A HIV-fertőzés alapmodellje Vírusdinamika = a szervezeten belüli folyamatok modellezése.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Kompetitív kizárás vagy együttélés?
Advertisements

5. hét: Solow-modell Csortos Orsolya
Kvantitatív módszerek
AIDS.
T-SEJT AKTIVÁCIÓ.
Megoldások.
Malignus Lymphomák Molnár Zsuzsa O.O.I..
AFRIKA Készítette: Csik Annamária Molnár Vivien Ring Evelin.
A védekezés.
ENZIMOLÓGIA 2010.
Virulens/intemperált bakteriofágok
Térbeli niche szegregáció kétfoltos környezetben
+ = ? Müller Viktor ELTE Biológiai Intézet Megszelídül-e a HIV? Modellekkel a vírus nyomában.
A populációk interakciói. A populációk közötti kompetíció 1.
Elektrokémia kinetika Írta: Rauscher Ádám Bemutató: Kutsán György
Gazdasági növekedés hosszú- és rövidtávon Növekedés erőforráskorlátokkal.
EFFEKTOR T LIMFOCITÁK Az effektor T sejtek citokineket és citotoxinokat termelnek Az effektor T sejtek aktiválják az antigén prezentáló sejteket.
AIDS Világnap: december 01..
Az immunrendszer szervei és sejtjei
Tulajdonjogok és a nemzetek gazdagsága Heitger, B. [2003]: Property rights and the wealth of nations: a cross-country study Csorba László II. évfolyam.
Regresszióanalízis 10. gyakorlat.
Immunrendszer Betegségei.
Többszörös regresszió I. Többszörös lineáris regresszió
Többszörös regresszió I. Többszörös lineáris regresszió miért elengedhetetlen a többszörös regressziós számítás? a többszörös regressziós számítások fajtái.
HIV-fertőzés kialakulása, működése és az AIDS kezelési lehetőségei
A moláris kémiai koncentráció
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Nominális adat Módusz vagy sűrűsödési középpont Jele: Mo
Préda-ragadozó interakciók modellezésének lehetőségei R-ben.
ANTIGÉN-SPECIFIKUS T – SEJT AKTIVÁCIÓ
AZ INTRACELLULÁRIS BAKTÉRIUMOK ELLENI IMMUNVÁLASZ
AZ IMMUNRENDSZER FELÉPÍTÉSE ÉS MŰKÖDÉSE
Immunológiai tolerancia. Immun tolerancia Definícíó: Egy adott antigénnel szembeni válaszképtelenség amelyet az adott antigénvált ki azt követően hogy.
A HIV FERTŐZÉS IMMUNPATHOGENEZISE. A HUMÁN IMMUNDEFICIENCIA VÍRUS (HIV)
IMMUNOLÓGIAI MEMÓRIA Centrális Effektor.
SZERZETT IMMUNITÁS FELISMERÉS.
AZ IMMUNRENDSZER FELÉPÍTÉSE ÉS MŰKÖDÉSE
AZ ADAPTÍV IMMUNVÁLASZ: T- és B-sejtek aktivációja
█ Stable █ EC+β+ █β- █α █P █N █SF █Unknown Atommagok stabilitása - II.
OECD GUIDELINE FOR THE TESTING OF CHEMICALS Soil Microorganisms: Carbon Transformation Test OECD ÚTMUTATÓ VEGYI ANYAGOK TESZTELÉSÉRE Talaj Mikroorganizmusok:
AZ EGÉSZSÉGI ÁLLAPOT MÉRÉSÉNEK LEHETŐSÉGEI
Az AIDS modellezése Müller Viktor ELTE Növényrendszertani és Ökológiai Tanszék.
A HIV jövője. Általános háttér: a kórokozók evolúciója A hagyományos nézet Elegendő idő alatt minden gazda-parazita kapcsolat békés együttéléssé szelídül.
A HIV jövője. Általános háttér: a kórokozók evolúciója A hagyományos nézet Elegendő idő alatt minden gazda-parazita kapcsolat békés együttéléssé szelídül.
Az AIDS modellezése Müller Viktor ELTE Növényrendszertani és Ökológiai Tanszék.
Kompartmentmodellek. Vér és nyirok NYIROKRENDSZER VÉR T VPVP I T I VLVL V P : vírus a vérben V L : vírus a nyirokrendszerben i e.
Alapmodell + HIV-ellenes effektorsejtek Alapmodell: Folyamatfüggvények.
Az alacsony egyensúlyi szint problémája Callaway és Perelson Bull Math Biol 64: (2002) nyomán Hogyan magyarázható az alacsony egyensúlyi (?) vírusszint.
Vírusok Rosszindulatból írt programok. A gépekben kárt okoznak főleg szofveresen. Terjedésük: adathordozókon, vagy hálózaton keresztül Jelenlétükre utaló.
Az exogén és endogén antigének bemutatása
„Ez velünk nem fordulhat elő!”
Populáció genetika Farkas János
Világot fenyegető vírus Semmi sem biztos; csak a halál.
E= egyszerű választás T= többszörös választás
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Méréstechnika és Információs Rendszerek Tanszék Megerősítő elemzés „Big Data” elemzési módszerek Salánki.
T-SEJT DIFFERENCIÁCIÓ A THYMUSBAN. A thymus szöveti felépítése.
Immunbiológia - II. A T sejt receptor (TCR) heterodimer CITOSZÓL EXTRACELLULÁRIS TÉR SEJTMEMBRÁN kötőhely  lánc  lánc VV VV CC CC VV VV
Közúti és Vasúti Járművek Tanszék. A ciklusidők meghatározása az elhasználódás folyamata alapján Az elhasználódás folyamata alapján kialakított ciklusrendhez.
1 Szilárd Fe II -ftalocianin és oxigén reakciójának vizsgálata Mössbauer- spektroszkópiával 1 Houping Yin, 1,2 Amar Nath, 1 Yen Wei, 3 Kuzmann Ernő, 3.
IMMUNOLÓGIAI MEMÓRIA Centrális Effektor. 1781:Kanyarójárvány a Feröer szigeteken A járvány elmúltával a sziget kanyarómentes 65 évig 1846: Újabb járvány.
PPKE ITK 2008/09 tanév 8. félév (tavaszi) Távközlő rendszerek forgalmi elemzése Tájékoztatás 4.
Előrejelzés Összeállította: Sójáné Dux Ágnes. Előrejelzés Az időbeli folyamatok elemzésének segítségével lehetőség nyílik a korábban láthatatlan trendek.
A HIV ÉS AZ AIDS. A.I.D.S. = Acquired Immune Deficiency Syndrome = Szerzett immunhiányos tünetegyüttes. HIV = humán immunhiány vírus Fertőzés következtében.
1 Predáció populációdinamikai hatása Def.: olyan szervezet, amely a zsákmányát, annak elfogása után, megöli és elfogyasztja. (Ellentétben: herbivor, parazitoid,
Monopolisztikus verseny, Oligopólium
Miben különbözik a természetes fertőzést követő immunitás az oltóanyag által kiváltott védettségtől? Timár László 19. ORSZÁGOS VÉDŐOLTÁSI TOVÁBBKÉPZŐ TANFOLYAM.
Parazitizmus Def.: Olyan szervezetek, amelyek a gazdaállatot nem ölik meg (vagy nem azonnal), de súlyos fitnisz csökkenést okoz(hat)nak. (Az „ideális”
Becsléselmélet - Konzultáció
Munkagazdaságtani feladatok
Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése
Előadás másolata:

A HIV-fertőzés alapmodellje Vírusdinamika = a szervezeten belüli folyamatok modellezése

Alapmodell T I V T: célsejt I: fertőzött sejt V: vírus Lotka-Volterra, tömeghatás, (kvázi)stacionárius egyensúly sok-sok ismeretlen...

Miért jók a diffegyenletek? jól keveredő rendszer hatalmas egyedszámok (elhanyagoljuk a változatosságot)

Megfigyelés hatékony kezelés hatására exponenciálisan csökken a vírusszint az első hetekben gyors folyamatok dinamikus egyensúlya! mennyire gyors?

A kezelés hatása T I V T: célsejt I: fertőzött sejt V: vírus megoldható!

Paraméterbecslés görbeillesztés δ = 0.5 per nap c = 3 per nap a vírustermelő sejtek átlagos élettartama két nap, a vírusrészecskéké 8 óra a „kvantitatív virológia” hajnala következtetés: a vérbeli vírus zömét egységes sejtállomány termeli – de továbbra sem tudjuk, mitől halnak meg a sejtek...

Kompartmentmodellek

Vér és nyirok NYIROKRENDSZER VÉR T VPVP I T I VLVL V P : vírus a vérben V L : vírus a nyirokrendszerben i e

Írjuk fel a bővített modellt!

Bővített modell

Megfigyelés: plazmaferézis c’ = c + e + ε ill. a teljes “clearance” a vérből, ill. a NYR-ből Becslés: per nap

A fertőző vírus szintje kezelés alatt A termelés gátolt: p = 0

A vírustermelés gátolt NYIROKRENDSZER VÉR T VPVP I T I VLVL V P : vírus a vérben V L : vírus a nyirokrendszerben i e

Bővített modell

A fertőző vírus szintje kezelés alatt A termelés gátolt: p = 0 két időskála: a lassabb a meghatározó: 3 per nap per nap Következtetés: per nap

A teljes vírusszint HAART alatt Az új fertőzések gátoltak: β = 0

Az új fertőzések gátoltak NYIROKRENDSZER VÉR T VPVP I T I VLVL V P : vírus a vérben V L : vírus a nyirokrendszerben i e

A teljes vírusszint kezelés alatt 3 időskála: a leglassabb a meghatározó: 0.5 per nap Következtetés: δ = 0.5 per nap Az új fertőzések gátoltak: β = 0

Kompartment összefoglaló I. a vérben a vírusrészecskék átlagos élettartama 1 óra a nyirokrendszerben 8 óra a vírustermelő sejtek élettartama 2 nap folyomány: több vírus termelődik, mint gondoltuk

Kompartmentek II. sejttípusok szerint

A látensen fertőzött sejtek szerepe a HIV perzisztenciájában hosszú távú kezelés után idő hetek hónapok évek a kezelés kezdete logV a vírusszint süllyedése lassul a kezelés alatt

A vírustermelés forrása első szakasz: produktívan fertőzött T-sejtek második szakasz: perzisztensen fertőzött sejtek (?) harmadik szakasz: ??? L T V I T: célsejt L: látensen fertőzött sejt I: produktívan fertőzött sejt V: vírusrészecske

Látensen fertőzött sejtek fertőzött aktivált T-sejtekből memóriasejtek – hosszú élettartam – nyugvó állapot: nincs vírusreplikáció – újra aktiválhatók a kezelés előrehaladtával lassul az állomány zsugorodása

A modell feltevések : – a reaktivált látensen fertőzött sejtek produktívan fertőzött állapotba lépnek vissza – a reaktiváció rátája sejtenként eltéréseket mutathat – a kezelés megakadályozza újabb sejtek fertőzését L VI α δLδL δc p Írjuk fel az egyenleteket!

Stacionárius állapot (kváziegyensúly) konstans aktivációs ráta esetén exponenciális fogyás az aktivációs ráta szerint

Eloszlást követő aktivációs ráta látensen fertőzött sejtek: vírusrészecskék : L 0 (α) a látensen fertőzött sejtek kezdeti eloszlása az aktivációs ráta szerint

Eredmény lassuló fogyás a kezdeti eloszlástól függetlenül a könnyen aktiválható klónok kimerülése miatt az eloszlás a kisebb aktivációs ráták felé tolódik el

Eredmény az idő előrehaladtával a látensen fertőzött sejtek vírustermelése válik meghatározóvá a látensen fertőzött sejtek fogyása a természetes halálozási rátához tart a sejtenkénti vírustermelés rátája folyamatosan csökken

Utótörténet (újabb eredmények) Kísérleti megerősítés: az „öregebb” látensen fertőzött klónok lassabban fogynak. Elképzelhető, hogy a látensen fertőzött sejtek egy része homeosztatikus osztódással fenntartja az állományt. (~ „zéró” fogyási ráta)

Forrás Müller, V., Marée, A. F. M. & De Boer, R. J. (2001) Release of virus from lymphoid tissue affects human immunodeficiency virus type 1 and hepatitis C virus kinetics in the blood. J Virol 75, Müller, V., Vigueras-Gomez, J. F. & Bonhoeffer, S. (2002) Decelerating decay of latently infected cells during prolonged therapy for human immunodeficiency virus type 1 infection. J Virol 76,