Makromolekulák 2015 12 09 Simon István.

Az előadások a következő témára: "Makromolekulák 2015 12 09 Simon István."— Előadás másolata:

1 Makromolekulák Simon István

2 Transzmembrán fehérjék
Anyagcsere folyamatok Transzporterek Ion csatornák Hordozók Információ csere Receptorok

3 A transzmembrán fehérjék két formája

4 E. Coli klorid csatorna fehérje

5 Ismert szerkezetű transzmembrán fehérjék szerkezetét vizsgáló szerverek

6 Hidrofobicitás

7 Aminosav helyettesítési mátrix

8 Szerkezetbecslés homológia alapján

9 Az emberi rodopszin és a bakteriorodopszin aminosav- sorrendjeinek összehasonlítása

10 A DAS szerver algoritmusa

11 A HMMTOP algoritmus O o H i I 11

12 Ismert szegmensek lokalizációja
12

13 ? ? TOPDOM TM selection of UniProtKB S c a n n i n g Protein A Pfam
Intracellular domain Q C Protein A N C Pfam Prosite Prints Smart N Protein B Intracellular domain Q S c a n n i n g Protein C TM selection of UniProtKB N Intracellular domain Q C ? ? Intracellular domain Q C TOPDOM Unknown Protein N 13

14 Prion protein

15 Transzmembrán hélixek lokalizációja

16 Prion fehérje

17 DAS profiles of a TM protein as function of residue number
17

18 A fehérjék kitágult világa
Globuláris rendezett fehérjék Transzmembrán fehérjék O o H i I Rendezetlen fehérjék