PVM programok írása Kozsik Tamás
PVM - Parallel Virtual Machine Szoftver rendszer, mellyel hálózatba kapcsolt számítógépeket egyetlen nagy párhuzamos számítógépként lehet látni és kezelni. Kezdet: Oak Ridge National Laboratory A párhuzamos programok írásának egyik szabványává vált. A publikus változata ingyen elérhető. Sok hardver gyártó biztosítja a saját gépére optimalizált, gyorsabb változatát is.
Felépítése A rendszerben vannak programok, amelyek a felhasználó által írt párhuzamos program futtatását biztosítják. –PVM démon –PVM konzol Vannak C, illetve Fortran77 könyvtárak a párhuzamos programok megírásához.
Használata PVM rendszerbe kapcsolhatunk több - akár különböző típusú - számítógépet. A rendszer a rajta futó programok szempontjából ezek után egy nagy, elosztott memóriájú virtuális számítógépnek látszik. Különböző processzorokon, különböző programokat indíthatunk el. A szinkronizációt és a kommunikációt a PVM könyvtári függvényeivel oldhatjuk meg.
A párhuzamos programok Taszkokból (folyamatokból) épülnek fel Taszk = UNIX/Windows/… program A taszkok a pvm könyvtárat használják –C, C++, Fortran77 A kommunikáció a pvm démonon keresztül történik
Ada taszk vs. PVM Ada task (vagy Java thread): végrehajtási szál –egy programon (processzen) belül –szimulált párhuzamosság, időosztásos ütemezés –light-weight –közös memórián keresztüli kommunikáció, illetve randevú PVM: processz –akár valódi párhuzamosság is, több processzoron –heavy-weight –nincs közös memória, kommunikációs csatornát használunk
Működés Számítógépek hálózatba szervezve A felhasználó jogosult bármelyik gépre bejelentkezni Minden gépen futtat egy pvm démont És futtatja a taszkokat, melyek a démonokon keresztül lépnek egymással kapcsolatba –Egy gépen több taszk is futhat
Lehetőségeink Saját gépünk, akár Linux, akár Windows alatt: elfajuló eset, de fejlesztéshez jó Egyetemi hálózat: nem javasolt –túl sok erőforrást kötne le Siva - 16 processzoros „igazi” párhuzamos számítógép: beteges Nyelvi labor: 40 (28) db Linux-os PC hálózatba szervezve: ezen teszteljünk, ezen kell bemutatni (pandorás jelszó…)
Nyelvi labor Programozási nyelvek labor (00-803) nyl01.nylab.inf.elte.hu nyl02.nylab.inf.elte.hu … nyl40.nylab.inf.elte.hu Hálózaton keresztül használható: master.nylab.inf.elte.hu
Siva PowerXplorer, a Parsytech cégtől 16 db Motorola 601-es PowerPC processzor, plussz 16 db T400-as transputer Minden node-on 8+1 mega RAM Az augusta géphez van kötve, onnan használható 4 dobozból áll, amik közül időnként néhány bekrepál (most 2 doboz megy) Érdemes kipróbálni...
Saját gép Viszonylag egyszerűen hazavihető és feltelepíthető Linux - triviális, Windows picit macerásabb Fejlesztéshez ez is jó Egy processzoron/gépen fut minden taszk Teszteléshez nem elég! –A tesztelés egy része itt is végezhető
Az első program „hello” alkalmazás Két taszk: hello és hello_other Két különálló C program, külön-külön lefordítva A főprogram a hello Elindítja a hello_other-t a PVM-en keresztül
hello.c #include #include "pvm3.h" int main() { int tid; int num; printf("i'm t%x\n", pvm_mytid()); pvm_spawn( "hello_other", (char**)0, 0, "", 1, &tid); pvm_recv(-1, -1); pvm_upkint(&num,1,1); printf("from t%x: %d\n", tid, num); pvm_exit(); return 0; }
hello_other.c #include "pvm3.h" int main() { int tid = pvm_mytid(); int ptid = pvm_parent(); pvm_initsend(PvmDataDefault); pvm_pkint(&tid,1,1); pvm_send(ptid, 1); pvm_exit(); return 0; }
Futtatás pvm pvm> spawn -> hello spawn -> hello [1] 1 successful t40002 pvm> [1:t40002] i'm t40002 [1:t40002] from t40003: [1:t40003] EOF [1:t40002] EOF [1] finished pvm>
Újabb host felvétele a virtuális gépbe pvm> add nyl14 add nyl14 1 successful HOST DTID nyl pvm> conf conf 2 hosts, 1 data format HOST DTID ARCH SPEED DSIG nyl LINUX x nyl LINUX x pvm> spawn -> hello
Újabb futtatás conf 2 hosts, 1 data format HOST DTID ARCH SPEED DSIG nyl LINUX x nyl LINUX x pvm> spawn -> hello spawn -> hello [1] 1 successful t80001 pvm> [1:t40002] EOF [1:t80001] i'm t80001 [1:t80001] from t40002: [1:t80001] EOF [1] finished pvm>
Egy példaprogram megszerzése Bárki hozzájuthat a hello példaprogramhoz a gyakorlat honlapjáról: Innen letölthető a forrás és a Makefile.aimk, aminek segítségével le lehet fordítani Van ott egy másik, ettől picit eltérő hello program is...
hello.c #include #include "pvm3.h" int main() { int cc, tid; char buf[100]; printf("i'm t%x\n", pvm_mytid()); cc = pvm_spawn( "hello_other", (char**)0, 0, "", 1, &tid); if (cc == 1) { cc = pvm_recv(-1, -1); pvm_bufinfo(cc, (int*)0, (int*)0, &tid); pvm_upkstr(buf); printf("from t%x: %s\n", tid, buf); } else printf("can't start hello_other\n"); pvm_exit(); exit(0); }
hello_other.c #include "pvm3.h" int main(){ int ptid; char buf[100]; pvm_mytid(); ptid = pvm_parent(); strcpy(buf, "hello, world from other"); pvm_initsend(PvmDataDefault); pvm_pkstr(buf); pvm_send(ptid, 1); pvm_exit(); exit(0); }
Makefile.aimk # Makefile for PVM targets […] VPATH = $(SDIR) # it could be modified.... BINS = hello hello_other FILES = *.c *.h Makefile.aimk NAME = hello default: $(BINS) % : %.c $(CC) $(CFLAGS) -o $< […] # user's targets hello: hello.c hello_other: hello_other.c
Ez egy jó kis Makefile.aimk # Makefile.aimk - PVM programok fordításához # # Használat: # Ezt a Makefile-t egy tetszőleges... #... BINS= hello hello_other
Mit, hol Programírás, fordítás master.nylab.inf.elte.hu Programok futtatása, tesztelése nyl??.nylab.inf.elte.hu
Fordítás Az aimk parancs a Makefile.aimk fájl alapján hívogatja a fordítót Az aimk parancsnak többféle argumentum adható aimk aimk links
A pvm első használata előtt … létre kell hozni egy könyvtárszerkezetet A felhasználó „home”-könyvtárában: pvm3 pvm3/bin pvm3/bin/LINUX Itt keresi a pvm rendszer a futtatható állományokat
Egyszer kell megcsinálni: master:~$ ssh nyl02.nylab.inf.elte.hu mkdir pvm3 mkdir pvm3/bin mkdir pvm3/bin/LINUX
Utána mindig ezt kell csinálni cd pvm3/src/hello ls Makefile.aimk hello.c hello_other.c aimk making in LINUX/ for LINUX cc -I/usr/lib/pvm3/include -Ddebug -o hello../hello.c - L/usr/lib/pvm3/lib/LINUX -lpvm3 cc -I/usr/lib/pvm3/include -Ddebug -o hello_other../hello_other.c - L/usr/lib/pvm3/lib/LINUX -lpvm3
Ezt projektenként egyszer kell ls LINUX Makefile.aimk hello.c hello_other.c ls LINUX hello hello_other aimk links making in LINUX/ for LINUX cd /h/teacher/kto/pvm3/bin/LINUX ln -s /h/teacher/kto/pvm3/src/hello/LINUX/hello hello ln -s /h/teacher/kto/pvm3/src/hello/LINUX/hello_other hello_other ls ~/pvm3/bin/LINUX/ hello hello_other
Mi mire való Az „aimk” parancs –lefordítja a forrásokat, –elkészíti a futtatható állományokat, és –lepakolja az aktuális könyvtár LINUX alkönyvtárában Az „aimk links” parancs szimbolikus linkeket definiál –a „BINS” alapján (Makefile.aimk) –a futtatható állományok eléréséhez –a ~/pvm3/bin/LINUX könyvtárból
aimk links Ha beállítom a Makefile.aimk-ban a BINS- t, akkor –utána fordítok „aimk”-val, és –ezután hívom az „aimk links” parancsot Ha nem nyúlok a BINS-hez, akkor ezek után csak az „aimk” parancs kell
Még egy megjegyzés Az „aimk links” parancs legelső meghívása során létrejön a szükséges könyvtárstruktúra is... pvm3 pvm3/bin pvm3/bin/LINUX
Futtatás Az nyl??.nylab.inf.elte.hu gépekről Be kell jelentkezni ssh-val valamelyikre Ott lehet elindítani a pvm konzolt, és azon belül a programot… Az azonosítás Kerberos segítségével történik –Kerberos ticket-et kapunk a bejelentkezéskor
Kerberos Amikor a master-re belépünk, kapunk egy Kerberos ticket-et Ez segít bennünket bejelentkezni jelszó megadása nélkül az nyl?? gépekre A pvm rendszernek is szüksége van a ticket- re ahhoz, hogy felépítse a virtuális gépet –bejelentkezik minden host-ra ssh-val, és elindítja ott a pvm démont
Ha lejár a ticket… Elveszti az érvényességét (3 óra elteltével) Utána nem lehet már bejelentkezni vele Meg lehet hosszabbítani a ticket-et Manapság ez a „ kinit –f ” paranccsal megy –ami jelszót kér (pandorás jelszót) –régebben ehhez a „ kauth –f ” kellett
Jó tudni A pandáról is elérhető az a home-könyvtár, ami a nyelvi labor gépeiről látszik. /mnt/cluster/teacher/kto Ha diák lennék: /mnt/cluster/k/kto
PVM indítása Legegyszerűbb, ha belépünk a PVM-konzol programba, és onnan futtatunk. Ez automatikusan elindítja a virtuális gépet is, azaz a PVM démont. Kilépés és a virtuális gép leállítása: halt pvm> halt halt Terminated
PVM démon A virtuális gép (démon) független a konzoltól, anélkül is elindítható Könnyű megfelejtkezni róla, és akkor csak eszi az erőforrásokat Még nagyobb a baj, ha bent ragad a programunk (pl. mert elszállt) –Különösen a Siván, mert ott a gépet tartjuk lekötve, más egyáltalán nem tud dolgozni rajta Legközelebb el sem indul a pvm démon, leáll hibával
Bentragadt PVM program Figyeljük, hogy minden taszkunk rendesen leállt-e Ha nem, lőjük ki a bent ragadtakat Ha a pvm démont nem tudjuk leállítani, lőjük ki azt is Töröljük le a /tmp/pvm. /sock fájlt ls /tmp/pvm.11700/ log sock id uid=11700(kto) gid=10713(aszt) groups=10713(aszt)
Bentragadt PVM program Figyeljük, hogy minden taszkunk rendesen leállt-e Ha nem, lőjük ki a bent ragadtakat Ha a pvm démont nem tudjuk leállítani, lőjük ki azt is Töröljük le a /tmp/pvm.11700/sock fájlt ls /tmp/pvm.11700/ log sock id uid=11700(kto) gid=10713(aszt) groups=10713(aszt)
Ideiglenes kilépés a konzolból A quit paranccsal: a démon, azaz a virtuális gép fut tovább pvm> quit quit Console: exit handler called pvmd still running.
Virtuális gép magában A démon is elindítható magában, konzol nélkül pvmd & [1] 627 /tmp/filejgp9rM
Ilyenkor leállítás Visszalépni/belépni a konzolba és onnan halt paranccsal ki. pvm pvmd already running. pvm> halt halt Terminated
Legfontosabb PVM függvények pvm_mytid()pvm_parent() pvm_spawn()pvm_exit() pvm_initsend()pvm_pkint()pvm_send() pvm_upkint() pvm_recv() pvm_nrecv() pvm_mcast()
Üzenetküldés initsend, pk*, send –pkint, pkdouble… Egy üzenetben sok adat is elküldhető –Több pk* hívás lehetséges –Egy pk hívással egy sorozat adatot lehet becsomagolni az üzenetbe (tömb, mátrix egy oszlopa) Tipikus hiba: egy üzenetet szétdarabolsz
Üzenet fejléce Minden üzenet tartalmaz az adatok mellett egy fejlécet is Üzenettípusok definiálása pvm_send( címzett, fejléc ); A fogadásnál kereshetsz az üzenetsorban a küldő és a fejléc alapján
Üzenetfogadás Üzenetsor (postaláda) Minden folyamatnak van egy üzenetsora pvm_recv( küldő, fejléc ); A -1 azt jelenti, hogy „bármi” pvm_recv( -1,-1 );
Az üzenetfogadás fajtái Blokkoló –pvm_recv –a fogadó folyamat blokkolódik az üzenet megérkezéséig Nem blokkoló –pvm_nrecv –non-blocking receive –ha van üzenet, beolvassuk, egyébként skip
Multicast Ha ugyanazt az üzenetet több folyamatnak is el szeretnénk küldeni pvm_mcast
Hasznos parancsok a PVM konzolban spawnprogram indítása addprocesszorok megfogása confmegfogott processzorok psfutó folyamatok haltleállítás quitideiglenes kilépés
add, conf (1) pvm pvm> conf conf 1 host, 1 data format HOST DTID ARCH SPEED DSIG nyl LINUX x pvm>
add, conf (2) pvm> add nyl02 add nyl02 1 successful HOST DTID nyl pvm> conf conf 2 hosts, 1 data format HOST DTID ARCH SPEED DSIG nyl LINUX x nyl LINUX x pvm>
add, conf (3) pvm> add nyl03 nyl04 nyl05 add nyl03 nyl04 nyl05 3 successful HOST DTID nyl03 c0000 nyl nyl pvm>
add, conf (4) pvm> add nyl12 add nyl12 0 successful HOST DTID nyl12 Can't start pvmd pvm> Nem felejtetted el a kauth-ot?
hosts Készíthetsz egy fájlt, amiben felsorolod azokat a gépeket, amelyeket meg akarsz fogni Ezt a fájlt a konzol indításakor kell átadni paraméterként Nem kell add-dal fogdosni össze a processzorokat
hosts példa cat hosts nyl01 nyl02 nyl03 pvm hosts pvm> conf conf 3 hosts, 1 data format HOST DTID ARCH SPEED DSIG nyl LINUX x nyl LINUX x nyl03 c0000 LINUX x
A beadandó programokról... Sok gépen futtatva kell bemutatni Sok gépen végzett tesztelést kell dokumentálni A tesztelésnek az algoritmus műveletigényéről kell szólnia –pl. “n adat n processzoron O(log n) időben” Példadokumentáció és példaprogramok a gyakorlat honlapján (nem ugyanaz, mint a beadandó feladat!) Zárthelyi!!!
Doksik man pvm_spawn (stb.)