasás! Koherens írás!

 Szóródás, realisztikus detektormodell stb…?  A fotonok explicit módon nem jelennek meg, így nem tudjuk szimulálni az útjukat  A vonalminták fotonok összességét reprezentálják

e-e- e+e+ testen belüli elnyelődés, szóródás: „elnyelődés- ill. szórásmodell” beeső foton szóródott foton z x y φ  ütközés E E’ - Klein-Nishina: - Compton formula: Elektronsűrűség (anyagfüggő – CT mérésből) detektoron belüli elnyelődés, szóródás: „detektormodell”

 Alapötlet: utak újrafelhasználása  1: szóródási pontok generálása  Fontosság szerint  Néhány 100!  2: összekötés a detektorokkal  Utak hozzájárulásának kiszámítása, elnyelődés figyelembevételével  Mintha a szóródási pontok is detektorok lennének  Néhány detektor  3: Szóródási pontok összekötése, utak kiértékelése

 Alapötlet: utak újrafelhasználása  4: Utak kombinálása, LOR-onként  Eredmény: 3-hosszú törtvonalak  Minden, a törtvonalon keletkezett fotonpár tagjai összesen kétszer szóródtak  A szóródási pontokat összekötő szakaszok minden LOR-ra azonosak!

 Alapötlet: utak újrafelhasználása  4: Utak kombinálása, LOR-onként  Eredmény: 3-hosszú törtvonalak  Minden, a törtvonalon keletkezett fotonpár tagjai összesen kétszer szóródtak  A szóródási pontokat összekötő szakaszok minden LOR-ra azonosak!

Szóródás+elnyelődésElnyelődés Csak geometria

 A detektoron belüli szóródás független a méréstől (nem cseréljük ki a kristályokat)  Annak a valószínűsége, hogy a beérkező foton a detektoron belül hogyan szóródik, csak a beesési iránytól függ  És a foton energiájától, de ettől most eltekintünk  Előre leszimulálható a detektoron belüli szóródás eloszlása: „csóvák”  A két foton szóródása független  Elegendő fotononként szimulálni 

 Ha egy adott detektort vizsgálunk, csak a csóván belülről, a csóva által meghatározott valószínűséggel érkezhettek fotonok

1. Detektormodell nélküli előrevetítés 2. Offline (fontosság szerint) generált index-offset minták alapján a már kiszámolt értékek kiolvasása, konvolúció (összeadás) Számítási költség elhanyagolható a ray- marchinghoz képest, így jóval több mintát is vehetünk

 Egy GPU-s implementáció gyakran teljesen más gondolkodásmódot igényel, mint egy nem párhuzamos implementáció  Általában megéri magát a problémát újragondolni, és nem (csak) az implementációs részletekre helyezni a hangsúlyt  Az eltérő megoldásoknak más-más előnyei, hátrányai lehetnek