Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Az onkológiai betegek pszicho-szociális szükségleteinek felmérése
Advertisements

„az emberek hazudnak, de a bizonyítékok nem”
A mutagenezis célja, haszna Mutáció Az egyed megjelenése (fenotípusa) megváltozHAT Ebből visszakövetkeztethetünk a mutációt szenvedett gén funkciójára.
KŐVIRÁG 6.
Genetikai vizsgálatok jelentősége
Mutációk.
Delta Bio 2000 Kft. Ügyvezető: Dr. Haracska Lajos
A legfontosabb neurogenetikai betegségek előfordulási gyakorisága
AZ ELLENANYAG SOKFÉLESÉG GENETIKAI HÁTTERE
Elektroforézis Általában agaróz a hordozó
A humán genom projekt.
Az intergénikus régiók és a genom architektúrájának kapcsolata Craig E Nelson, Bradley M Hersh és Sean B Carrol (Genome Biology 2004, 5:R25) Bihari Péter.
Real-Time PCR gyakorlati alkalmazások bevezetés Párosítsuk a gélfotóra felvitt mintákat a megfelelő olvadáspontú termékekkel!
Strukturális genomika Gyakorlati feladatok. SNP-k és vizsgálatuk Mi az SNP?
A Mendel-i öröklődés Falus András
Molekuláris genetika Falus András.
Antigén receptorok Antitest, T sejt receptor A repertoire (sokféleség) kialakulása Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Falus András.
RADVÁNSKÝ János1, BAŤOVÁ Monika3, REŠKO Péter1, PÁLFFY Roland2
A PMP22 gén mutációs analízise
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító.
Polimeráz láncreakció (PCR)
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
A szívelégtelenség diagnózisa június Dr. Andréka Péter Semmelweis Egyetem II. sz. Belgyógyászati Klinika.
Buccalis kenet a connexin-26 gén 35delG mutációjának non-invazív szűrésére kisgyermekeken Torkos Attila 1,2, Magnus Teschner 2, Peter Erfurt 2, Gerrit.
Öröklődés molekuláris alapjai
Az egész testünket izmok sokasága építi föl. Ezek teszik lehetővé, hogy különböző mozgásokra legyünk képesek. Ezek működését többféle kisebb- nagyobb.
DNS chipek, DNS hibridizáció
A sclerosis multiplex immunmoduláló kezelése
A Down szindróma (DS) szűrési eredményei a VRONY adatai alapján
Béres J, Vas Sz, Kalmár L, Sényi K, Andrikovics H, Tordai A
Az OPMD genetikai oka a PABP2 gén rövid GCG Repeat Expanziója
Dystrophin immunoblot (Western blot) N N DMD N N BMD N.
Ser Thr PROTEIN O Mannose N-acetyl glucosamine GalactoseSialic acid 1212 1414 2323 POMT1POMGnT1B4GALTsST3GALs MEBWWS kontrol MEB  -DG  -DG.
A herediter sensorimotoros neuropathiák (HSMN) – Charcot-Marie-Tooth betegségek (CMT) genetikai háttere Karcagi Veronika FJ Országos Közegészségügyi Központ.
Leigh syndroma A biokémiai vizsgálat irányadó!!!
Mitochondriális encephalomyopathiák
Arabidopsis thaliana tip120 inszerciós mutáns jellemzése
Az Alzheimer-kór filozófiája
AZ ELLENANYAG SOKFÉLESÉG GENETIKAI HÁTTERE. AZ ELLENANYAGOK SZERKEZETE KOMPLEMENT AKTIVÁCIÓ SEJTHEZ KÖTŐDÉS LEBOMLÁS TRANSZPORT Könnyű lánc (L) Nehéz.
Az ember egyszerű mendeli genetikája
A genetika (örökléstan) tárgya
Domináns episztázis – lovak
Génsebészet Cseh Zsófia.
Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika
Kognitív funkciók genetikai alapjai A genetikai variáció forrásai és vizsgálati lehetőségei Réthelyi János Semmelweis Egyetem, Pszichiátriai és Pszichoterápiás.
IN VITRO MUTAGENEZIS Buday László.
A P elemek mobilitásának szabályozása
A P elemek felfedezése, felépítése és mobilitásuk mechanizmusa
A P elem technikák: enhanszerek és szupresszorok azonosítása
A SEJTCIKLUS ÉS A RÁK KAPCSOLATA
A molekuláris evolúció neutrális elmélete
Alzheimer- kór (AD, Alzheimer’s disease)
Kromoszómák, kromoszóma-aberrációk
Gének, környezet, viselkedés
AZ ELLENANYAG SOKFÉLESÉG GENETIKAI HÁTTERE. AZ ELLENANYAGOK SZERKEZETE KOMPLEMENT AKTIVÁCIÓ SEJTHEZ KÖTŐDÉS LEBOMLÁS TRANSZPORT Könnyű lánc (L) Nehéz.
Fehérjeszekvenálás Mikronalalitikai kurzus fehérjeszekvenálás.
DNS szintézis, replikáció Információ hordozó szerep bizonyítéka Avery-Grifith kísérlet Bakterifágos kísérlet.
Márk Ágnes, Barna Gábor, Csomor Judit, Kriston Csilla, Matolcsy András
Új molekuláris biológiai módszerek
Géntechnikák labor kiselőadás Készítette: Nagy Zsuzsanna
KÓRHÁZI ACINETOBACTER BAUMANNII TÖRZSEK JELLEMZÉSE
Új molekuláris biológiai módszerek
FOGALMAK DNSasfehérje (szabályozó/szerkezeti)
Molekuláris biológiai módszerek
Új molekuláris biológiai módszerek
Készítette:Tóth Karolina
EPIGENETIKA OLYAN JELENSÉGEKKEL FOGLALKOZIK, AMELYEK KÖVETKEZTÉBEN
Előadás másolata:

Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata Pikó H., Balog J. Herczegfalvi Á., Mayer P., Mechler F., Horváth R., Karcagi V. Fodor József Országos Közegészségügyi Központ Bethesda Gyermekkórház, DEOE Neurológiai Klinika, Hódmezővásárhelyi Kórház, Jahn-F. Dél-pesti Kórház

Izomdystrophiák Duchenne/Becker izomdystrophia (DMD/BMD) Facioscapulohumeralis izomdystrophia (FSHD)

Általános jellemzők, klinikai tünetek Előfordulási gyakoriság - DMD 1:3500, BMD 1:30000 X kromoszómához kötött recesszív öröklődésmenet A betegség kezdete 2 éves korra tehető, fokozatos progresszióval Az elhalálozás ideje 20-25 éves korban A Becker típus esetén enyhébbek a tünetek, nincs korai halál

A betegség genetikai háttere, pathomechanizmusa A dystrophin gén (Xp21) 2.5 Mb méretű, 79 exont tartalmaz és 14 kb méretű mRNS-t kódol A géntermék a dystrophin fehérje (427 kDa), amely sarcolemmális lokalizációt mutat a dystrophin- asszociált glycoprotein komplex részeként A DMD esetén a dystrophin teljes hiánya, BMD esetén csökkent mennyisége mutatható ki

A betegség kialakulásában szerepet játszó géndefektusok Deléciók (60%), hot-spot régiók a gén proximalis és distalis részén Duplikációk (5%) Pontmutációk (35%) Minden harmadik esetben új mutáció alakul ki A mutáció következményei (frame-shift hipotézis) „in-frame” mutáció - BMD fenotípus „out of frame” mutáció - DMD fenotípus

Molekuláris diagnosztikai vizsgálatok Multiplex PCR reakció – 2 x 9 exon vizsgálata egyidejüleg Southern blot analízis – cDNS próbákkal ( XJ10, 7b8, 30.2, 30.1, 47.4, 60.1) Immunohistochemia Western blot technika – fehérje analízis

Multiplex PCR deléciós analízis

Southern hibridizáció XJ10 cDNS próbával (HindIII és BglII emésztés)

Eredmények Eddig 100 betegnél végeztük el a multiplex PCR analízist, amely alapján a betegek 57%-ában deléciót mutattunk ki Négy esetben végeztünk prenatális vizsgálatot A feltételezett hordozó anyák és leánytestvérek (31 fő) cDNS vizsgálata során 18 esetben bizonyítottuk a hordozósági státuszt Az új módszerek bevezetése a DMD/BMD betegség molekuláris genetikai vizsgálatában lehetőséget biztosít az alábbi célok megvalósításához: deléciók méretének pontos meghatározása de novo mutációs esetek azonosítása hordozósági státusz vizsgálata prenatális vizsgálatok felajánlása

Az FSHD molekuláris háttére (1.) Öröklődésmenete autoszómális domináns, de nem teljes penetranciával (95%-os) A 4q és 10q kromoszómák szubtelomerikus régiójában található D4Z4 ismétlődő szekvenciák A betegekben a 4q35 régióban DNS átrendeződés történik, a D4Z4 szekvenciák száma csökken Eltérő restrikciós térkép: - a 4q35 régióban csak egy D4Z4 tartalmaz BlnI hasítási helyet - a 10q26 régióban minden egyes D4Z4 tartalmaz BlnI hasítási helyet

Az FSHD molekuláris háttére (2.) A p13E-11 polimorf próba detektálja EcoRI emésztés után: 4q35 38kb-300kb (egészséges), 10kb-38kb (beteg) 10q26 20kb-320kb Komplikáló tényező: szubtelomerikus kicserélődések a 4q35 és 10q26 régió között (a populáció 20%-ában) - PFGE alkalmazása ill. dózis teszt EcoRI fragmentum mérete korrelál a betegség súlyosságával és a tünetek megjelenésének időpontjával De novo mutációk is→ juvenilis formák

Southern analízis értékelése <38kb BlnI rezisztens fragmentum FSHD <38kb BlnI szenzitív fragmentum dózis teszt 10-es típusú repeatek túlsúlyban FSHD 4-es típusú nem FSHD repeatek túlsúlyban

Dózis analízis Southern hibridizációval

FSHD genotípus ikrekben Súlyos, infantilis típus, de novo mutációval, 1 D4Z4 repeat elem maradt 4q35: p13E-11 próbával a betegek EcoRI fragmentuma <38 kb, BlnI rez.

FSHD molekuláris vizsgálataink eredményei (2000.-2004.) Család 38 Eredmény Tünet-mentes Beteg Össz fő 78 pozitív - 32 55 negatív 18 9 23 folyamatban 5 14