Génexpresszió más (nem-E.coli) prokariótában Bacillus subtilis elsőként (az E.coli után) http://www.danforthcenter.org/Cells/images/
Miért termeltessünk heterológ fehérjét Bacillus subtilis-ban? Sok fehérje kiválasztása a tápoldatba, nagy mennyiségben ! SZEKRÉCIÓ! 2) Nincs patogén törzs 3) Jól ismert, nagy térfogatú ipari fermentációk Hátrányok: 1) Korlátozott számú vektor 2) Az optimalizált vektor rendszerek védettek 3) Nem glikozilez 4) Sok proteáz – terméket tönkre teszi
Optimalizált B. subtilis “Cell Factory”? A B. subtilis genom 12% -ának deléciója, nincs rá szükség a növekedéshez A felszabaduló energia a termék-képződésre fordítódhat. x x x x x
2) A Bacillus subtilis Sec-függő és Sec-független szekréciós útvonalai alaposan tanulmányozhatók és valószínűleg javíthatók is A szekréciós útvonal utolsó lépései problémásak, amelyek citoplazma membránon történő transzlokációt követik. a) A SipS (SPáz) túltermeltetése segít A későbbi proteolízis a fő probléma. A transzlokálódott fehérjék másodlagos szerkezete a sejtfal környezetben alakul aktívvá és proteáz rezisztenssé. b) ezt pl. a PrsA, a tiol-diszulfid reduktázok és kationok (pl. Ca2+ és Fe3+) katalizálják.
Néhány termék Enzimek Finom vegyszerek Poliszacharidok Proteázok Amilázok Finom vegyszerek Aminosavak vitaminok Poliszacharidok hialuronsav
Az expressziós kazetta
Bacillus gazdák Bacillus subtilis Bacillus licheniformis Szekréció jó amyE, nprE, aprE, spoIIAC, srfC deléciók Természetes kompetencia Bacillus licheniformis Kis extracelluláris proteáz aktivitás, spo Elektroporáció, konjugáció, protoplaszt
Géncsere
Törzsfejlesztés habzás Surfactin: felületaktív lipopeptid
Pigment mentes törzs
Ilyen egyszerű a dolog? Valahol mindig van valami probléma
Transzkripciónál és az mRNS telítés
A termelő törzs: erős promóter és nagy kópiaszám (a régi módi)
Az mRNS telítés lehetőségei
Erősebb promóterek: a tandem promóter/cry3A stabilizáló technika
A termelő törzs (új megoldás) Inzerció több, nem kapcsolt lókuszba 100%-os stabilitás mRNS telítés Marker mentes termelő törzs
Maximális termelés egy kópiás expressziós kazettáról
Hialuronsav termelés B. subtilis-szel
Hialuronsav termelés Streptococcus törzsekkel
Hialuronsav termelés B. subtilis-szel, mesterséges operon
Operon a kromoszómába
EUKARIÓTA expressziós rendszerek Élesztő Baculovírus Emlős Posztszintetikus módosítások
Expresszó élesztőben Autonóm replikálódó vektorok -> shuttle vektorok
Integrációs vektorok jobb stabilitás, jobb termelés
Hatékony kiválasztás Ha toxikus a fehérje Ha S-S hidak kellenek S. cerevisiae hiperglikozilál P. pastoris nem
P. pastoris
Rovar sejtben majdnem emlős minőség Baculovírus Autographa californica multiple nuclear polyhedrosis virus (AcMNPV)
EMLŐS sejt