GPU megoldások a Medisónál

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Nukleáris Képalkotás 2 Rekonstrukció
Advertisements

A sugárterápia folyamata
Az ipari komputer tomográfia vizsgálati lehetőségei
Számítógépes grafika Szirmay-Kalos László
Számítógépes grafika Szirmay-Kalos László
3D képszintézis fizikai alapmodellje
Máté: Orvosi képfeldolgozás3. előadás1 Torzítás. Máté: Orvosi képfeldolgozás3. előadás2 A tárgy nagyítása A forrás nagyítása forrás tárgy kép A tárgy.
Becquerel I. Curie és Joliot Hevesy György
A soros és a párhuzamos kapcsolás
A relatív molekulatömeg
Nukleáris anyagok azonosítása és jellemzéseIKI - Izotóp Kft közös ülés ápr. 26 Nukleáris anyagok azonosítása és jellemzése Az MTA Izotópkutató Intézetében.
Innovatív medicina Dr. Demeter Béla
Bose-Einstein korrelációk Novák Tamás Radboud University Nijmegen Károly Róbert Főiskola, Gyöngyös Július 18.
A SPECT képalkotás Szigeti Krisztián. A szeminárium menetrendje dátumtémaelméletiklinikai SPECTSzigeti Krisztián (fizikus)Korom Csaba (orvos,
Pozitron Emissziós Tomográfia - Fizika – Műszaki fejlődési irányok
Orvosi alkalmazások grafikus megjelenítése
PAJZSMIRIGYBETEGSÉGEK
6. A 3D grafika alapjai 6.1. A 3D szerelőszalag fölépítése
ALAPVETŐ TÉRELEMEK KÉT KÉPSÍKOS ÁBRÁZOLÁSA
Problémás függvények : lokális optimalizáció nem használható Globális optimalizáció.
STACIONÁRIUS RÉSZECSKETRANSZFER SZIMULÁCIÓJA MONTE CARLO ALAPOKON Kristóf Tamás Pannon Egyetem, Kémia Intézet Fizikai Kémia Intézeti Tanszék „Szabadenergia”
Bemutatjuk a híres/fontos W  és Z 0 Bozonokat Sheldon Glashow Steven WeinbergAbdus Salam Ők jósolták meg elméletileg. Nobel díj: 1979 Ők pedig felfedezték.
Térfogatvizualizáció
Pozitron-Emission Tomography Reconstruction (A computer graphics view) Szirmay-Kalos László.
Térfogatvizualizáció
Számítógépes grafika Bevezetés
3D képszintézis fizikai alapmodellje Szirmay-Kalos László Science is either physics or stamp collecting. Rutherford.
Dr Jedlovszky Pál ELTE TTK
Spindinamika felületi klaszterekben Balogh L., Udvardi L., Szunyogh L. BME Elméleti Fizika Tanszék, Budapest Lazarovits B. MTA Szilárdtestfizikai és Optikai.
Tárolók és háttértárak A legkisebb tárolható egység 8bit = 1byte (szó) Tárkapacitás = tárolható adatmennyiség byte-ban Szorzók: kilo-, mega-, giga-, terabyte.
Radon transzformáció (J. Radon: 1917)
CUDA C/C++ programozás Szál struktúra A segédanyag készítése a TÁMOP A/ Nemzeti Kiválóság Program című kiemelt projekt keretében.
Fotorealisztikus képszintézis valós időben Szirmay-Kalos László, Csébfalvi Balázs BME IIT.
CUDA C/C++ programozás Atomikus műveletek A segédanyag készítése a TÁMOP A/ Nemzeti Kiválóság Program című kiemelt projekt keretében.
Elektronmikroszkópia
Máté: Orvosi képfeldolgozás8. előadás1 Kondenzált képek Transzport folyamat, pl. mukocilliáris klírensz (a légcső tisztulása). ROI kondenzált kép F 1 F.
Üreges mérőhely üreg kristály PMT Nincs kollimátor!
Ütközés detektálás Ács Zsombor.
PPKE-ITK I.Házi Feladat Megoldásai Matyi Gábor Október 9.
Máté: Orvosi képfeldolgozás5. előadás1 Mozgó detektor: előnyHátrány állójó időbeli felbontás nincs (rossz) térbeli felbontás mozgójó térbeli felbontás.
1 Számítógépek felépítése 13. előadás Dr. Istenes Zoltán ELTE-TTK.
Máté: Orvosi képfeldolgozás12. előadás1 Regisztrációs probléma Geometriai viszony meghatározása képek között. Megnevezései: kép regisztráció (image registration),
Máté: Orvosi képfeldolgozás12. előadás1 Három dimenziós adatok megjelenítése Metszeti képek transzverzális, frontális, szagittális, ferde. Felület síkba.
Egy magfizikai detektor informatikai háttere
Úton az elemi részecskék felé
Magdics Milán.  BME Irányítástechnika és Informatika Tanszék (IIT)  Tanszékvezető: Dr. Szirmay-Kalos László  Főbb kutatási területek:  Globális illumináció.
1 Számítógépek felépítése 5. előadás a CPU gyorsítása, pipeline, cache Dr. Istenes Zoltán ELTE-TTK.
Megerősítéses tanulás 5. előadás
GPU alapú fotontranszport nagyfelbontású heterogén közegben BME IIT Szirmay-Kalos László Magdics Milán Tóth Balázs.
3.2. Axonometria – Műszaki rajzok párhuzamos vetítéssel
Digitális képanalízis
GPU-alapú SPECT képalkotás Wirth András. SPECT képalkotás Single-Photon Emission Computed Tomography.
Bemutatkozás Magdics Milán Született: Budapest, augusztus 30.
Nukleáris medicina Lényege: A radioaktív izotópok diagnosztikai és therápiás célból való felhasználása.
Gastroenterológia PTE Nukleáris Medicina Intézet Zámbó Katalin.
A vese izotóp - vizsgálata gyermek – korban Zámbó Katalin PTE Nukleáris Medicina Intézet.
Számítógépek és eszközök
DTS Mellkas tomoszintézis rendszer kifejlesztése
Általános célú számítások a GPU-n
1Pongrácz Ferenc, 1Valálik István
Hardver.
9.16.Tengely, mint forgástest
Pozitron Emissziós Tomográfia (PET)
Optikai mérések műszeres analitikusok számára
Digitális röntgen vizsgálati eljárások
Optikai mérések műszeres analitikusok számára
Bevezetés GPGPU Alkalmazások.
Számítógépek és eszközök
Cache példák 2019 (IMSC).
Előadás másolata:

GPU megoldások a Medisónál Wirth András

A MEDISO TÖRTÉNETE 1990 Cégalapítás 1994 Gamma-kamera gyártása 1998 Gamma Művek nukleáris medicinai egységének megvásárlása 2006 Preklinikai SPECT-CT gyártása 2007 Humán SPECT-CT gyártása 2007 MEDISO acquires the PET-CT Ltd. 2008 AnyScan® SPECT/CT/PET 2009 NanoPET/CTTM preklinikai PET-CT 2010 A nanoScan® preklinikai PET/MRI fejlesztésének kezdete

Legfontosabb hardver termékpaletta Anyscan SCP Nano SPECT/CT Nano PET/CT NanoScan PET/MRI

Mediso kisállat SPECT T PMT Elektronika Egér teljestest kollimátor (furat: 1.3 mm) T PMT Elektronika NanoScan SPECT/CT Pinhole leképezés elve

Multi-Pinhole SPECT rekonstrukció Egér pajzsmirigy felvétel, Tc-99m izotóp

Mediso humán SPECT Párhuzamos kollimátor felépítése NanoScan SPECT/CT

Humán SPECT rekonstrukció Jaszczak fantom Hoffman agyfantom Agyfelvétel SPECT-CT fúzió Hoffman agyfantom, multi-pinhole

PET működése PMT PMT PMT PMT PMT PMT Elektronika Elektronika nanoScan PET/CT fúzió

CT működése Fotodióda Rtg-cső

Rekonstrukció Rekonstruálandó térfogat, x Detektorjel, y Leképzés i. j. Rekon-strukció 𝑦 𝑗 𝑥 = 𝑖 𝐴 𝑖𝑗 𝑥 𝑖 Rendszermátrix

Egyszerű vetítés i. voxel j. pixel pár lij Koordinátageometriai számítások metszéspontok (sok milliárd) távolságok forgatások Nagy adatmennyiség (viszonylag) milliárd voxel (CT) 10-100 millió detektor bin Könnyen párhuzamosítható (viszonylag) a rendszermátrix elemei függetlenül számíthatók SIMD teljesül

Monte Carlo vetítés Monte Carlo részecsketranszport sok milliárd foton szimulációja koordinátageometria véletlenszám-generálás Compton-szórás fotoeffektus divergens szálak (pl. szóródott-e a foton vagy sem) írási ütközések (pl. két párhuzamosan számolt foton ugyanabba a pixelbe jut) megoldás: pl. adjungált MC

Preklinikai (kisállat) Rekonstrukció Modalitás Preklinikai (kisállat) Klinikai (humán) CT SPECT PET Parallel és Fan Beam FBP Cone-beam FDK* Iteratív MLTR Cone-beam* MP-EM-MC* (OpenCL) OSEMRRAC (BME IIT) TeraTomo Direkt MC (BME NTI) Rebinning + 2D FBP TeraTomo Adj. MC* (BME IIT) * Multi-GPU

Benchmark (MP-EM-MC)

Benchmark (Phi vs. 780)