„Az a folyamat, amíg a gyógyszer a kutatás első lépéseseitől a patika polcaira kerül, gyakran évet vesz igénybe, és millió USD-t emészt fel.” Intelligens informatikai keretrendszer újszerű tudományos eredmények közvetlen alkalmazására a gyógyszerkutatásban – 2 Az ELTE Szerves Kémiai Tanszékének pályázata Témavezető: Dr. Farkas Ödön Résztvevők: Dr. Jákli Imre Kalászi Adrián Imre Gábor
Qiu, X. Y.; Padmanabhan, K. P.; Carperos, V. E.; Tulinsky, A.; Kline, T.; Maraganore, J. M.; Fenton, J. W. Structure of the Hirulog-3 Thrombin Complex and Nature of the S' Subsites of Substrates and Inhibitors. Biochemistry 1992, 31 (47), Racionális gyógyszertervezés jelenlegi szükségletei: Lehetőleg ismert szerkezetű szubsztrát Ismert szerkezetű fehérje - A fehérjék teljes szerkezet-meghatározása költség- és időigényes, gyakran nem is kivitelezhető. - Ismert génekhez tartozó fehérjék ma már rutinszerűen elkészíthetők, a potenciális célfehérjék száma rohamosan nő.
Elméleti háttér Rutinszerűen mérhető Kiszámítható (HPC) A. Kalaszi, F. Hudecz, O. Farkas, Bioactive Conformations, a Thermodynamic Approach to Flexibility, Journal of Chemical Information and Modeling, submitted 2005 ?
“Black box” A módszer működés közben Kalászi, A.; Farkas, O. Lead conformer prediction based on a library of flexible molecules. Journal of Molecular Structure-Theochem 2003, 666,
A pályázat céljai - Nagyteljesítményű számítógép beszerzése - A nagy számításigénnyel járó programrészek tesztelése októberétől a kész alkalmazás web-es hozzáférésének biztosítása - A kész alkalmazás értékesítése a ChemAxon Kft.-n keresztül