MOLEKULÁRIS GENETIKAI MUTATIOS ANALYSIS ENZYMOPATHIÁKBAN (Gaucher kór, Fabry-, Homocystinuria. Menkes-kór, Wiscott–Aldrich syndroma) László Aranka, Amparo.

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás

Advertisements

„Esélyteremtés és értékalakulás” Konferencia Megyeháza Kaposvár, 2009
Újszülött-, és csecsemőkori húgyúti infectio és/vagy pyelectasia előfordulása osztályunkon az elmúlt 7 hónapban. Bodrogi Tibor, Svorenj Gábor, Nagy Katalin.
A társadalmi tényezők hatása a tanulásra
Erőállóképesség mérése Találjanak teszteket az irodalomban
Klaszterek gazdasági környezete
MATEMATIKA Év eleji felmérés 3. évfolyam
A terápia specialitása renális hypertoniában Prof. Dr. de Châtel Rudolf egyetemi tanár Semmelweis Egyetem ÁOK I. sz. Belgyógyászati Klinika, Budapest.
Humánkineziológia szak
Korai fejlesztést igénylő betegségek Genetikai kórokok
Mellár János 5. óra Március 12. v
Saját tapasztalatok M.É 64 éves nő 2007 óta ismert HCV pozitivítás 2008-ban ½ éves sikertelen pegIF+ribavirin th. HCV-PCR: IU/ml Genotípus 1.
6) 7) 8) 9) 10) Mennyi az x, y és z értéke? 11) 12) 13) 14) 15)
Az új történelem érettségiről és eredményeiről augusztus Kaposi József.
Utófeszített vasbeton lemez statikai számítása Részletes számítás
A tételek eljuttatása az iskolákba
VÁLOGATÁS ISKOLÁNK ÉLETÉBŐL KÉPEKBEN.
Védőgázas hegesztések
1. IS2PRI2 02/96 B.Könyv SIKER A KÖNYVELÉSHEZ. 2. IS2PRI2 02/96 Mi a B.Könyv KönyvelésMérlegEredményAdóAnalitikaForintDevizaKönyvelésMérlegEredményAdóAnalitikaForintDeviza.
Molekuláris genetika Falus András.
Antigén receptorok Antitest, T sejt receptor A repertoire (sokféleség) kialakulása Genetikai, Sejt- és Immunbiológiai Intézet Falus András.
Szerkezeti elemek teherbírásvizsgálata összetett terhelés esetén:
Sárgarépa piaca hasonlóságelemzéssel Gazdaság- és Társadalomtudományi kar Gazdasági és vidékfejlesztési agrármérnök I. évfolyam Fekete AlexanderKozma Richárd.
III. Sz. Belgyógyászati Klinika
Idős betegek dialízis kezelésének orvosi, pszicho-szociális és
Kardiovaszkuláris rizikó becslése a laboratóriumi gyakorlatban
Hyperuricaemia és hypertonia Hypertonia Központ Óbuda, Budapest
Diabetes és proteinuria
POLYCYSTÁS OVÁRIUM SZINDROMÁS CSALÁD
Bilateralis opercularis szindróma gyermekkorban
NOVÁK TAMÁS Nemzetközi Gazdaságtan
DRAGON BALL GT dbzgtlink féle változat! Illesztett, ráégetett, sárga felirattal! Japan és Angol Navigáláshoz használd a bal oldali léptető elemeket ! Verzio.
Merre tovább? Tapasztalatok a kétszintű latin nyelvi érettségiről.
MOLECULÁRIS GENETIKA/GENOMIKA 2..
szakmérnök hallgatók számára
Vass László dr., Horváth Ilona dr., Tubak Vilmos
A évi demográfiai adatok értékelése
Neonatológia, rehabilitáció
A neonatális EEG és CFM technika diagnosztikus és prediktiv szerepe
Logikai szita Pomothy Judit 9. B.
Logikai szita Izsó Tímea 9.B.
Az izomdystrophiák molekuláris genetikai vizsgálata
5’ (CAG)n 3’ 4p 16.3 IT 15 gén DR. GEORGE HUNTINGTON ( ) Huntington was born in the U.S. and was trained here in medicine. His interest in hereditary.
Leigh syndroma A biokémiai vizsgálat irányadó!!!
LENDÜLETBEN AZ ORSZÁG A Magyar Köztársaság kormánya.
2007. május 22. Debrecen Digitalizálás és elektronikus hozzáférés 1 DEA: a Debreceni Egyetem elektronikus Archívuma Karácsony Gyöngyi DE Egyetemi és Nemzeti.
Matematika - 5. évfolyam © Kačmárová Fordította: Balogh Szilveszter.
7. Házi feladat megoldása
Gyorsjelentés a Kulturális Központok Országos Szövetsége tagintézményeinek felméréséről Kecskemét,
Tory Kálmán Semmelweis Egyetem, I. sz. Gyermekklinika
ESETISMERTETÉS Semmelweis Egyetem ÁOK, I.sz. Belgyógyászati Klinika
Csurik Magda Országos Tisztifőorvosi Hivatal
A klinikai transzfúziós tevékenység Ápolás szakmai ellenőrzése
Tanulói utánkövetés 2009/2010. A 2009/2010-es tanévben iskolánkban 210 tanuló végzett. 77 fő a szakközépiskola valamelyik tagozatán 133 fő szakmát szerzett.
Nyitott Kapuk 2010 Beiskolázási kérdőívek értékelése.
QualcoDuna interkalibráció Talaj- és levegövizsgálati körmérések évi értékelése (2007.) Dr. Biliczkiné Gaál Piroska VITUKI Kht. Minőségbiztosítási és Ellenőrzési.
Kábítószerek és gyógyszerek szerepe a közlekedésben Varga Tibor-Keller Éva SZTE Igazságügyi Orvostani Intézet SE Igazságügyi és Biztosítás Orvostani Intézet.
1. Melyik jármű haladhat tovább elsőként az ábrán látható forgalmi helyzetben? a) A "V" jelű villamos. b) Az "M" jelű munkagép. c) Az "R" jelű rendőrségi.
GAZDASÁGI ADOTTSÁGOK ÉS FEJLŐDÉSI IRÁNYOK A délkelet-európai országok Novák Tamás MTA – VKI május 16.
Kvantitatív módszerek
Dr. Vojnisek Zsuzsanna, Dr. Szőnyi László, Dr. Dezsőfi Antal
> aspnet_regiis -i 8 9 TIPP: Az „Alap” telepítés gyors, nem kérdez, de később korlátozhat.
25 éves a Pentaglobin Molnár Zsolt SZTE, AITI
A KÖVETKEZŐKBEN SZÁMOZOTT KÉRDÉSEKET VAGY KÉPEKET LÁT SZÁMOZOTT KÉPLETEKKEL. ÍRJA A SZÁMOZOTT KÉRDÉSRE ADOTT VÁLASZT, VAGY A SZÁMOZOTT KÉPLET NEVÉT A VÁLASZÍV.
1 Az igazság ideát van? Montskó Éva, mtv. 2 Célcsoport Az alábbi célcsoportokra vonatkozóan mutatjuk be az adatokat: 4-12 évesek,1.
Az élődonoros veseátültetés előnyei
Horváth Mária Olga, László Edit, Kocsis Ibolya
„Tisztább kép” – együttműködési program Az új szintetikus drogok feltérképezéséért 2 nd European Workshop – ’Breaking the Drug Cycle’ project Budapest,
The lactose (lac) operon - an example for prokaryotic gene regulation
Új molekuláris biológiai módszerek
Előadás másolata:

MOLEKULÁRIS GENETIKAI MUTATIOS ANALYSIS ENZYMOPATHIÁKBAN (Gaucher kór, Fabry-, Homocystinuria. Menkes-kór, Wiscott–Aldrich syndroma) László Aranka, Amparo Chabas, Endreffy Emőke, Várkonyi Ágnes, Timár Erzsébet, Sztriha László, Viktor Kozich, H.K. Ploos van. Amstel, Zeynep Tümer, Hans Ochs, Brian Smart, Raskó István SZTE Szent-Györgyi Albert Orvostudományi Egyetem, Gyermekklinika, Inst. Biochim. Clinica, Barcelona, Charles Univ. First Faculty of Medicine, Center for lnherited Metab Praha, Czech Republic, DNA Laboratory KGCU Univ. Hosp. Utrecht. Netherlands, J.F. Kennedy Institute, Glostrup, Denmak, Division of Infectious Disease, Immunology and Rheumathology, Washington, MTA, SZBK, Genetikai Intézet, Szeged

A Gaucher kór autosomalis recessiv örökletes kórkép, glycolipid raktárbetegség, glucocerebrosidase hiány következtében (glucocerebrosidase gén 1q21). 15 hazai Gaucher kóros családban végeztünk leukocyta- homogenisatumból specifikus enzmdiagnózist, glucosidase aktivitás meghatározást a homo- és heterozygotaság kiszűrésére. 15 homozygotát és 11 G. heterozygotát diagnosztizáltunk. DNS izolálásra és molekuláris genetikai diagnosztikára 15 családban került sor. N370S/de155. N370SIL444P, N370S/7 genotypusokat detectáltunk. Irodalmi adatok szerint az N370S mutatio a non neuropathiás forma, spanyol populatioban 44,3%. 625 É- Portugál, 38,9% UK-ban. Az L444P mutatio ugyancsak neuropathiás Gaucher-ban található (Tsuji et al 1987). Enyhe mutatiok N370S, R359Q, R496H.

Mutatios analysis Fabry-kórban 19 éves férfibetegünknél biokémiai és molekuláris vizsgálat történt. Az alpha-galactosidase aktivitás 1,86 nmol/mg/h volt, az anya és a beteg húga génhordozó 36 nmol/mg/h, 21,7 nmol/mg/h, kontroll 130 nmol/mg/h. Az alpha-galactosidase gén 5. exonjában missense mutatio igazolódott a 266-os codonban az asparaginsavat tyrozin pótolta G-T transversio a positioban.

Homocystinuria Cystationine beta synthase (CBS) gén alábbi 4 mutatióját vizsgáltuk PCR/RFLP technikával (Sebastio et al Hum. Genet. 56: , 1995). 16 éves fiúbetegünknél a plasma és vizelet homocystin szintje extrémfokban emelkedett. Mutatios eredmények: P145L -/- R125Q: -/- L278T: +1-G307S: -/-, compound heterozygotának bizonyult.

Homocystinuria

Menkes gén mutatiós analysise (ATP7A) Módszer: Dideoxy finger printing DDFP és PCR 12-es exon direct sequenálása. Eredmény: Bázispár substitutio missense mutatioval. Wiscott–Aldrich sy. molekuláris genetikai diagnosztikája, praenatalis diagnózisa A Wiscott–Aldrich gén (WAS) az Xp11.22-p ra localizálódik bázispárból áll. A mutatios analysis mRNA/cDNA felhasználásával történik. L. L. 8 éves fiúbetegünk esetében két bázispár deletio igazolódott (313G, 314T) frame shift-et eredményezve és STOP-ot a 120-as (ASP) codonban. Az anya és az anya húga ugyanezen mutatiora carriernek bizonyult. 1 normál allélt és két bázispár deletioból egy allélt hordoznak. Praenatalis dg.: Chorionboholyból a fiú foetus esetében kizárható volt a fenti molekuláris módszerrel a hemizygota érintettség. Conclusio: Fenti kórképekben az alkalmazott molekuláris biológiai metodikák biztonságos diagnózist adnak, praenatalis kórismére is alkalmasak a fenti, jórészt gyógyíthatatlan kórképekben.

Molekularis genetikai mutatios analysis Canavan- és Hunter kórban László A., Jakobs C., Shaag A., Elpeleg O.N., Horváth K., Gál A., Suzanna Bunge, Endreffy E., Szabó M., Raskó I. Szegedi Tudományegyetem ÁOK, Gyermekklinika, Gyermekklinikai Laboratórium, Free University Hospital, Amsterdam, Shaare–Zedek Medical Centre Metabolit Unit. Jerusalem, ÁOK, Radiológiai Klinika, Szeged, SZBK, Genetikai Intézet, Szeged

A Canavan kór (CD) progresszív, infantilis typusú, autosomalis recessiven öröklődő neurodegenerativ kórkép leukodystrophia, amely rapid súlyos lefolyású, motoros functiokésés az érdeklődés elvesztése, spasticitás megalocephalia, progressiv vakság. Pathológiailag myelinvesztés, az agyszövet korai halálhoz vezető szivacsos degeneratioja. Biokémiailag N-acetyl-L-aspartat-amido-hydrolase (ASPA) enzymdefektus jellemzi, amely a központi idegrendszerben asparaginhiányt indukál. Beteg: 7 hónapos csecsemő, progressiv cerebralis laesioval, jellegzetes craniális. MRI képpel. Ideg és izombiopsia nem volt kórjelző.

Módszer: Specifikus enzymvizsgálat a normális arylsulphatase- A activitás (45,8 nmol/mg/protei/h) heterozygotaság alapján metachromatikus leukodystrophia homozygota érintettséget kizárt, a norm. galactocerebrosid- beta-galactosidase activitás orthochromatikus leukodystrophiát vetett el. Kórosan emelkedett a vizelet N- acetylaspartat sav (165 nmol/mol/kreatinin [norm.: 6,6–34]), mely Canavan kórt bizonyított.

Molekuláris genetikai vizsgálatok: A genomikus DNS-t peripheriás vérből standard módszerrel extraháltuk. A Canavan gén 6-os exonjának 183 bp fragmensét amplifikáltuk a genomikus DNS-ből, PCR 2 oligonucleotid primert használtunk CDP1 (CTCTTGATGGGAAGACGATC és CDP2) (ACACCGTGTAAGATGTAAGC). A PCR produktumot direkt sequenáltuk fluorescens dideoxy lánc terminális reakcióval és ABI 377 automata sequenálóval. Eredmények: 914 (A305 E) mutatiora homozygotaság igazolódott a csecsemőnél, ezen mutatiora. A heterozygota frequentia 1/35 és 1/59 az Askenasi populatioban (Kupietzky és mtsai 1988). Ezen mutatio gyakori Európa-szerte a nem-Askenasi populatiokban, a mutált alléloknak kb. 40%-a.

Molecularis genetikai mutatios analysis Hunter kórban A Hunter kór iduronat-2-sulphatase (IDS EC ) X-hez kötött recissiv örökletességű lysosomalis kórkép, heparan és dermatan tárolással. A betegek garoyloid phenotypusuak skeletalis dysmorrphia, ízületi merevség, hepatomegalia, cardiovascularis elégtelenség és mentalis retardatio dominál. Az IDS gén 23 kB 550 aminósavat kódol (Wilson et al 1990.), a genomikus structurát (Flomen és mtsai 1993, Wilson 19934, Lu 1994) közölte 4 hazai Hunter syndromás beteg molekuláris genetikai mutációs analysisére került sor. Módszer: Elsőként Southern-Blot kivitelezése történt. cDNA próbával és a betegek genomikus DNS-ét Hind III. Stu L, TaqI restrikciós endonucleázokkal emésztettük. PCR/RFLP történt, ha az RFLP nem volt informativ, SSCP analysis és direct sequenálásra került sor (Bunge és mtsai 1992). Eredmények: MPS II betegekben kórosan fokozott glucosaminuriát találtunk dysostosissal, jellemzőek voltak a szövettani, fény- és elektronmikroszkópos leletek conjuctiva biopsiából. Missence, non-sencc. splice és frame- shift mutatiokat detektáltunk.

Mutation analysis of the Menkes disease gene (ATP7A) Menkes disease (MD) is an X-linked recessive lethal disorder of copper metabolism with progressive neurodegeneration and connective tissue disturbances leading to disfunction of some copper enzymes (COX) Danks MD locus, ATP7A is mapped to Xq 13.3 (Verga et al,1991, Tümer 1992) ATP7A is organised into 23 exons spanning a genomic region of 150 kb; the exons are relatively large, 77 bp- 726 bp of coding sequence

Mutations leading to MD show great variety, cytogenetic abnormalities, partial deletions of ATP7A intrachromosomal rearrangement balanced X-autosomal translocation,X;2, X;21 In 20% of 200 patients screened there were found gross deletions or rearrangements (Southern-blott) or by PCR amplification of exons/intron- specific primers (Z. Tümer, N. Horn,1996) 12 point mutation have been reported with severe phenotype (Das et al,1994, Tümer et al, 1996)

Galactosaemia Dr. László Aranka SZTE Gyermekklinika

Genotypes in Hungarian galactosemic patients A. László l, Z. Havass 2, E. Endreffy l, P. Megyeri 1, L. J. Elsas 3, Yoon Shin 4, T. Podskarbi 4 l Dept. of Pediatrics, A. Szent-Györgyi Med. Univ., Szeged, 2 Dept. of Pediatrics Erzsébet Hospital, Hmvhely, Hungary, 3 Dept. of Pediatrics, Emory Univ. School of Med. Atlanta, USA, 4 Dept. of Pediatrics and Med. Immunol. Lab. Dr. von Hauner Hosp., Munich, Germany l. Background: In the main galactosemic mutation (Q188R) the arginine is substituted for glutamine at codon 188 in exon 6, with nearly 70% prevalence in Caucasians with galactosemia. In the Duarte mutant allele of the galactose-1-phosphate uridyl- transferase GALT, EC ) GALT genome in base pair 2744 of exon 10 there is an A to G transition resulting an acidic aspartate (D) substitution for an asparagine (N) at codon 314 (N314D) (Reichardt et al. 1992). 2. Subjects: Genotypes of GALT deficient Hungarian galactosemic patients were determined as a population genetic study. 3. Interventions: DNA was extracted from 22 Hungarian galactosemic patients' blood (age: l mo-20y) and the GALT gene was amplified by PCR techniques. The amplified DNA was analysed for the common classic mutation causing severe galactosemia (Q188R) and the Duarte v. (N314D) and for K285N mutation. 4. Results: Q188R mut. was found in 12 out of 22 (54.54%), there were 3 compound heterozygotes for Q188R/N314D (13.63%), 6 out of 22 ones revealed to be N314D Duarte variants, (31.81%), and 8 out of 13 patients for K285N mutation (61.53%). 5. Conclusion: In the Hungarian Caucasian galactosemic patients the frequency for Q188R was 54.54%, for N314D mutation was 31.81%, and K285N mutation was 61.53%.

Family members proposita propositus mother father maternal grandmother maternal grandfather paternal grandmother paternal grandfather Age 20 y 19 y 40 y 41 y 72 y 73 y 66 y 67 y Sings II. family IV/2 IV/5 III/4 III/5 II/7 II/8 II/15 II/16 G-1 PUT U Genotypes mutations comp heterozygote Q188R/non Q188R comp heterozygote Q188R/non Q188R obligatoric heterozygote obligatoric heterozygote heal thy heterozygote heal thy heterozygote

Methods DNA had been extracted from the galactosemic patients’ blood spot and the GALT gene amplified by PCR techniques. The amplified DNA was analysed for the common classic mutation causing severe galactosemia (Q 188 R) and the Duarte variant (N 314). The different genotypes have been compared to the quantitative GALT enzyme activities.

WTG 1391 A (+/+)

Genotypes and allele frequencies of the East-Hungarian galactosemic and Duarte patients' cohort n = 32 All G-1-PUT Q 188R K285 N D1 (N314D) D2 (G1391A) D1 + D2 Unknown homo- zygotes 2 0 – hetero- zygotes – mutation % allele frequency %