Molekuláris interakciós ujjlenyomat Málnási-Csizmadia András, Bikádi Zsolt, Hazai Eszter, Jelinek Balázs, Hári Péter, Simon Zoltán, Zhenhui Yang, Zahoránszky Gergely

Gyógyszerfejlesztés Nagyrészt szemiempirikus A projekt áttekintése Gyógyszerfejlesztés Nagyrészt szemiempirikus Ismert/természetes hatóanyag továbbfejlesztése High Throughput Screening Pontos hatásmechanizmus nem ismert, és nem is kell az engedélyezéshez Mellékhatások Több fehérjepartner A gyógyszerjelölt molekula elvetését okozhatja Költséges (egy gyógyszer fejlesztése több 100 millió USD)

Komplex szolgáltatás A. Direct Similarity B. ZMOL Similarity A projekt áttekintése Komplex szolgáltatás A. Direct Similarity B. ZMOL Similarity C. Molecular Interaction Fingerprint Alkalmas gyógyszerjelölt molekulák többszintű szűrésére Szerkezetvizsgálat Mellékhatás-vizsgálat Straight et al, Science

Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Virtua Drug Kft. Résztvevők, partnerek Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán Virtua Drug Kft. Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter DELTA Elektronik Kft. Hári Péter, Akli Péter eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont Dr. Szathmáry Eörs

Cél Eszköz Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel A projekt áttekintése Cél Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel Eszköz Molekuláris dokkolás Dokkolási probléma: Két különálló molekula atomi koordinátáiból kiindulva hogyan adható meg kettejük komplexének szerkezete? Art Olson, TSRI

A projekt áttekintése

I. Adatgyűjtés, szelekció

II - III. Előkészítés és dokkolás

IV. Az eredmények értékelése MOLEKULÁRIS INTERAKCIÓS UJJLENYOMAT (MIF) Egyedileg jellemzi a kismolekulát Kölcsönhatási partnerek előrejelzése A fehérjekészlet diszkriminátor-felületként működik kcal/mol 8,5 2,5 -2,5 -4,5 Ligandumok Fehérjék Hasonló MIF Hasonló kölcsönhatási partnerek Hasonló hatások, Hasonló mellékhatások

V. A szolgáltatás beindítása

Összkép

Szolgáltatás indítása 2007. december Állapot, ütemterv Adatgyűjtés Gyógyszermolekulák és fehérjék 100% Mellékhatások 50% Előkészítés 100% Dokkolás 100% Értékelés 2007. március Szolgáltatás indítása 2007. december

Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Virtua Drug Kft. Résztvevők, partnerek Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán Virtua Drug Kft. Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter DELTA Elektronik Kft. Hári Péter, Akli Péter eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont Dr. Szathmáry Eörs