Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota.

Az előadások a következő témára: "Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota."— Előadás másolata:

1 Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota változatlan és a populáció aszinkron) A tenyészet sejttömege az idő függvényében M(t) = M 0 ·e  ·t (a sejtek koreloszlása és ciklus alatti tömegnövekedése ezt nem befolyásolja) Az egyedi sejt tömege az idő függvényében m(t) = m 0 ·e  ·t ??? m 0 a születéskori sejttömeg 0 < t < CT, ahol CT a sejt ciklusideje m(CT) = 2m 0 (tetszőleges monoton függvény elképzelhető) exponenciális-e a növekedés a sejtek életében ???

2 Sejtnövekedési modellek Exponenciális modell: a sejt növekedési sebessége folyamatosan nő → riboszómák száma (Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae ???) Lineáris (multilineáris) modell: a sejt növekedési sebessége állandó → bizonyos esemény(ek)nél ugrásszerű változások (Schizosaccharomyces pombe) CK ha a növekedés lineáris, és a ciklus belsejében nincs sebességváltás ↓ a sejt osztódásakor a növekedési sebességnek ugrásszerűen meg kell duplázódnia ↕ exponenciális növekedés esetében a sejt osztódásakor sincs hirtelen változás

3 A hasadó élesztőgomba, mint a sejtnövekedés modellje Mitózisos (ivartalan) sejtciklus Mitchison, 1957 csak hosszirányú sejtnövekedés → tömeg, térfogat és hossz ~ arányos a ciklus végén a hossznövekedés megszűnik Mitchison & Nurse, 1985 Sveiczer, Novák & Mitchison, 1996 a növekedés mintázata (bi)lineáris a ciklus közepe táján van egy sebességváltási pont (RCP)

4 A hasadó élesztőgomba mitózisos sejtciklusa

5 SG2MG1S RCP2 Idő (min) Sejthossz, L (  m) NETO új régi vég CK A Schizosaccharomyces pombe növekedése RCP3 RCP1

6 DL BL CT 5 min A mikrofotográfia módszere mért változó: a sejthossz (L) a születéstől (BL) az osztódásig (DL) az idő függvényében (0 < t < CT)

7 A mérési pontokra illesztett modellek Lineáris L(t) = a·t + b Exponenciális L(t) = c·e d·t Bilineáris L(t) =  ·ln{exp[  ·(t-  )/  ] + exp[  ·(t-  )/  ]} +  ahol  az RCP pozíciója,  pedig az átmenet élessége A legadekvátabb modell kiválasztási kritériumai Korrelációs koefficiens Reziduális standard deviációs = (SSE/df) 1/2 Akaike információs kritérium AIC = n obs · ln(SSE) + 2n par Schwarz Bayes információs kritérium SBIC = n obs · ln(SSE) + n par · ln(n obs )

8 RCP α 1 = 0.0429 μ m min -1 α 2 = 0.0902 μ m min -1 ε = 9.84 μ m τ = 57.6 min η = 0.01 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: 635-649. Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (éles bilineáris eset)

9 RCP α 1 = 0.0413 μ m min -1 α 2 = 0.0782 μ m min -1 ε = 10.2 μ m τ = 59.7 min η = 0.500 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: 635-649. Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (sima bilineáris eset)

10 γ = 0.0494 μ m min -1 δ = 7.86 μ m Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: 635-649. Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (lineáris eset)

11 α 1 = 0.0478 μ m min -1 α 2 = 0.0628 μ m min -1 ε = 10.8 μ m τ = 64.3 min η = 0.087 μ m RCP Horváth, A., Rácz-Mónus, A., Buchwald, P. & Sveiczer, A. (2013). Cell length growth in fission yeast: an analysis of its bilinear character and the nature of its rate change transition. FEMS Yeast Res. 13: 635-649. Hasadó élesztő sejtek „átlagos” növekedési mintázata (sima bilineáris)

12 A hasadó élesztő sejtnövekedése általában bilineáris, de gyakran nem éles

13 A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 1. WT cdc2 ts Fantes, P. A. (1977). Control of cell size and cycle time in Schizosaccharomyces pombe. J. Cell Sci. 24, 51-67.

14 Sveiczer, A., Novak, B. & Mitchison, J. M. (1996). The size control of fission yeast revisited. J. Cell Sci. 109, 2947-2957. A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 2.

15 Sveiczer, A., Novak, B. & Mitchison, J. M. (1996). The size control of fission yeast revisited. J. Cell Sci. 109, 2947-2957. A méretkontroll a G2 fázis közepén hat → G2 = „sizer + timer” A méretkontroll pozícionálása hasadó élesztőben