Arabidopsis thaliana tip120/cand1 T-DNS inszerciós mutáns jellemzése.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Utazás a sejtben Egy átlagos emberi sejt magja megközelítőleg 510-15 gramm mennyiségű és 1,8-2 méter hosszúságú (3000 millió bázispárnyi) DNS-ből,
Advertisements

IV. rész DNS-RNS-fehérje eukariótákban
BIOTECHNOLÓGIA D MsC gyakorlat
A mutagenezis célja, haszna Mutáció Az egyed megjelenése (fenotípusa) megváltozHAT Ebből visszakövetkeztethetünk a mutációt szenvedett gén funkciójára.
III. rész DNS-RNS-fehérje prokariótákban
Készítette: Bacher József
Mutációk.
DNS replikáció Szükséges funkciók Iniciáció
Kromoszóma és replikáció
Genetikai szabályozó hálózat B. Subtilis-ban
Szabályozás Transzkripció, transzláció, enzimaktivitás, fehérje koncentráció, efektor molekulák.
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
DNS replikáció: tökéletes másolat osztódáskor
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
A génaktivitás szabályozása
A DNS Szekvenálás 2008 Géntechnikák labor.
Fehérjeszintézis Szakaszai Transzkripció (átírás)
Génexpresszió szabályozása szintetikus oligonukleotidokkal
Rekombináns fehérjék termeltetési stratégiái
Az intergénikus régiók és a genom architektúrájának kapcsolata Craig E Nelson, Bradley M Hersh és Sean B Carrol (Genome Biology 2004, 5:R25) Bihari Péter.
Antibiotikumok fejlesztése a genomika segítségével
Real-Time PCR gyakorlati alkalmazások bevezetés Párosítsuk a gélfotóra felvitt mintákat a megfelelő olvadáspontú termékekkel!
Strukturális genomika Gyakorlati feladatok. SNP-k és vizsgálatuk Mi az SNP?
Genome2D: bakteriális transzkriptóma megjelenítését szolgáló eszköz (szoftver) Csernetics Árpád Bioinformatika SZIT ápr. 18.
A génszabályozás prokariotákban és eukariótákban
Információhordozó makromolekulák
Molekuláris genetika Falus András.
Kedvenc Természettudósom:
génszabályozás eukariótákban
Génexpresszió (génkifejeződés)
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
SV40 infekció transzformált sejt. „korai” gének (early - E) „késői” gének (late - L) 4.7 kb SV40 genom - kicsiny „tanulóvírus” fertőzést követően először.
 bakteriofág két élete lizogénialízis E. coli.
2009. november 26. Transzgének expressziós profiljának felvétele Transzgének expressziós profiljának felvétele Kukoricabogár- és herbicid-rezisztens növények.
DNS amplifikáció pl . DNS szekvenálásnál nagy jelentősége van
Egészségügyi mérnököknek 2010
Egészségügyi mérnököknek 2010
Az öröklődés - Dedičnosť
Arabidopsis thaliana tip120 inszerciós mutáns jellemzése
A genetika (örökléstan) tárgya
Protein szintézis Protein módosítás 3. Protein transzport.
Nukleinsavak és a fehérjék bioszintézise
IN VITRO MUTAGENEZIS Buday László.
A P elemek mobilitásának szabályozása
A P elem technikák: enhanszerek és szupresszorok azonosítása
A foszfát csoport az S, T és Y oldalláncok hidroxil- csoportjához kapcsolódik.
Készítette: Czigléczki Gábor
Az egyedfejlődés második rész.
Replikáció, transzkripció, transzláció
Sejtmag II. Dr. habil. Kőhidai László
Immunbiológia - II. A T sejt receptor (TCR) heterodimer CITOSZÓL EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN kötőhely  lánc  lánc VV VV CC CC VV VV
2004-es kémiai Nobel-díj. Díjazottak Aaron Ciechanover Avram HershkoIrwin Rose The Nobel Prize in Chemistry 2004 was awarded jointly to Aaron Ciechanover,
Kromoszóma és replikáció
DNS szintézis, replikáció Információ hordozó szerep bizonyítéka Avery-Grifith kísérlet Bakterifágos kísérlet.
34. lecke A fehérjék felépítése a sejtben. Lényege: Lényege:  20 féle aminosavból polipeptidlánc (fehérjelánc) képződik  A polipeptidlánc aminosav sorrendjét.
Vakcinák. Edward Jenner Fekete himlő Tehén himlő Fekete himlő Tehén himlő
Polimeráz Láncreakció:PCR, DNS ujjlenyomat
RNS TUMORVÍRUSOK (Retrovírusok)
Génexpresszió szabályozása I
Replikáció Wunderlich Lívius 2015.
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
The lactose (lac) operon - an example for prokaryotic gene regulation
Új molekuláris biológiai módszerek
Proteomika, avagy a fehérjék „játéka”
Molekuláris biológiai módszerek
A DNS replikációja Makó Katalin.
A génexpresszió és az ezzel kapcsolatos struktúrák
Új molekuláris biológiai módszerek
Előadás másolata:

Arabidopsis thaliana tip120/cand1 T-DNS inszerciós mutáns jellemzése

A TIP120 fehérje szerepe a transzkripcióban

A fehérjeszintézis fő lépései Fehérje DNS RNS Transzkripció Transzláció

Az eukarióta gének transzkripciója Három fő lépés: iniciáció iniciáció elongáció elongáció termináció termináció

INICIÁCIÓ A transzkripció megindításához szükséges fehérjefaktorok egy komplexet hoznak létre transzkripciós iniciációs komplex A transzkripció megindításához szükséges fehérjefaktorok egy komplexet hoznak létre transzkripciós iniciációs komplex A komplex kapcsolatba lép a gén promóter régiójával, ezáltal lehetővé teszi az RNS szintézist A komplex kapcsolatba lép a gén promóter régiójával, ezáltal lehetővé teszi az RNS szintézist

Hat általános fehérjefaktor vesz részt a transzkripciós iniciációban: TFIID TFIID TFIIA TFIIA TFIIB TFIIB TFIIE TFIIE TFIIF TFIIF TFIIH TFIIH

Transzkripciós iniciációs komplex TFIID TATA-box TFIIA TFIIB Polimeráz II TFIIF

A TIP120 fehérje TBP-vel kölcsönható faktor TBP-vel kölcsönható faktor 1230 aminosavból álló polipeptidlánc 1230 aminosavból álló polipeptidlánc A polimeráz II és a TFIID TBP alegységét köti össze A polimeráz II és a TFIID TBP alegységét köti össze

TBP RNS-polimeráz II TIP120

Arabidopsis tip120 gén a gén expressziója igen alacsony a gén expressziója igen alacsony elsősorban osztódó szövetekben aktív elsősorban osztódó szövetekben aktív

A CAND1 fehérje szerepe a fehérjebontásban

Az ubiquitin erősen konzervált erősen konzervált 76 aminosavból áll 76 aminosavból áll globurális fehérje globurális fehérje Az ubiquitin számos sejtfolyamat,pl. endo- citózis,transzkripció, DNS hibajavítás előfeltétele. Az ubiquitin számos sejtfolyamat,pl. endo- citózis,transzkripció, DNS hibajavítás előfeltétele.

ubiquitin E1 E2 E3 célfehérje

SCF-komplex Négy alegység: Skp1 Skp1 Cullin/Cdc53 Cullin/Cdc53 F-boksz fehérje ! F-boksz fehérje ! Rbx1/Hrt1/Roc1 Rbx1/Hrt1/Roc1

CUL1 Az SCF-komplex összeszerelődését szabályozza Az SCF-komplex összeszerelődését szabályozza Nagy része a TIP120-szal alkot komplexet Nagy része a TIP120-szal alkot komplexet TIP120 a fő cullin kötő fehérje TIP120 a fő cullin kötő fehérje

CAND1 Cullin-Associated Nedd8-Dissociated protein1 TIP120=CAND1 TIP120=CAND1

A TIP120/CAND1 fehérje tehát részt vesz A TIP120/CAND1 fehérje tehát részt vesz -a transzkripció iniciációjában -a fehérjedegradáció szabályozásában

Mutáns növények fenotípusának jellemzése Törpe növés Törpe növés Kisebb virág, kései virágzás Kisebb virág, kései virágzás Redukált szaporítóképesség Redukált szaporítóképesség Gyökérnövekedés intenzitása a normálisnál kisebb Gyökérnövekedés intenzitása a normálisnál kisebb

A PCR reakció stratégiája T-DNS LB21 H911BH911A5’3’

PCR reakció várható eredménye T-DNS inszerció nincs Heterozigóta mutáns Homozigóta mutáns H911A+H911B primerek + + _ H911B+LB21 primerek _ + +

H911A+H911B primerekkel végzett reakció eredménye H911B+LB21 primerekkel végzett reakció eredménye dwhet col T-DNS inszerció nincs Heterozigóta mutáns Homozigóta mutáns H911A+H911 B primerek + + _ H911B+LB21 primerek _ + +

Összefoglalás Törpenövés, redukált szaporítóképesség Törpenövés, redukált szaporítóképesség T-DNS inszerció tip120/cand1 génben T-DNS inszerció tip120/cand1 génben Gyökérnövekedés kisebb Gyökérnövekedés kisebb Homozigóta inszerció törpe fenotípus Homozigóta inszerció törpe fenotípus