A P elem technikák: enhanszerek és gének csapdázása

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
„az emberek hazudnak, de a bizonyítékok nem”
Advertisements

Daganatkeltő hatások A karcinogének egy adott populációban szignifikánsan emelik a daganatok gyakoriságát 2 fő típus: Mutagén (genotoxikus) daganatkeltő.
A mutagenezis célja, haszna Mutáció Az egyed megjelenése (fenotípusa) megváltozHAT Ebből visszakövetkeztethetünk a mutációt szenvedett gén funkciójára.
Mol. biol. módszerek Dr. Sasvári Mária
FEHÉJE INTERAKCIÓN ALAPULÓ
Mutációk.
EXPRESSZIÓS RENDSZEREK
Delta Bio 2000 Kft. Ügyvezető: Dr. Haracska Lajos
Génexpresszió más (nem-E.coli) prokariótában
A génaktivitás szabályozása
Rekombináns fehérjék termeltetési stratégiái
Drozophila jó modellállat, mert:
Az intergénikus régiók és a genom architektúrájának kapcsolata Craig E Nelson, Bradley M Hersh és Sean B Carrol (Genome Biology 2004, 5:R25) Bihari Péter.
Antibiotikumok fejlesztése a genomika segítségével
A universal method for automated gene mapping Peder Zipperlen, Knud Nairz, Ivo Rimann, Konrad Basler, Ernst Hafen, Michael Hengartner and Alex Hajnal Genome.
Real-Time PCR gyakorlati alkalmazások bevezetés Párosítsuk a gélfotóra felvitt mintákat a megfelelő olvadáspontú termékekkel!
Genome2D: bakteriális transzkriptóma megjelenítését szolgáló eszköz (szoftver) Csernetics Árpád Bioinformatika SZIT ápr. 18.
Molekuláris genetika Falus András.
génszabályozás eukariótákban
Polimeráz láncreakció (PCR)
MUTÁCIÓ ÉS KIMUTATÁSI MÓDSZEREI
SV40 infekció transzformált sejt. „korai” gének (early - E) „késői” gének (late - L) 4.7 kb SV40 genom - kicsiny „tanulóvírus” fertőzést követően először.
A genotoxicitás szintjei
GAZDA GRAS: generally recognized as safe Intracelluláris / szekréció Proteázok Termelés, szekréció szinkronizálás Gazda kialakítása.
Ahhoz, hogy dolgozni tudjunk égy adott génnel, vagy szekvenciával nagy mennyiségű DNS-re van szükségünk, ezért valamilyen módon „klónozni” kell, a gén.
Transzdukció Készítette: Őri Zsuzsanna Emese 2007.március 30.
Plazmidok Készítette: Vásárhelyi Miklós. : E. Coli jól használható genetikai kísérletekben: Genomja kicsi(4,2*10 6 bázispár, kb. ezrede az emberének)
Készítette: Leidecker Orsolya
Készítette: Kiss László
2009. november 26. Transzgének expressziós profiljának felvétele Transzgének expressziós profiljának felvétele Kukoricabogár- és herbicid-rezisztens növények.
Drogok fejlesztésének lépései: preklinikai, és I, II, III, IV fázisok
DNS chipek, DNS hibridizáció
FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓ
Arabidopsis thaliana tip120 inszerciós mutáns jellemzése
T-SEJTEK FEJLŐDÉSE ÉS DIFFERENCIÁCIÓJA.
AZ ELLENANYAG SOKFÉLESÉG GENETIKAI HÁTTERE. AZ ELLENANYAGOK SZERKEZETE KOMPLEMENT AKTIVÁCIÓ SEJTHEZ KÖTŐDÉS LEBOMLÁS TRANSZPORT Könnyű lánc (L) Nehéz.
C mIg H mIg L TCR  TCR  T-SEJT  C V Antigén receptor TCR A B- ÉS T-SEJTEK ANTIGÉN FELISMERŐ RECEPTORAI HASONLÓ SZERKEZETŰEK TCR =  +  A.
A genetika (örökléstan) tárgya
Domináns episztázis – lovak
A Drosophila szemszín öröklődése
BROKINNOVOUCHER Szeged, November 10.
A P elemek mobilitásának szabályozása
A P elem technikák: deléció izolálása P elem remobilizációval
A P elemek felfedezése, felépítése és mobilitásuk mechanizmusa
A P elem technikák: enhanszerek és szupresszorok azonosítása
A SEJTCIKLUS ÉS A RÁK KAPCSOLATA
A P elem technikák: génmanipuláció tetszés szerint
A foszfát csoport az S, T és Y oldalláncok hidroxil- csoportjához kapcsolódik.
A Wnt5a és Wnt11 szignálmolekulák expressziójának vizsgálata dohányfüst indukálta légúti gyulladásmodellben Immunológiai és Biotechnológiai Intézet Farmakológiai.
Városi Rendészeti Program. Mi a Városi Rendészeti Program célja?  Az Önkormányzat Közterület felügyeletének munkáját segítse azáltal, hogy egy közös.
A genom variabilitás orvosi jelentősége Gabor T. Marth, D.Sc. Department of Biology, Boston College Orvosi Genomika kurzus – Debrecen, Hungary,
Génexpressziós chipek mérési eredményeinek biklaszter analízise.
Bio-assay: Ismert érzékenységű biológiai objektum vizsgálandó hatásra adott válaszának mérése Pl.: WEHI-164: TNF  B9 : IL6 „Riporter” sejtvonalak RARE-LacZ.
Sejtek genetikai módosítása (gének bevitele vagy eltávolítása)
Vakcinák. Edward Jenner Fekete himlő Tehén himlő Fekete himlő Tehén himlő
Márk Ágnes, Barna Gábor, Csomor Judit, Kriston Csilla, Matolcsy András
Minőségi és mennyiségi jellegek öröklődése
Új molekuláris biológiai módszerek
Géntechnikák labor kiselőadás Készítette: Nagy Zsuzsanna
Kovács Gergely Péter Az egyed-kapcsolat modell
lecke A gének megváltozása. A génösszetétel megváltozása
Humángenetika Makó Katalin.
Új molekuláris biológiai módszerek labor
The lactose (lac) operon - an example for prokaryotic gene regulation
Molekuláris biológiai módszerek
Új molekuláris biológiai módszerek
Mozgásvizsgálat gyakorlat
Molekuláris biológiai módszerek
MTA Agrártudományi Kutatóközpont
Adaptív fenotipikus plaszticitás és adaptív evolúció ---- egymás ellen/helyett, egymás mellett, vagy együttműködnek?
Előadás másolata:

A P elem technikák: enhanszerek és gének csapdázása Génmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák A P elem technikák: enhanszerek és gének csapdázása

A mutátor elem felépítése meghatározza a P elem mutagenezis jellegét enhanszer csapdázás – génexpresszió, mutagenezis, klónozás Géncsapdázás – génexpresszió, mutagenezis, klónozás irányított génexpresszió – génfunkció vizsgálata, kölcsönhatások epitóp jelölés – géntermékek követése és tisztítása, in vivo analízis irányított génszupresszió – génfunkció vizsgálata, null fenotípus helyspecifikus rekombináció- génfunkció vizsgálata, többfunkciós gének irányított géncsere – mutagenezis, gén és protein funkció vizsgálata

A P-lacW enhanszer csapdázó elem felépítése Hsp70 terminátor szekvencia enhanszer P promóter gén lacZ mini-white ori amp E B Génexpresszió követését teszi lehetővé Marker gén lehetővé teszi a P elem követését Bakteriális szekvencia a DNS klónozást teszi lehetővé P{PZ} enhanszer csapdázó elemben a rosy marker gén található a mini-white helyett

A patched gén közelébe inszertálódott P-lacZ elem expressziós mintázata imágókorongokban szárny szem

A P-Gal4 alapú enhanszer csapdázás mechanizmusa Hsp70 terminátor szekvencia enhanszer P promóter gén Gal4 mini-white ori amp E B Gal4 lacZ/gfp detektálás 5xUAS

GFP riporter expressziója P-Gal4 enhanszer csapdázó vonalakban

Enhanszer csapdázó inszerciók létrehozása P-lacZ mutátor törzs transzpozáz forrás W- P(Δ2-3), Sb X Y TM6, Tb P(w+) P-lacZ W- P(Δ2-3), Sb W- X Y W- „jump-starter” hímek Y W- P-lacZ P-lacZ W- vagy Y lacZ expressziójának detektálása

A enhanszer csapdázás előnyei A riporter gén expressziója speciális sejtmarkerként használható Követhetők a sejtek az egyedfejlődés során Egyedi identitást adhat a sejteknek olyan stádiumban, amikor morfológiailag még nem különülnek el Gyakran nem érinti a gén funkcióját, vagy hipomorf allélt eredményez Egyszerű mutációs analízist, és gyors klónozást tesz lehetővé

Az enhanszer csapdázás korlátai Sok enhanszer csapdázó inszerció nem okoz mutációt Nem mindig egyértelmű, hogy egy enhanszer szekvencia melyik gén expresszióját befolyásolja Gyakran az érintett gén távol helyezkedik el az enhanszertől Egy riporter gén aktivitását egyszerre több enhanszer szekvencia is befolyásolhatja

A kettősen jelölő pGT1 géncsapdázó elem felépítése SD Gal4 hs-neo mini-white promóter exon1 exon2 exon3 poli-A poli-A exon1 Gal4 mini-white exon2 exon3 poli-A w+ szemszín Gal4 lacZ/gfp detektálás 5xUAS

A P elem technikák: irányított génexpresszió Génmanipuláció ecetmuslicában: P elem technikák A P elem technikák: irányított génexpresszió

Irányított génexpresszió a Gal4 moduláris rendszerben - 1 Hsp70 terminátor szekvencia enhanszer P promóter gén Gal4 mini-white ori amp E B Gal4 vizsgált gén 5xUAS

Irányított génexpresszió mechanizmusa -2 promóter UAS mini-white ori amp gén Gal4 mini-white ori amp

Enhanszer csapdázás különleges esete: sejtek eliminációja Hsp70 terminátor szekvencia enhanszer P promóter gén Gal4 mini-white ori amp E B Gal4 gyilkos gén 5xUAS ricin, diftéria toxin reaper, grim, hid tetanusz toxin

Az epitóp jelölés mechanizmusa SD mini-white GFP FRT FRT FLP rekombináz SA SD promóter exon1 GFP exon2 exon3 poli-A GFP poli-A

GFP epitóppal jelölt proteinek kifejeződése