ENZIMOLÓGIA.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Az “sejt gépei” az enzimek
Advertisements

IZOENZIMEK Definíció: azonos funkció, de: eltérő primer szerkezet,
Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus
Enzimek.
Fehérjék biológiai jelentősége és az enzimek
ENZIMOLÓGIA 2010.
Az enzimek A kémiai reakciók mindig a szabadenergia csökkenés irányába mennek végbe. Miért nem alakul át minden anyag a számára legalacsonyabb energiájú,
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
Zsíranyagcsere Szokásos táplálék összetétel: - szénhidrát: 45-50%
A glukóz direkt oxidációja: Pentóz-foszfát ciklus
Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus
A glükóz direkt oxidációja: Pentóz-foszfát ciklus
REAKCIÓKINETIKA BIOLÓGIAI RENDSZEREKBEN
REAKCIÓKINETIKA BIOLÓGIAI RENDSZEREKBEN
Fehérjeszintézis Szakaszai Transzkripció (átírás)
BIOKATALIZÁTOROK Fontos ipari enzimek.
BIOKÉMIAI ALAPOK.
AMINOSAVAK LEBONTÁSA.
LEBONTÁSI FOLYAMATOK.
CITROMSAVCIKLUS.
AZ ENZIMMŰKÖDÉS GÁTLÁSAI (INHIBÍTOROK)
AZ ENERGIA RAKTÁROZÁSA
BIOKÉMIA I..
POLISZACHARIDOK LEBONTÁSA
Nukleotidok, nukleinsavak
Új irányzatok a biológiában Fehérjék szerkezete, felosztása
Alkohol érzékenység – a KM szerepe
MICHAELIS-MENTEN KINETIKA KEZDETI REAKCIÓSEBESSÉG
Zsírsavak szintézise: bevezető
Glukoneogenezis.
ALLOSZTÉRIA-KOOPERATIVITÁS
Az intermedier anyagcsere alapjai 4.
1.) Magas csoportátviteli potenciálú vegyületek egymásba általában szabadon átalakulnak, mert a termék és reaktáns koncentrációarány változhat úgy a.
Az intermedier anyagcsere alapjai 9.
Az intermedier anyagcsere alapjai 8.
Zsírsavszintézis.
CITRÁTKÖR = TRIKARBONSAV-CIKLUS
Az intermedier anyagcsere alapjai 5.
ENZIMEK Def: katalizátorok, a reakciók (biokémiai) sebességét növelik
MIÉRT NEM MÉRHETŐ? E + S P + E mol/dm3!!!!
Az Enzimek Aktivitás-Kontrolja
Allosztérikus fehérjék működési mechanizmus modelljei
A moláris kémiai koncentráció
MIÉRT NEM MÉRHETŐ? E + S P + E mol/dm3!!!!
A.)Termékképzéshez egyszerre több különböző szubsztrát kell, hexokináz glükóz + (Mg)ATPGlükóz-6-foszfát + (Mg)ADP foszforilezés két termék B.) A másik.
FUNKCIONÁLIS DOMAIN-EK
EGYÉB HATÁSOK AZ ENZIMAKTIVITÁSRA BIM BSc 2007 Ionerősség pH Hőmérséklet Nyírás Nyomás (hidrosztatikai) Felületi feszültség Kémiai szerek (alkohol, urea,
4. Ismertesse az aminosavak reszolválási módszereit.(5 pont)
ENZIM MODULÁCIÓ.
ANTIGÉN-SPECIFIKUS T – SEJT AKTIVÁCIÓ
Kémiai reakciók.
Kémiai kinetika.
A foszfát csoport az S, T és Y oldalláncok hidroxil- csoportjához kapcsolódik.
Receptor és szenzor fehérjék számítógépes tervezése Összeállította: Kiss Lóránd 2009.április.24. Bioinformatika szakirodalmi tanulmányok.
Kémiai reakciók Kémiai reakció feltételei: Aktivált komplexum:
Kémiai reakciók iránya
MSc 2012 ENZIMES ÖSSZEFOGLALÓ Egy egység az az enzim mennyiség, amely 1  mol szubsztrátot alakít át vagy 1  mol terméket képez 1 perc alatt adott reakció.
ADEPT antibody-directed enzyme prodrug therapy antitest-vezérelt enzimes „előgyógyszer”-terápia a rák kezelésének egy még kutatott módja.
13.példa BIM SB 2001 A szérum lipáz aktivitása diagnosztikai szempontból jelentős bizonyos pankreász megbetegedések felismerésében. Mindazonáltal az adatok.
30. Lecke Az anyagcsere általános jellemzői
Készítette és Balogi Ivett előadja:Csapó Konrád előadja:Csapó Konrád Kovács Réka.
Hormonokról általában Hormonhatás mechanizmusa
Enzimkinetika Komplex biolabor
ENZIMOLÓGIA.
Bio- és vegyészmérnököknek 2015
DNS replikáció DNS RNS Fehérje
Energiatermelés a sejtekben, katabolizmus
ENZIMEK.
Reakciókinetika.
Fehérjék szabályozása II
Előadás másolata:

ENZIMOLÓGIA

Koenzimek, prosztetikus csoportok, fémionok (7. tétel) Katalizátorok: Csökkentik az aktiválási energiát A reakció irányát nem befolyásolják Az egyensúly kialakulását gyorsítják Specifikusak (irányítás, kapcsoltság) Fehérjék (RNS-ek) Koenzimek, prosztetikus csoportok, fémionok (7. tétel)

Szubsztrát és végtermék Kötőhely, aktív hely

Katalizátor modell

Enzim katalízise A reakció egyes pontokon még vissza is fordulhat!

Kémiai reakciók szabadentalpiája C + D Ha K=1, akkor ΔG°= 0

Enzim irányítja a szubsztrát sorsát

Enzim specifitása

Enzim-szubsztrát komplex kialakulása A kulcs-zár modell

Enzim-szubsztrát komplex kialakulása Az indukált illeszkedés modell

A „fluktuációs illeszkedés” modell aktív hely szubsztrát inaktív ???

Enzimatikus reakcó sebessége A reakciósebességeket a sebességi állandó és a koncentrációk szorzata adja: A+B AB k1 k2 v1=k1·[A]·[B] v2=k2·[AB] S→P reakció kezdetén: E+S ES E+P k3 k2 k1 v=k3·[ES] [Et]=[E]+[ES] Nagyon magas szubsztátkoncentráció esetén az összes enzim használatban van. Ekkor: Vmax=k3·[Et] (8. tétel)

Enzimatikus reakcó sebessége k3·[ES] k3·[Et] [ES] [Et] = Vmax v Mivel a stacionárius állapot gyorsan beáll, ezért [ES] állandónak tekinthető. Ekkor: = k1·[E]·[S]=k2·[ES]+k3·[ES] (k2+k3)·[ES] [ES] [E]·[S] k2+k3 k1 Km = [Et]= +[E] [E]·[S] Km

Enzimatikus reakcó sebessége Vmax v = [E]·[S] Km +[E] [S] + [S]+Km [S]·Vmax v = Michaelis-Menten [S]+Km

Reakció kezdeti sebessége Mely szubsztátkoncentrációnál van maximális sebesség? Speciális esetben: v = Vmax 2 Ekkor: Vmax 2 [S]·Vmax [S]+Km = [S] [S]+Km 1 2 = [S]+Km = 2·[S] Km = [S] Tehát a reakció konstansa egyenlő avval a szubsztrátkoncentrációval, ami a maximális sebesség felét okozza

y a x b Reakció kezdeti sebessége = [S]+Km [S]·Vmax [S] Km + v 1 v 1

Ha [S]= ∞ , akkor: 1 [S] = 0, ekkor: Vmax 1 v = Ha v 1 = 0 (csak elvi lehetőség!), akkor: Km Vmax · 1 [S] = = - Az egyenes kimetszi nekünk Km-et és Vmax-ot ???

Enzimek Átviteli szám: Időegység (1 sec.) alatt 1 enzimmolekula hány szubsztrát átalakulását katalizálja (k3) (0,1-106) Enzim aktivitása (v): Időegység (perc) alatt mennyi (μmol) szubsztrát átalakulása történik meg (Unit, U) (Catal: mol/sec)

Inhibítorok Reverzibilis Irreverzibilis Kompetitív Non-kompetitív Unkompetitív (10. tétel)

Antimetabolitok: Gyógyszerek lehetnek Gátlások Kompetitív Non-kompetitív Unkompetitív Antimetabolitok: Gyógyszerek lehetnek

A szabályozás mechanizmusa Allosztérikus (homotróp, heterotróp) feedback gátlás prekurzor aktiválás Kovalens módosítás (foszfát csoport) protein kinázok, foszfoprotein foszfatázok Limitált proteolízis (zimogének) szerin proteázok, inhibítorok ???

Az enzimek osztályozása Oxidoreduktázok (több alosztály) Transzferázok: Funkciós csoportok átvitele Hidrolázok: Hasítás Liázok: Kis molekula addíciója, v. eliminációja Izomerázok Ligázok: ATP felhasználással összekapcsolnak (9. tétel)

Transzferázok Hidrolázok Csoportokat visznek át egyik szubsztrátról a másikra. Pl.: glukóz + ATP → glukóz-6-P + ADP Hidrolázok Víz segítségével hasítanak el kötéseket. Pl.: glukóz-6-P → glukóz + Pi

Liázok Izomerázok Ligázok H2O, NH3, vagy CO2 adódik egy molekulához, vagy vonódik el tőle. Pl.: 2-foszfoglicerát ↔ foszfoenol-piruvát + H2O Izomerázok Különböző típusú izomerizációkat katalizálnak. Pl.: glukóz-6-P ↔ fruktóz-6-P Ligázok Molekulákat kapcsolnak össze nagy energiájú foszfát-kötés felhasználásával. Pl.: glutamát + NH3 + ATP → Glutamin + ADP + Pi

Izoenzimek Azonos szubsztrátok azonos reakcióját katalizálják Különböző elsődleges szerkezet Különbözhet még: Szabályozásuk Sejten belüli elhelyezkedésük Szervek, vagy sejttípusok közti eloszlásuk Reakciósebességük Szubsztráthoz való affinitásuk Specificitásuk (7. tétel)