Túlélési vizsgálatok kivitelezése, eredményeik értékelése: Kaplan-Meier analízis és Cox regresszió Dr. Prohászka Zoltán egyetemi tanár Semmelweis Egyetem.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
I. előadás.
Advertisements

A terápia specialitása renális hypertoniában Prof. Dr. de Châtel Rudolf egyetemi tanár Semmelweis Egyetem ÁOK I. sz. Belgyógyászati Klinika, Budapest.
Főkomponensanalízis Többváltozós elemzések esetében gyakran jelent problémát a vizsgált változók korreláltsága. A főkomponenselemzés segítségével a változók.
Mérési pontosság (hőmérő)
Gazdaságelemzési és Statisztikai Tanszék
Közúti és Vasúti járművek tanszék. Célja:az adott járműpark üzemképes állapotának biztosítása. A karbantartás folyamatait gyakran az üzemeltetést is kiszolgáló.
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VII.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Mintavétel Mintavétel célja: következtetést levonni a –sokaságra vonatkozóan Mintavétel.
Statisztika II. VI. Dr. Szalka Éva, Ph.D..
Statisztika II. IV. Dr. Szalka Éva, Ph.D..
Statisztika II. II. Dr. Szalka Éva, Ph.D..
Az analitikus epidemiológia vizsgálat célja:
Ozsváth Károly TF Kommunikációs-Informatikai és Oktatástechnológiai Tanszék.
Differenciál számítás
Regresszióanalízis 10. gyakorlat.
Varianciaanalízis 12. gyakorlat.
Dr. Gombos Tímea SE, III.sz. Belgyógyászati Klinika
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Miért kell többváltozós modellekhez folyamodnunk (a túlélési analízis során)?
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
SPSS többváltozós (lineáris) regresszió (4. fejezet)
Konzulens: Dr. Boda György Készítette: Kovács Katalin
„Tatisztika… Ammeg mi?”
TÖBBSZÖRÖS REGRESSZIÓS SZÁMÍTÁSOK II
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Hipotézisvizsgálat (1. rész) Kontingencia táblák
KÉT FÜGGETLEN, ILL. KÉT ÖSSZETARTOZÓ CSOPORT ÖSZEHASONLÍTÁSA
Nem-paraméteres eljárások, több csoport összehasonlítása
TÖBBSZÖRÖS REGRESSZIÓS SZÁMÍTÁSOK II
ÖSSZEFOGLALÓ ELŐADÁS Dr Füst György.
A két vagy több független változó elemzéséhez használható különböző módszerek (Dawson, Trapp, 2001)
REGRESSZIÓS SZÁMÍTÁSOK II
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VI.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Regresszióanalízis.
Kvantitatív módszerek
Nemparaméteres próbák Statisztika II., 5. alkalom.
Egytényezős variancia-analízis
Nominális adat Módusz vagy sűrűsödési középpont Jele: Mo
Kvantitatív Módszerek
$ Információ Következmény Döntés Statisztikai X.  Gyakorlati problémák megoldásának alapja  Elemzéseink célja és eredménye  Központi szerep az egyén.
Valószínűségszámítás
Hipotézis vizsgálat (2)
Többváltozós adatelemzés
Következtető statisztika 9.
Alapsokaság (populáció)
avagy Négy halálos lórugás egy év alatt! Mit tesz a kormány?
Adatleírás.
Két kvantitatív változó kapcsolatának vizsgálata
Paleobiológiai módszerek és modellek 4. hét
Adatelemzés számítógéppel
I. előadás.
D-vitamin receptor (VDR) aktiváció és a túlélés epidemiológiája végstádiumú vesebetegekben Salem VA Medical Center, Salem, USA Prof. Dr. Kövesdy Csaba.
Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Regresszió-számítás március 30. Dr. Varga Beatrix egyetemi.
Valószínűségszámítás II.
Kapcsolat vizsgálat II: kontingencia táblák jelentősége és használata az epidemiológiában, diagnosztikában: RR, OR. Dr. Prohászka Zoltán Az MTA doktora.
SIMON ZSÓFIA, MILTÉNYI ZSÓFIA, MAGYARI FERENC, BARNA SÁNDOR 1, KENYERES ANNA, JÓNA ÁDÁM, ILLÉS ÁRPÁD DEKK BELGYÓGYÁSZATI INTÉZET, HEMATOLÓGIA TANSZÉK,
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Kiváltott agyi jelek informatikai feldolgozása 2016
Kvantitatív módszerek MBA és Számvitel mesterszak
I. Előadás bgk. uni-obuda
Szabályozott és képes termékek/szolgáltatások, folyamatok, rendszerek
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Gazdaságinformatikus MSc
Szekunder adatok & Alkalmazott statisztikai alapok
Statisztika segédlet a Statistica programhoz Új verzióknál érdemes a View menüsor alatt a Classic menu-s verziót választani – ehhez készült a segédlet.
2. Regresszióanalízis Korreláció analízis: milyen irányú, milyen erős összefüggés van két változó között. Regresszióanalízis: kvantitatív kapcsolat meghatározása.
Mérési skálák, adatsorok típusai
Dr. Varga Beatrix egyetemi docens
3. Varianciaanalízis (ANOVA)
Előadás másolata:

Túlélési vizsgálatok kivitelezése, eredményeik értékelése: Kaplan-Meier analízis és Cox regresszió Dr. Prohászka Zoltán egyetemi tanár Semmelweis Egyetem III. Sz. Belgyógyászati Klinika

Az előadás célja, vázlat Cél: túlélési analízist bemutató orvosi szakirodalom eredményeinek értelmezéséhez szükséges biostatisztikai alapismeretek összefoglalása, példákon való bemutatása, KM és Cox analízis végrehajtása, interpretálása Vázlat –Túlélési analízis, alapok (követési idő, végpont, ábrázolás, medián túlélés) –A hazárd fogalma, hazard rate (HR) –Kaplan-Meier analízis: adatok értelmezése, példákon bemutatva –Cox regresszió

Randall et al, 2013

Túlélési analízis, alapok Követési idő –Az adott beteg vizsgálatba kerülésétől a végpont teljesítéséig számított idő Előre meghatározott időtartam –(A megkívánt számú esemény bekövetkezése előre kiszámítható) Köztes (futility vagy interim) analízis lehetséges –(A kitűzött eseményszám valóban várható?) –(Sokszor „éretlen” a köztes analízis eredménye: elégtelen esetszám)

Túlélési analízis, alapok Kemény végpont: egyszeri, jól definiálható és dokumentálható esemény Végpont (pl. halálozás, overall survival) –A vizsgálat tervezésekor kitűzött esemény bekövetkezése (esemény, időpont) –A vizsgálat tervezésekor meghatározott követési idő elérése az esemény bekövetkezése nélkül (utolsó vizit, időpont=vizsgálat időtartama) –Mi lesz a „kieső betegekkel”?

Túlélési analízis, alapok Követési idő meghalt él

Cenzorálás, cenzor Cenzor: A római alkotmány értelmében a polgárok vagyoni besorolását végző, sőt, erkölcseik feletti felügyeletet gyakorló hivatalnok Cenzúra: ellenőrzés Cenzorálás a statisztikában: a betegek csoportokba sorolása előre meghatározott szempontok szerint Túlélési analízisben: a betegek besorolása adott időpillanatban a halottak/élők/kizárt személyek közé –Betegség specifikus halálozás

A túlélési adatok ábrázolása: 100 szívelégtelenségben szenvedő beteg 5 éves túlélési görbéje Jelölések, medián túlélés, halálozási ráta

A rizikó (kockázat) és a hazard Rizikó (kockázat): egy esemény bekövetkezésének a valószínűsége („Hány hatost dob?”) Relatív rizikó: az egyik csoport (kezelt) rizikójának és a másik csoport (kontroll) rizikójának hányadosa („Ki dob több hatost?”)

A relatív rizikó fogalma Betegek száma Egészségesek száma Összesen: Rizikófaktor igen ABA+B Rizikófaktor nem CDC+D Összesen: A+CB+DA+B+C+D EER=A/(A+B) CER=C/(C+D) ARR=| EER-CER | RRR=| EER-CER | / CER=ARR/CER EER CER =RR 1/ARR=NNT EER: Experiemental event rate CER: Control event rate ARR: Absolute risk reduction RRR: Relative risk reduction NNT: Number needed to treat RR: Relative risk

A relatív kockázat A relatív kockázat, melynek jelölése általánosan RR (relative risk), mindig egy adott kezelt csoport és egy adott kontroll csoport vonatkozásában fejezhető ki Kiszámításakor a kezelésnek kitett (exposed) és a ki nem tett (non- exposed) csoportokban megfigyelt betegség incidenciákat osztjuk egymással. A relatív kockázat a két csoport incidencia (esemény) rátáinak hányadosa.

A relatív kockázat (relative risk) Tegyük fel, hogy 200 személyt vontunk be vizsgáltunkba, a csoport fele kapott kezelést, míg másik fele képezte a kontrollt (placebo). A 200 személy közül 50 beteg elhunyt, míg 150 beteg életben volt a vizsgálat végén. CsoportEsemény: Igen (Halál) Esemény: Nem (Túlélők) Összesen Expozíció: nem (Placebo) 100 Expozíció: igen (teszt gyógyszer) 100 Összesen:

Relative risk: –Exposed: 25/100=0,25 –Non-exp: 25/100=0,25 =Hányadosa: 1,0

A relatív kockázat (relative risk) Tegyük fel, hogy 200 személyt vontunk be vizsgáltunkba, a csoport fele kapott kezelést, míg másik fele képezte a kontrollt (placebo). A 200 személy közül 50 beteg elhunyt, míg 150 beteg életben volt a vizsgálat végén. CsoportEsemény: Igen (Halál) Esemény: Nem (Túlélők) Összesen Expozíció: nem (Placebo) Expozíció: igen (teszt gyógyszer) Összesen:

Relative risk: –Exposed: 40/100=0,40 –Non-exp: 10/100=0,10 =Hányadosa: 4,0

A példa számaival végzett chi-négyzet próba eredménye Chi-négyzet: Szabadsági fok: p-értéke: Egy- vagy kétoldalas a p? 24,00 1 <0,0001 Két oldalas Relatív kockázat (RR) (95% CI)4,0 (2,1-7,6)

A rizikó (kockázat) és a hazard Rizikó (kockázat): egy esemény bekövetkezésének a valószínűsége –Relatív rizikó: az egyik csoport (kezelt) rizikójának és a másik csoport (kontroll) rizikójának hányadosa Hazard: Hasonló a kockázat fogalmához –A statisztikában egy esemény bekövetkeztének időbeliségére, időbeli változására is utal Legtöbbször a túlélési analízisek során használatos –„Annak a kockázata, hogy egy személy egy adott időtartamon belül meghaljon” A hazard ratio két csoport kockázatának (időegység alatti halálozás) összehasonlítása –„Egy óra alatt ki dob nagyobb arányban hatost?”

A szignifikancia kérdése: p érték, és konfidencia intervallum

A rizikónak kitett személyek száma, avagy a vizsgálat ereje az adott időpillanatban

Stratifikált, vagy alcsoport analízis Összes személy: Mutáció van: Mutáció nincs:

A vizsgálati végpont „minősége”: kemény vs. puha végpontok Kemény: egyszeri, egyértelmű, bekövetkezése vagy automatikusan rögzítésre kerül, vagy pontosan definiálható, egyértelműen mérhető –Halálozás –Első házasságkötés –Tengelytörés….stb Puha: szintén egyértelmű (?), de azonosítása (dátuma) a definíción, a gondosságon, az előírt protokollon…stb múlik. –Betegség progresszió –Rehospitalizáció…stb

A vizsgálat statisztikai terve Elsődleges és másodlagos végpontok –Irodalmi/tapasztalati adatok alapján a várható csoportnagyságok megtervezése Vizsgálatba vont betegek száma Események aránya Események időbelisége Alcsoport (stratifikált) analízisek –Kezelési csoportok szerint –Betegség jellemzők szerint –Újabb (tervezés után) felmerülő szempontok szerint Kieső személyek kezelése Előzetes értékelés –Vizsgálat „érettsége”= cenzoráltak/elhunytak aránya –Futility analízis Power Elemszám Különbség

Cox proporcionális hazard regressziós modell Többváltozós túlélési modell Ha az egyik csoportban a halál kockázata háromszorosa a másik csoporténak, akkor a kockázat állandó marad az egész vizsgálat folyamán. A Cox–regressziós modell a vizsgált magyarázó változók relatív kockázatát becsli A kapcsolatot mindig egy kockázatmentes (rizikófaktor mentes) csoporthoz, a baseline csoporthoz viszonyítjuk (relatív rizikó)

Cox proportional hazard regresion model Függő változó: túlélési idő. Független változó(k): prediktorok (risk factors), confounderek, suppresserek, interacting variables A túlélési idő eloszlásával kapcsolatban nincs előfeltétel, non- paraméteres tesztnek tekinthető Előzetes feltételezés –Ha az egyik csoportban a halál kockázata háromszorosa a másik csoporténak, akkor a kockázat állandó marad az egész vizsgálat folyamán. –Arányosság (proportionality): a hazard a független változók értékével arányosan nő (és nem függ az időtől) –Speciális eset: időfüggő független változó (pl. életkor)

A rizikófaktorok jellegzetességei Igen/nem típusú (pl. koponya trauma hasi sérüléssel vagy anélkül) Binomiálissá alakítható ismeretek, konszenzus, vagy józan ész szerint (kóros vércukor/ nem kóros) Mi a helyzet a folytonos változókkal? –Emészthetővé alakítható? („magas” vs. „alacsony”; ) –Standardizálás (elfogadott az 1 SD egységre való kifejezés, de ettől eltérés is lehet) –Matematikailag helyes de sokszor nehezen értelmezhető a nyers eredmények modellbe illesztése (ld. példa)

A Cox modell eredményének értelmezése B: a hazard függvény regressziós koefficiense Béta (β ): standardizált regressziós koefficiens Hazard Rate: annak a valószínűsége, hogy a megfigyelési időszak alatt az esemény bekövetkezik (a béta exponenciálisa, e  ) –A relatív kockázatot a β értéke alapján számoljuk: RR =e β Wald chi-négyzet (p): az egyes koefficiensek szignifikanciájának megítélésére alkalmas mutató

Dependent Variable: survival time (Cox_gyak.sta) Censoring var.: exit Chi2 = 25,5290 df = 1 p =,00000 BetaStandard - Errort-valueexponent - betaWald - Statist.p BNP/SD0, , , , ,771120,000000

Megfontolások a Cox modell kapcsán Érdemes a modellvizsgálat előtt a változók függetlenségvizsgálatát elvégezni A modell feltételezi a kockázat arányának időbeli állandóságát Mintaszám megválasztásánál alkalmazzunk az ökölszabályt, hogy minden kovariánsra legalább 5-10 esemény jusson A Cox–modellt gyakran alkalmazzák az exploratív vizsgálatok során hipotézisek felállítására.

Több vizsgálat eredményének összevetése, aggregált analízis, meta-analízis Forest plot

Összefoglalás, útravaló tudnivaló Túlélési analízis: az esemény bekövetkezésének időbeliségét is vizsgálja, nem csak a tényét A csoportok túlélési adatait az –Overall survival (elhunytak aránya, %) és a –Median túlélés (időpont, amikor a résztvevők 50%-a él) Hazard ratio: két csoport hazardját hasonlítja össze –Időegység alatti halálozási arány A szignifikanciát a konfidencia intervallum jelzi A vizsgálat „ereje” a bekövetkezett események számán múlik –Alcsoport analízisek és köztes eredmények óvatosan értékelendők (elemszám!)

Köszönöm a figyelmet!