Génexpresszió más (nem-E.coli) prokariótában

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Utazás a sejtben Egy átlagos emberi sejt magja megközelítőleg 510-15 gramm mennyiségű és 1,8-2 méter hosszúságú (3000 millió bázispárnyi) DNS-ből,
Advertisements

BIOTECHNOLÓGIA D MsC gyakorlat
Lehetnek számunkra hasznosak a mikrobák?
Tisztítás, fertőtlenítés
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
Fehérjeszintézis Szakaszai Transzkripció (átírás)
Rekombináns fehérjék termeltetési stratégiái
Biotechnológia Mikroorganizmusok - 2.
Antibiotikumok fejlesztése a genomika segítségével
Genome2D: bakteriális transzkriptóma megjelenítését szolgáló eszköz (szoftver) Csernetics Árpád Bioinformatika SZIT ápr. 18.
C mIg H mIg L TCR  TCR  T-SEJT  C V Antigén receptor TCR A B- ÉS T-SEJTEK ANTIGÉN FELISMERŐ RECEPTORAI HASONLÓ SZERKEZETŰEK TCR =  +  A.
Az immunoglobulin szerkezete
Egyéb öröklődési típusok és epigenetika Láng Orsolya október 20.
Kedvenc Természettudósom:
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító.
Az orvosi biotechnológiai mesterképzés megfeleltetése az Európai Unió új társadalmi kihívásainak a Pécsi Tudományegyetemen és a Debreceni Egyetemen Azonosító.
génszabályozás eukariótákban
Az Örökítőanyag.
Génexpresszió (génkifejeződés)
Vezikuláris transzport
ALLOSZTÉRIA-KOOPERATIVITÁS
A nukleinsavak.
Nukleusz A sejt információs rendszere
Heterológ fehérje-termelés prokarióta expressziós rendszerekben
Eukarióták Fő genetikai jellemzők Például az élesztő
Transzdukció Bakteriofágok közvetítte genetikai információ csere
 bakteriofág két élete lizogénialízis E. coli.
GAZDA GRAS: generally recognized as safe Intracelluláris / szekréció Proteázok Termelés, szekréció szinkronizálás Gazda kialakítása.
Hemicellulóz és lebontása
Poszttranszlációs módosítások Készítette: Cseh Márton
Plazmidok Készítette: Vásárhelyi Miklós. : E. Coli jól használható genetikai kísérletekben: Genomja kicsi(4,2*10 6 bázispár, kb. ezrede az emberének)
Génmanipulált növények biztonsága Smeller Margit
Készítette: Leidecker Orsolya
Biopeszticidek Készítette: Nagy Gábor (VODQM9)
Elektroporáció.
Készítette: Kiss László
2009. november 26. Transzgének expressziós profiljának felvétele Transzgének expressziós profiljának felvétele Kukoricabogár- és herbicid-rezisztens növények.
Készítette: Sólyom Katalin Április 22.
FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓ
Egészségügyi mérnököknek 2010
A tápcsatorna funkciói:
C mIg H mIg L TCR  TCR  T-SEJT  C V Antigén receptor TCR A B- ÉS T-SEJTEK ANTIGÉN FELISMERŐ RECEPTORAI HASONLÓ SZERKEZETŰEK TCR =  +  A.
Hogyan képes a B sejt csak egyfajta könnyű és egyfajta nehéz láncot kifejezni? –Annak ellenére, hogy minden B sejtben egy apai és egy anyai Ig lókusz is.
Lineáris programozás.
Nyitott biologiai rendszerek
AZ ÁLLATI ÉS A NÖVÉNYI SEJT ÖSSZEHASONLÍTÁSA
Biopeszticidek Készítette: Pásztor András március 22.
A P elem technikák: enhanszerek és szupresszorok azonosítása
Az eukarióta sejtciklus szabályozása
Vezikuláris transzport Dr. med. habil. Kőhidai László Egyetemi docens Semmelwesi Egyetem, Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet október 16.
Immunbiológia - II. A T sejt receptor (TCR) heterodimer CITOSZÓL EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN kötőhely  lánc  lánc VV VV CC CC VV VV
2004-es kémiai Nobel-díj. Díjazottak Aaron Ciechanover Avram HershkoIrwin Rose The Nobel Prize in Chemistry 2004 was awarded jointly to Aaron Ciechanover,
PLAZMA SEJT ANTIGÉN CITOKINEK B-SEJT A B – SEJT DIFFERENCIÁCIÓT A T-SEJTEK SEGÍTIK IZOTÍPUS VÁLTÁS ÉS AFFINITÁS ÉRÉS CSAK T-SEJT SEGÍTSÉGGEL MEGY VÉGBE.
Laky Dóra Ózon és ultraibolya sugárzás felhasználása ivóvíz fertőtlenítésre Konzulens: Dr. Licskó István Prof. Tuula Tuhkanen szeptember 25.
Fehérjeszekvenálás Mikronalalitikai kurzus fehérjeszekvenálás.
Sejtek genetikai módosítása (gének bevitele vagy eltávolítása)
Escherichia coli baktérium
TÁPLÁLOKOK, TÁPANYAGOK
DNS szintézis, replikáció Információ hordozó szerep bizonyítéka Avery-Grifith kísérlet Bakterifágos kísérlet.
34. lecke A fehérjék felépítése a sejtben. Lényege: Lényege:  20 féle aminosavból polipeptidlánc (fehérjelánc) képződik  A polipeptidlánc aminosav sorrendjét.
Vakcinák. Edward Jenner Fekete himlő Tehén himlő Fekete himlő Tehén himlő
RNS TUMORVÍRUSOK (Retrovírusok)
Mikrobák mennyiségi meghatározása
Replikáció Wunderlich Lívius 2015.
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
lecke A gének megváltozása. A génösszetétel megváltozása
Új molekuláris biológiai módszerek labor
Proteomika, avagy a fehérjék „játéka”
EPIGENETIKA OLYAN JELENSÉGEKKEL FOGLALKOZIK, AMELYEK KÖVETKEZTÉBEN
Előadás másolata:

Génexpresszió más (nem-E.coli) prokariótában Bacillus subtilis elsőként (az E.coli után) http://www.danforthcenter.org/Cells/images/

Miért termeltessünk heterológ fehérjét Bacillus subtilis-ban? Sok fehérje kiválasztása a tápoldatba, nagy mennyiségben ! SZEKRÉCIÓ! 2) Nincs patogén törzs 3) Jól ismert, nagy térfogatú ipari fermentációk Hátrányok: 1) Korlátozott számú vektor 2) Az optimalizált vektor rendszerek védettek 3) Nem glikozilez 4) Sok proteáz – terméket tönkre teszi

Optimalizált B. subtilis “Cell Factory”? A B. subtilis genom 12% -ának deléciója, nincs rá szükség a növekedéshez A felszabaduló energia a termék-képződésre fordítódhat. x x x x x

2) A Bacillus subtilis Sec-függő és Sec-független szekréciós útvonalai alaposan tanulmányozhatók és valószínűleg javíthatók is A szekréciós útvonal utolsó lépései problémásak, amelyek citoplazma membránon történő transzlokációt követik. a) A SipS (SPáz) túltermeltetése segít A későbbi proteolízis a fő probléma. A transzlokálódott fehérjék másodlagos szerkezete a sejtfal környezetben alakul aktívvá és proteáz rezisztenssé. b) ezt pl. a PrsA, a tiol-diszulfid reduktázok és kationok (pl. Ca2+ és Fe3+) katalizálják.

Néhány termék Enzimek Finom vegyszerek Poliszacharidok Proteázok Amilázok Finom vegyszerek Aminosavak vitaminok Poliszacharidok hialuronsav

Az expressziós kazetta

Bacillus gazdák Bacillus subtilis Bacillus licheniformis Szekréció jó amyE, nprE, aprE, spoIIAC, srfC deléciók Természetes kompetencia Bacillus licheniformis Kis extracelluláris proteáz aktivitás, spo Elektroporáció, konjugáció, protoplaszt

Géncsere

Törzsfejlesztés habzás Surfactin: felületaktív lipopeptid

Pigment mentes törzs

Ilyen egyszerű a dolog? Valahol mindig van valami probléma

Transzkripciónál és az mRNS telítés

A termelő törzs: erős promóter és nagy kópiaszám (a régi módi)

Az mRNS telítés lehetőségei

Erősebb promóterek: a tandem promóter/cry3A stabilizáló technika

A termelő törzs (új megoldás) Inzerció több, nem kapcsolt lókuszba 100%-os stabilitás mRNS telítés Marker mentes termelő törzs

Maximális termelés egy kópiás expressziós kazettáról

Hialuronsav termelés B. subtilis-szel

Hialuronsav termelés Streptococcus törzsekkel

Hialuronsav termelés B. subtilis-szel, mesterséges operon

Operon a kromoszómába

EUKARIÓTA expressziós rendszerek Élesztő Baculovírus Emlős Posztszintetikus módosítások

Expresszó élesztőben Autonóm replikálódó vektorok -> shuttle vektorok

Integrációs vektorok jobb stabilitás, jobb termelés

Hatékony kiválasztás Ha toxikus a fehérje Ha S-S hidak kellenek S. cerevisiae hiperglikozilál P. pastoris nem

P. pastoris

Rovar sejtben majdnem emlős minőség Baculovírus Autographa californica multiple nuclear polyhedrosis virus (AcMNPV)

EMLŐS sejt