Mikrobiológia labor Segédanyag a közös mikroszkópos gyakorlatokhoz

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Lehetnek számunkra hasznosak a mikrobák?
Advertisements

Tükrök leképezése.
Tallósy Szabolcs Péter, Dr. Janovák László, Prof. Dr
Mi az a mikroorganizmus?
2010. augusztus 16.Hungarian Teacher Program, CERN1 Gyorsítók Veszprémi Viktor ATOMKI, Debrecen Supported by OTKA MB
Mik azok a mikrobák?.
Multimédiás segédanyag
Lencsék és tükrök képalkotásai
ACTINOMYCES NEMZETSÉG
Az optikák tulajdonságai
Génexpresszió más (nem-E.coli) prokariótában
Szabad aminosavak termelésének kimutatása a talajmikroorganizmusok tenyészetében.
Antibiotikumok kimutatása a talajból
Egy pontból széttartó sugarakat újra összegyűjteni egy pontba
Film fénytöréshez Lencsék Film fénytöréshez
Homorú tükör.
II. divízió: Firmicutes (Gram-pozitív baktériumok)
Egyszerű mérőeszközök
KOLLOID OLDATOK.
Mikroszkópi mérések Távolságmérés (vastagságmérés) mikroszkóp segítségével - Krómozott munkadarabon a krómréteg vastagsága, - A szövetszerkezetben előforduló.
TRANSZMISSZIÓS ELEKTRONMIKROSZKÓP (TEM)
A növények ásványianyag-felvétele
a fotózás technikai alapjai
Ülepítés gravitációs erőtérben Fényszórás (sztatikus és dinamikus)
Készítette: Kiss László
FERMENTÁCIÓS RENDSZEREK LEVEGŐELLÁTÁSA
FLUORESZCENS IN SITU HIBRIDIZÁCIÓ
Egy folyékony mintában valamilyen baktérium koncentrációját szélesztést követően agarlemezes telepszámlálással határozzuk meg. Tízes alapú hígítási sort.
csillagász távcsövek fotoobjektív vetítőgép
FÉNYTAN Összeállította: Rakovicsné Erdősi Katalin 2008.
A lencsék gyakorlati alkalmazása Využitie šošoviek v praxi
A gombák.
A vírusok, a prokarióták és az állati egysejtűek
Nyitókép TÜKRÖK.
Tk.: oldal + Tk.:19. oldal első két bekezdése
Penészgomba vizsgálat levéltári iratátvételek során
-fényvisszaverődés -fénytörés -leképező eszközök
AZ ÁLLATI ÉS A NÖVÉNYI SEJT ÖSSZEHASONLÍTÁSA
Különböző spéci mikroszkópok és festési eljárások
A feloldóképesség határa És ami a határon túl van Csik Gabriella Semmelweis Egyetem, Biofizikai Intézet.
Egységes Mikrobiológiai Vizsgálati Rendszer
A gombák.
A fény hullámjelenségei
Sejtalkotók III..
Van de Graaff-generátor
Emberi neutrofil granulociták egy sejten kívüli baktérium ellenes mechanizmusa: a mikrovezikulák Dr. Timár Csaba Semmelweis Egyetem, Élettani Intézet 2014.
Az élővilág főbb csoportjai, mikroorganizmusok
Az élővilág legkisebb egységei
OPTIKAI LENCSÉK 40. Leképezés domború tükörrel és szórólencsével.
Sejttan.
Bakteriális megbetegedések
OPTIKAI TÜKRÖK ÉS LENCSÉK
Fénytani eszközök A szem.
Összeállította: Csizmazia Ferencné dr. főiskolai docens
BAKTERIÁLIS SZENNYEZÉS
Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota.
Az ősi nem feltétlenül fejletlen
1. 2 MICROTESTER ÚJ TECHNIKA A MIKROBIOLÓGIÁBAN Dr. Reichart Olivér Dr. Szakmár Katalin Budapest, február 15. A redox-potenciál mérésen alapuló.
Baktériumok.
A prokarióták.
Géntechnikák labor kiselőadás Készítette: Nagy Zsuzsanna
Mikrobák mennyiségi meghatározása
BAKTÉRIUMOK.
Mikrobiológia labor Segédanyag a közös mikroszkópos gyakorlatokhoz
Közönséges (a) és lineárisan poláros (b) fény (Niggli P. után)
Különböző spéci mikroszkópok és festési eljárások
Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése
Készítette: Porkoláb Tamás
Antibiotikumok kimutatása a talajból
Előadás másolata:

Mikrobiológia labor Segédanyag a közös mikroszkópos gyakorlatokhoz Összeállították: Dr. Janzsó Béla Dr. Molnár Mónika Nagy Zsuzsanna Dr. Suhajda Ágnes Tolner Mária 2013. március

Mikroszkóp képalkotása 1. B: preparátum c’ : az objektív által alkotott, fordított állású nagyított valódi kép c : az okulár által c’-ről alkotott nagyított virtuális kép Mikroszkóp nagyítása: objektív x okulár

Mikroszkóp képalkotása 2.

A mikroszkóp felbontóképessége d = az a legkisebb távolság a tárgyon, amelynek végpontjait a mikroszkópos képen még különállónak látjuk Abbe → d = λ / sinµ ill. λ / n ·sinµ ahol λ: a megvilágító fény hullámhossza, µ: a beeső fény-nyaláb félkúpszöge n: a preparátum és az objektív közötti közeg törésmutatója n · sinµ = A (NA) az objektív numerikus aperturája levegő → n = 1 immerziós olajok → n = 1,3 -1,6 Olajimmerzió használata csak speciális objektívvel!

A mikroszkóp felbontóképessége (folyt.) Az optikai tengellyel párhuzamos megvilágítás esetén: d= λ / n ·sinµ = λ / A Ferde megvilágítás esetén: d= λ / 2 ·n ·sinµ = λ / 2A ↑

Élesztőgombák Saccharomyces cerevisiae (sütő- vagy pékélesztő) Sejtjei oválisak, 5–10 m átmérőjűek, sarjadzással, más néven bimbózással szaporodik.

Élesztőgombák Schizosaccharomyces pombe Sejtjei lekerekedett végű henger alakúak. Hasadással szaporodik. Átmérője kb. 3,5 m, hossza pedig kb. 8-14 m. A sarjadzó élesztővel (S. cerevisiae) ellentétben a Schizosacch. pombe osztódása szimmetrikus: két (közel!) azonos méretű leánysejt keletkezik.

Penészgombák Mucor sp. (fejespenész) Mucor racemosus spóratartó fejek (sporangia) spórákkal Mucor mucedo tenyészet

Penészgombák Rhizopus sp. Rhizopus stolonifer spóratartó fej Rhizopus nigricans tenyészet kenyéren „lépegető penész”

Penészgombák Aspergillus sp. Aspergillus niger (feketepenész vagy korompenész)  konídiumtartóról lesodródott konídiumok konídiumtartó térhatású felvételen 

Penészgombák Penicillium sp. Penicillium expansum  ecsetszerű konídiumtartók és lesodródott konídiumok konídiumtartó térhatású felvételen  Penicillium sp. tenyészet Petri-csészében

Baktériumok Lactobacillus plantarum Mikroszkópos felvétel festett preparátumról Scanning elektronmikroszkópos felvétel

Baktériumok Lactococcus (Streptoccocus) lactis Scanning elektronmikroszkópos felvétel Mikroszkópos felvétel Gram színezett tenyészetről (Gram+ baktérium)

Baktériumok Escherichia coli Fakultatív anaerob, pálcika alakú baktérium. Általában peritrich csillós, de lehet csillótlan is. Könnyen és jól tenyészthető. Rendszerint melegvérű állatok tápcsatornájának alsó szakaszában él. A legtöbb szerotípus ártalmatlan, de vannak emberben ételmérgezést okozó változatai is. Fekális eredetű szennyezés indikátora. A veszélytelen törzsek az emésztőrendszer normális flórájához tartoznak, K2-vitamint termelnek. Jelenlétük megnehezíti egyes patogének elszaporodását a bélrendszerben. Gram festés szerint negatív

Baktériumok Pseudomonas fluorescens Nagyon változatos metabolizmussal rendelkező, talajban, természetes vizekben gyakran előforduló, ún. ubikviter baktérium. Obligát aerob, pálcika alakú, többszörös flagellummal rendelkezik. Tenyészete UV fényben zöldeskék színben fluoreszkál. Gram szerint (az E. coli -hoz hasonlóan) negatív festődésű.

Baktériumok Bacillus subtilis Szénabacilus néven is ismert, a talajban, növényeken általánosan fellelhető Gram+, baktérium. Pálcika formájú, aerob, endospórás. Sok ostora van, ezért gyors mozgásra képes. Bacillus endospórák spóraszínezéssel Scanning elektronmikroszkópos felvétel

Baktériumok Streptomyces sp. (fonalas baktériumok) Streptomyces coelicolor tenyészete Petri-csészében  Streptomyces rimosus

Speciális színezési módszerek Mikroorganizmusok minőségi vizsgálata Többféle színezék alkalmazása Mikroorganizmusok differenciálása Speciális sejtalkotórészek kimutatása

Baktériumok sejtfaltípusai Csoport Szervezet Sejthatároló felület összetétele Speciális jellemzők 1. Mycoplasma sp., Halobacterium, protoplaszt (Bacillus megaterium) Citoplazma-membrán peptidoglikán hiányzik 2. Gram-pozitív baktériumok Sejtfal (egyrétegű), citoplazma-membrán peptidoglikán van 3. Gram-negatív baktériumok Sejtfal (többrétegű), citoplazma-membrán 4. Lampropedia hyalina Külső kettős köpeny, cementálóréteg, sejtfal, citoplazma-membrán ?

Gram- és Gram+ sejtfal felépítése

Gram-színezés Hans Christian Joachim Gram (dán kutató) Elv: trifenil-metán típusú színezék + jód oldat jódpararozanilin komplex Gram+ sejtekből nem mosható ki, Gram- sejtekből igen + kontraszt színezés Eredmény Japán Gram-próba (40 % KOH) http://www.path.cam.ac.uk/Microbiology/BI_Bacteriology/CL_Clostridia/M_BI_CL_20small.jpg http://faculty.ccbcmd.edu/courses/bio141/labmanua/lab6/images/Ecoli01_scale.jpg http://homepages.wmich.edu/~rossbach/bios312/LabProcedures/Gramposcocci.jpg

Gram-festés menete Kenet készítés Bacillus cereus Gram (+) Szárítás Rögzítés Festés kristályibolyával 2 percig /leönteni!/ Lugol 2 perc Mosás aceton-etanollal Mosás csapvízzel Festés szafraninnal 2-3 perc Mikroszkópizálás (40x) Olajimmerzió Gram (+) sejt kék Gram (–) sejt piros Bacillus cereus Gram (+) Escherichia coli Gram (–)

Tok kimutatása Tok: nyálkaburok, körülveszi a sejtet Anyaga: homogén vagy heterogén, poliszacharid, polipeptid, aminocukor, fehérje-lipopoliszacharid Egyszerű vagy bordás Szerepe: patogének virulenciája, véd a fagocitózis ellen véd a kiszáradástól tartalék tápanyag lokalizáció tápanyag-adszorpció Kimutatás: negatív festés

Mitokondrium és glikogén kimutatása Mitokondrium : kémiai energia átalakítása és termelése Kimutatása: Redox festékkel Glikogén: tartaléktápanyag Lugollal

Speciális sejtalkotórészek megfestése Tokfestés Schizosaccharomyces pombe  Egy csepp tusban szuszpendálunk egy kacsnyi 72 órás mikrobát.   Mitokondrium festés Saccharomyces cerevisiae (T22)  Egy csepp Janus zöld oldatban szuszpendálunk 1 kacsnyi 24 órás T22-t. Glikogén festés Egy csepp Lugol oldatban szuszpendálunk 1 kacsnyi 24 órás T22-t.

Endospóra képzés Bacillus, Clostridium, Sporosarcina sp. A szülősejt kitartó állapota, nincs anyagcseréje A túlélést teszi lehetővé Rendkívül ellenálló Elhelyezkedés: terminális, centrális, szubterminális, Alak: szubtilisz (1,2), klosztrídium (3,4,5,6) http://w3.georgikon.hu/tanszekek/Novtud/Mikrobiologia/agr%20mikro%201.pdf

Spóraszínezés Malachitzölddel Karbolfuxinnal Spóra: zöld Szuszpenzió készítése Szárítás Rögzítés /láng felett áthúzni 2-3 szor/ 10 percig szárítópadkán malachitzölddel melegítjük /ne száradjon be/ Mosás 1/2 percig vízzel Szafraninos festés 3 perc Mosás csapvízzel Mikroszkópizálás (40x) Karbolfuxinnal Szuszpenzió készítése Szárítás Rögzítés /láng felett 2-3szor áthúzni/ 10 percig szárítópadkán Ziehl-Nielsen féle karbolfuxinnal melegítjük /ne száradjon be/ Vizes öblítés 10%-os kénsavval mosás Festés metilénkékkel 2-3 perc Mosás csapvízzel Mikroszkópizálás (40x) Spóra: zöld Vegetatív sejt: piros Spóra: piros Vegetatív sejt: kék

Mérés mikroszkóppal Okulár mikrométer Objektív mikrométer (a mikroszkóp szemlencséjébe kell beilleszteni) Objektív mikrométerrel kalibrálandó 100 osztást tartalmaz Objektív mikrométer mérőskálát tartalmazó, csiszolt tárgylemez, amelyen 1 osztás 10 m 1 mm = 100 rész (0,01 mm = 1 rész)

Okulár mikrométer kalibrálása Az okulár mikrométeren egy 5 vagy 10 mm hosszú vonalszakasz 100 részre van osztva. Ezt a mérőokulárba helyezzük. Az objektív mikrométer egy csiszolt tárgylemez, amelyen egy 1 mm-es vonalszakasz 100 részre van osztva és fedőlemezzel le van fedve. Mikroszkópos méréshez meg kell állapítani az okulár mikrométer 1 osztásközének az értékét. Ehhez az objektív mikrométert a tárgyasztalra helyezzük, az objektív mikrométer osztásait élesre állítjuk. A látótérben most a két mikrométer-osztást egyszerre látjuk. A tárgyasztal mozgatásával és az okulár elfordításával a két mikrométer-osztást fedésbe hozzuk úgy, hogy a két kezdőpont egybeessen. Megkeressük a két skálán azt a pontot, ahol a két osztásvonal egybeesik. Megszámoljuk az objektív- és az okulár mikrométer osztásvonalainak számát eddig a pontig. Az okulár mikrométer 1 osztásközének értéke μm-ben: (objektív mikrométer-osztások száma × 10) / (okulár mikrométer-osztások száma). Különböző nagyításoknál különböző értékeket kapunk. Dr. Horváth Sándor: Mikrobiológiai praktikum, Tankönyvkiadó, Budapest, 1980

Az okulár mikrométer kalibrálása után mérhetünk a mikroszkóppal sejtek méretét (átmérő, hossz, vastagság), szálas anyagok vastagságát, mikroszkópikus részecskék méreteit stb.

Mikroszkópos számlálókamra: Bürker Élesztők és penészgomba konídiumok, spórák számlálására A számlálókamrák különlegesen kiképzett tárgylemezek, amelyeken ismert területű beosztás található. A fedőlemez feltételével meghatározott magasságú réteg keletkezik és ezáltal a beosztásban elhelyezkedő folyadék térfogata ismert. A Bürker kamra két négyzethálós beosztású teret tartalmaz. Kamra mélysége: 0,1 mm X: 1/400 mm2 Y: 1/25 mm2

Számlálás Bürker kamrában A Bürker-kamra két egymástól vájattal elválasztott négyzetes beosztást tartalmaz, így akár két különböző szuszpenzió vizsgálatára alkalmas. A megszámlálandó négyzeteket a számlálókamra egész felületéről véletlenszerűen választjuk ki. A számlálásnál célszerű következetesen a felső és a jobb oldali határvonalon levő sejteket a négyzet belsejében levőkhöz adni. Az 1 ml-ben lévő sejtszámot úgy számítjuk ki, hogy a kis négyzetekhez tartozó átlagos sejtszámot 4×106-nal, a nagy négyzetekhez tartozót 2,5×105-nel szorozzuk.