Makromolekulák 2013 11 19 Simon István.

Az előadások a következő témára: "Makromolekulák 2013 11 19 Simon István."— Előadás másolata:

1 Makromolekulák Simon István

2 Fehérje építő aminosavak

3 A peptid kötés

4

5 -hélix

6 -lemez

7 Lizozim és szubsztrátja

8 A lizozim aktív centruma

9 5pti: BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR
N-terminális

10 Az ECEPP forcefield

11 BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR

12 Stabilizációs centrumok (5pti)

13 A CVFF forcefield

14 A prolil oligopeptidáz enzim szerkezete

15 Fő mozgás-irányok

16 A prolyl-oligopeptidáz szerkezeti dinamikája
aminosav korrelált antikorrelált

17

18 Chou-Fasman Paraméterek
Aminosav P(a) P(b) Alanine Arginine Aspartic Acid Asparagine Cysteine Glutamic Acid Glutamine Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine

19 Aminosav helyettesítési mátrix

20 Diszulfid becslő potenciál

21 Szerin proteázok szekvenciáinak összehasonlítása

22 Aminosavak konzervativitása és eltemetettsége

23

24 Szerkezetbecslés homológia alapján

25

26

27 Párkölcsönhatások energiájának egy aminosavra számított értéke