Agyatlaszok.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
A sugárterápia folyamata
Advertisements

„az emberek hazudnak, de a bizonyítékok nem”
Szegő Szilvia M unka és pénz (családi és állami) a gyermeknevelő családban Családbarát társadalomgazdaság politikát! Előadás a Társadalomgazdasági Szakosztály.
A SHARE kutatás kínálta elemzési lehetőségek Gál Róbert & Vargha Lili Szirák, 2011.
A SZIP – a mai modern informatikai technológiákat alkalmazva – lehetővé teszi, hogy a drogprevenció, -ellátás, -kutatás területén tevékenykedő szervezetek.
A klinikai adatok és a biológiai minták minőségbiztosításának jelentősége a biobankok életében Magyarósi Szilvia és a SCHIZO-08 Konzorcium tagjai Molekuláris.
Európai Nukleáris Kutatási Szervezet Európai Részecskefizikai Laboratórium Bemutatkozik a CERN 05 Novembre 2003.
Malignus Lymphomák Molnár Zsuzsa O.O.I..
Mutációk.
A FÖLD egyetlen ökológiai rendszer
Az agy felépítése.
Az idegrendszer felépítése és működése
Geometriai Transzformációk
Geometriai transzformációk
Geometriai modellezés
Történelmi leletek analízise a bioinformatikával Klaus Bender, Peter M. Schneider, Christian Rittner – Institute of Legal Medicine, Johannes Gutenberg.
Botyánszki Laczik Rácz
Dr. Balogh Péter egyetemi adjunktus Gazdaságelemzési és Statisztikai Tanszék STATISZTIKA I. 11. Előadás.
Molekuláris genetika Falus András.
A multimédia olyan tartalom, amely többféle csatornát is használ a felhasználók tájékoztatására vagy szórakoztatására. MULTI (latin) = többszörös MÉDIA.
Info-Periszkóp Mezőgazdasági külső információs rendszer fejlesztési tapasztalatai Pető István – Szent István Egyetem, Gödöllő Gazdasági Informatika Tanszék.
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Vizsgálatok a pszichiátriában: Laboratóriumi vizsgálatok, képalkotó eljárások különös tekintettel a sürgősségi betegellátásra Hidasi Zoltán.
Informatikai Vállalkozások Szövetsége E-egészség munkacsoport Lukács Lajos Egészségügyi Infrastruktúra Bevezető gondolatok „
Művelődés és szórakozás
A CONTROLLING MINT INTERDISZCIPLINÁRIS TUDOMÁNY
Kontrolling a kutatás-fejlesztésben
Orbán Ida Országos Tudományos Diákköri Konferencia Április 14.
Javaslat az ágazati információ-politika átalakítására Dr. Kincses Gyula mb. főigazgató MEDINFO.
A légzőszervrendszer betegségei
Az emberi természet természettudományos vizsgálata
„A kulcskompetencia az ismeretek, készségek és attitűdök transzferábilis, többfunkciós egysége, amellyel mindenkinek rendelkeznie kell ahhoz, hogy személyiségét.
Az érdi mammográfiás szakrendelés egy éve
Projektek monitorozása. Elvek és módszerek
Diagnosztika intelligens eszközökkel
Az Alzheimer-kór filozófiája
Összehasonlító pedagógia
Fogyasztói magatartást befolyásoló tényezők
Virtuális endoscopia.
A GYŰJTEMÉNY KVANTITATÍV ELEMZÉSE AZ ELEMZÉS KÉRDÉSE: SZÁMSZERŰEN ÉS ARÁNYAIBAN HOGYAN OSZLIK MEG A GYŰJTEMÉNY?
HOMOSZEXUÁLIS ÉS HETEROSZEXUÁLIS FÉRFIAK PÁRVÁLASZTÁSA
Vizsgálati módszer keresése: Tisztázandó kérdés? Alkalmas módszer?
Gyakorlati alkalmazás Biológiai felmérés és monitoring.
Hipotézis vizsgálat (2)
Szemmozgáskövetési rendszer fejlesztése és térképészeti alkalmazása Térképtudományi és Geoinformatikai Tanszék, Eötvös Loránd Tudományegyetem Dr. Török.
A Z ANOREXIA ÉS A BULIMIA NERVOSA KÖZÖTTI KAPCSOLAT MEGÉRTÉSE EGY SVÉD NEMZETKÖZI IKERMINTÁN Kovács Petra BME Kognitív pszichológia I. évfolyam Április.
Adatleírás.
Régi fenológiai adatforrások: az éghajlatváltozás detektálásának kihasználatlan lehetőségei Csecserits Anikó & Czúcz Bálint MTA Ökológiai és Botanikai.
Avagy: Mit lát a pitypang magja repülés közben?
Máté: Orvosi képfeldolgozás8. előadás1 Kondenzált képek Transzport folyamat, pl. mukocilliáris klírensz (a légcső tisztulása). ROI kondenzált kép F 1 F.
Gének, környezet, viselkedés
Temperamentumok Mit jelent az örökletesség? Evolúciós megfontolások
A VORD használata és alkalmazási lehetőségei Szoftvertechnológia szorgalmi feladat 2007 Simonkovics Noémi & Bíró Ádám.
Marketing információs
A költségteljesítmény mérése (költség kontroll) A költségek pontos mérése kritikus fontosságú a projekt előrehaladása során, mert a költség a termelékenység.
Máté: Orvosi képfeldolgozás12. előadás1 Regisztrációs probléma Geometriai viszony meghatározása képek között. Megnevezései: kép regisztráció (image registration),
1.  Szerzői:  Panagiotis Bouros (University of Hong Kong),  Shen Ge (University of Hong Kong),  Nikos Mamoulis (University of Hong Kong)  Esemény:
Máté: Orvosi képfeldolgozás12. előadás1 Három dimenziós adatok megjelenítése Metszeti képek transzverzális, frontális, szagittális, ferde. Felület síkba.
GPU megoldások a Medisónál
BIOLÓGIA TÁRGYA, RÉSZTUDOMÁNYAI, SZERVEZŐDÉSI SZINTEK
Pozitron Emissziós Tomográfia (PET) olyan nukleáris orvosi képalkotási technika, amely - három dimenziós felvételt készít a test egy kiválasztott részének.
Az egészségügyi szakképzés minőségügye, kihívások és intézkedések György Annamária szeptember 17. "ISOFÓRUM XXII. NMK"
A friss hal és haltermékek fogyasztói megítélése 2014-ben Ózsvári László – Fodor István – Bódi Barbara – Kasza Gyula HALÁSZATI TUDOMÁNYOS TANÁCSKOZÁS SZARVAS,
Pozitron Emissziós Tomográfia (PET)
AZ IDEGRENDSZER FELÉPÍTÉSE ÉS MŰKÖDÉSE
AGY 1350 gramm 100 milliárd neuron 100 md X10 ezer szinapszis
HAJLÉKTALANSÁG ÉS DROGHASZNÁLAT
Mozgásvizsgálat gyakorlat
Virtuális endoscopia.
Előadás másolata:

Agyatlaszok

Michelangelo: Ádám teremtése Pons : híd Spinal cord: gerincvelő Pituitary gland: pajzsmirigy Pituitary gland: hipofízis

Az emberi agy Kb. 1300 g 1 – 10 milliárd idegsejt Elő, közép és utóagy Agytörzs Kisagy Köztiagy Agykéreg Fehér, és szürkeállomány Nagyagy: érzékelés központja Kisagy: mozgás koordináció, egyensúly Köztiagy: hőszabályozás Agytörzs: légzés, szívverés Agykéreg: magasrendű működések, limibikus rendszer

Sztereotaxiális koordinátarendszer mm - ben kifejezett koordináták A Talairach-féle sztereotaxiás koordináta-rendszer. A rendszer fő tengelye az agy két jellegzetes struktúráját, az első és a hátsó komisszurát (commissura anterior - commissura posterior) összekötő tengely (y tengely), melyre merőlegesen helyezkedik el a rendszer két másik fő tengelye (x és z). Az egyes agyi struktúrák helye megadható mm-ben vagy az agyra illesztett térháló elemeinek koordinátáival (pl. E-8-c). Az ábrákon az agy hátul-, oldal-, illetve felül nézetből látható; a kontúrok az agy legnagyobb keresztmetszeti képeit jelölik. A felső és jobb oldali keretek melletti számok mm-ben adják meg az átlagos emberi agy méreteit. A jobb alsó képelemen a Talairach-féle háromdimenziós proporcionális térrács látható, amelybe - aktuális nagyságtól és formától függetlenül - minden agy beilleszthető, s így az agyon belüli struktúrához a rácsrendszer egy-egy téreleme rendelhető

Talairach atlasz Post mortem metszetképek Átlagosnak tekintett, egészséges 60 éves férfi Könyv formában 1983 Talairach-féle koordináta rendszer

Nukleáris képalkotó eljárások Komputer tomográfia ( CT ) Gamma kamera (SPECT) Pozitron emissziós tomográf (PET) Compton kamera Mágneses rezonanciás kép - alkotás (MRI: T1, T2, fMRI ) … Funkcionális… In Vivo !!!!

? Problémák Összehasonlítás Ezen problémák miatt lett szükség az agyatlaszokra. ? Individum összevetése a Talairach - atlasszal

Geometria Transzformációk: - eltolás - forgatás - nyírás - skálázás, nyújtás Regisztráció Standarizálás Regisztráció: optimalizációs eljárás, azt a geometriai transzformációt keresi, mely a legjobban fedésbe hozza a két képet Standardizálás: a refenciaképnek a standardhez, templáthoz történő illesztése

Korai agyatlaszok regisztráció Viszonylag kevés alany Atlasz struktúra – funkció 3D : coronal, axial, sagittal Karolinska Institute Human Brain Atlas ( HBA ) (templát: 1 konkrét agy post mortem feldolgozása) -Montreal Neurological Institute MNI (305 fiatal alany MRI T1 felvétele)

Hátrányok Problémák: merev rugalmatlan rendszert kapunk Többféle koordináta rendszer az individumok közötti varianciára vonatkozó információk elvesznek szeretnénk komplex információkat kapni az egész emberi fajra vonatkozóan (populációs tényezők)

Neurológia rengeteg kutatás, 13000 prezentáció évente Részterületekre bomlás => kellene egy egységes referenciarendszer Hatalmas feldolgozandó anyagmennyiség Információ technológiai problémák Hasonló helyzet, mint pár éve a genetikában => komplex adatbázisrendszer létrehozása

Modern agyatlaszok regisztráció adatbázisrendszer Valószínüségi agyatlasz Sok alany, egyéb információk PL.: Whole Brain Atlas (Harvard) Allen Brain Atlas (Genom-wide mouse brain atlas) The Human Brain Atlas Michigan ICBM Atlas (UCLA LONI) 

International Consortium for Brain Mapping (ICBM) Valószínüségi atlasz: - alanyok közti különbségek - demográfiai, klinikai és genetikai adatok - adatbázis szemlélet - voxel alapú - szubpopulációk - 3 térbrli nézet coronal, axial, sagittal

Valószínűségi Atlasz Vizualizációs area, primer, szekunder 0 – 100% Düsseldorf 10 alany  1 referencia MRT képek, standardizálás A szín azt mutatja, hogy az adott voxel hány alany esetén tartozott az areahoz.

Mintavétel Nagy populáció használata: mintavétel: - 7000 normális alany (171 ikerpár) - nagy etnikai változatosság - 18 – 90 Adatok gyűjtése: - MRI mindenkinek, fMRI, PET … - egészségügyi, pszichológiai adatok - oktatás - DNS minták gyűjtése (5800 esetben) - viselkedés, étkezési szokások, család

Az ICBM Brain Atlas felépítése

Szervezés A konzorcium tagjai: 7 ország 9 laboratóriuma Konzisztencia Problémamegoldás menete

Warping, segmentation AIR DISPLAY INSECT ANIMAL DISPLAY: voxelek megcímkézése, interaktív 3D-s bejárás INSECT: szövet azonosítás (pl. szürke, v fehérállomány), MRI alapján , intenzitás korrekció ANIMAL: automatikus címkézés, illeszti a képet a már címkézetthez, 3D deformációs mezőt képez…

4D atlasz Időbeli információk Életkor: 18 – 90 Agyi folyamatok időbelisége: MRI, EEG Újabb réteg: pl.: receptor density, blood flow changes, …

Adatbázis tervezése Még nem készült el az átfogó adatbázis Tervek: - voxelalapú, 3D adatbázis, + 4. Dimenzó - elektronikus elérhetőség - lekérdezések, keresések az aktuális formának megfelelően ( 2D image, 3D block, …) Ez bonyolult információ technológiai probléma ( pl.: voxel: 1mm3  mikroszkópikus, szövettani információk beillesztése)

ICBM Probabilistic Brain Atlas and Reference System

Agyatlaszok állatoknak Egér (pl. harvard) Majom ( Brainmuseum) Delfin Alkalmazás: farmakológiai kísérletek

Mire jó tehát az Agyatlasz? Klinikai kutatások Populációs információk Betegségek lefolyásának vizsgálata normál, és kísérleti körülmények között (Alzheimer, autizmus, skrizofrénia, szklerózis multiplex) Egységes referencia az agykutatás területén A struktúra és a funkció kapocsolatának feltérképezése Új neurobiológiai információk