Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Kompetitív kizárás vagy együttélés?
Advertisements

A fuvarozási ágak díjazása
Sejtmag és osztódás.
Körfolyamatok (A 2. főtétel)
Összetett kísérleti tervek és kiértékelésük: Háromszempontos variancia analízis modellek.
A biológiai óra modellje. Enright modellje I. Az SCN sejtek szinkronizálására dolgozta ki, de általánosítható kellő számú megbízhatatlan elemből pontos.
Az enzimek A kémiai reakciók mindig a szabadenergia csökkenés irányába mennek végbe. Miért nem alakul át minden anyag a számára legalacsonyabb energiájú,
1. Földgázrendszer.
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Elektronikus Eszközök Tanszéke A termikus tesztelés Székely Vladimír.
Az alvás fenomenológiája
Transzformációk kucg.korea.ac.kr.
Közúti és Vasúti járművek tanszék. Célja:az adott járműpark üzemképes állapotának biztosítása. A karbantartás folyamatait gyakran az üzemeltetést is kiszolgáló.
Statisztika II. VI. Dr. Szalka Éva, Ph.D..
Ozsváth Károly TF Kommunikációs-Informatikai és Oktatástechnológiai Tanszék.
HETEROGÉN RENDSZEREK SZÉTVÁLASZTÁSA
Regresszióanalízis 10. gyakorlat.
SPSS többváltozós (lineáris) regresszió (4. fejezet)
SPSS többváltozós regresszió
MOZGATÓRENDSZER SZÖVETEI
KOCKÁZAT – HOZAM.
Dr. Szalka Éva, Ph.D.1 Statisztika II. VI.. Dr. Szalka Éva, Ph.D.2 Regresszióanalízis.
1 TARTALOM: 0. Kombinatorika elemei (segédeszközök) 1. Eseményalgebra 2. A valószínűség: a) axiómák és következményeik b) klasszikus (=kombinatorikus)
Citokinézis Csepregi Anna. Figure 18-2 Essential Cell Biology (© Garland Science 2010) Citokinézis helye a sejtciklusban.
FERMENTÁCIÓS GYAKORLAT
FERMENTÁCIÓS RENDSZEREK MATEMATIKAI MODELLEZÉSE
BIOREAKT-MSc Gombanövekedés kinetikája (Streptomyceták hasonlóan!) Szubmerz fonalas növekedés - mint baktériumok, Monod kinetika….. Felületi kétdimenziós.
FOLYTONOS FERMENTÁCIÓ
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban folytatás...
Egyéb fermentációs technikák
FOLYTONOS FERMENTÁCIÓ
Mikrobapopulációk és –sejtek növekedése
Készítette: Gergó Márton Konzulens: Engedy István 2009/2010 tavasz.
Idősor elemzés Idősor : időben ekvidisztáns elemekből álló sorozat
1 Mössbauer-spektrumok illesztése: vonalalak A kibocsátott  -sugárzás energiaspektruma Lorentz-görbe alakú: I : sugárzás intenzitása  : frekvencia 
Versengő társulások Mi történik egy olyan térbeli modellben, ahol sok stratégia létezik? Lokálisan csak a stratégiák kis hányada lehet jelen. => az evolúciós.
Következtető statisztika 9.
Alapsokaság (populáció)
Lineáris regresszió.
Folytonos eloszlások.
Az eukarióta sejtciklus szabályozása
Hídtartókra ható szélerők meghatározása numerikus szimulációval Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Áramlástan Tanszék február.
A HIV-fertőzés alapmodellje Vírusdinamika = a szervezeten belüli folyamatok modellezése.
A szervezet energiaforgalma
Petrovics Petra Doktorandusz
Erőtörvények Tóth Klaudia 9/b..
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) Intervallumbecslések 2014/
Egyenes vonalú mozgások
Miskolci Egyetem Gazdaságtudományi Kar Üzleti Információgazdálkodási és Módszertani Intézet Regresszió-számítás március 30. Dr. Varga Beatrix egyetemi.
T-SEJT DIFFERENCIÁCIÓ A THYMUSBAN. A thymus szöveti felépítése.
Valószínűségszámítás II.
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
Földstatikai feladatok megoldási módszerei
Bevezetés a méréskiértékelésbe (BMETE80ME19) 2014/
Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N 0 ·e  ·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota.
Előrejelzés Összeállította: Sójáné Dux Ágnes. Előrejelzés Az időbeli folyamatok elemzésének segítségével lehetőség nyílik a korábban láthatatlan trendek.
Mini-flap projekt Borda-Carnot átmenet 2  BC-átmenet: áramlás irányába bekövetkező hirtelen keresztmetszet- ugrás, cél a közeg lassítása,
Gazdaságstatisztika Gazdaságstatisztika Korreláció- és regressziószámítás II.
Pedagógiai hozzáadott érték „Őrült beszéd, de van benne rendszer” Nahalka István
Növekedés és termékképződés idealizált reaktorokban
Korreláció, regresszió
Lineáris regressziós modellek
Mikrobák mennyiségi meghatározása
Kísérletek „mezoszkópikus” rendszerekkel!
Valószínűségi változó, eloszlásfüggvény
A szervezet energiaforgalma
FOLYTONOS FERMENTÁCIÓ
Velünk élő középkor Forrás:
2. Regresszióanalízis Korreláció analízis: milyen irányú, milyen erős összefüggés van két változó között. Regresszióanalízis: kvantitatív kapcsolat meghatározása.
Dr. Varga Beatrix egyetemi docens
Előadás másolata:

Mikrobasejtek ciklus alatti növekedése A tenyészet sejtszáma az idő függvényében N(t) = N0·e m·t (ha a külső környezet és a sejtek fiziológiai állapota változatlan és a populáció aszinkron) A tenyészet sejttömege az idő függvényében M(t) = M0·e m·t (a sejtek koreloszlása és ciklus alatti tömegnövekedése ezt nem befolyásolja) Az egyedi sejt tömege az idő függvényében m(t) = m0·e m·t ??? m0 a születéskori sejttömeg 0 < t < CT, ahol CT a sejt ciklusideje m(CT) = 2m0 (tetszőleges monoton függvény elképzelhető) exponenciális-e a növekedés a sejtek életében ???

Sejtnövekedési modellek Exponenciális modell: a sejt növekedési sebessége folyamatosan nő → riboszómák száma (Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae ???) Lineáris (multilineáris) modell: a sejt növekedési sebessége állandó → bizonyos esemény(ek)nél ugrásszerű változások (Schizosaccharomyces pombe) ha a növekedés lineáris, és a ciklus belsejében nincs sebességváltás ↓ a sejt osztódásakor a növekedési sebességnek ugrásszerűen meg kell duplázódnia ↕ exponenciális növekedés esetében a sejt osztódásakor sincs hirtelen változás CK

sejtnövekedés modellje A hasadó élesztőgomba, mint a sejtnövekedés modellje Mitózisos (ivartalan) sejtciklus Mitchison, 1957 csak hosszirányú sejtnövekedés → tömeg, térfogat és hossz ~ arányos a ciklus végén a hossznövekedés megszűnik Mitchison & Nurse, 1985 Sveiczer, Novák & Mitchison, 1996 a növekedés mintázata (bi)lineáris a ciklus közepe táján van egy sebességváltási pont (RCP)

A hasadó élesztőgomba mitózisos sejtciklusa G2 / M checkpoint metaphase / anaphase checkpoint G1 / S checkpoint M G1 S G2 Cell division cryptic size control operating size control

A hengerek nem feltétlenül egyformán nőnek…

A Schizosaccharomyces pombe növekedése 1. G2 M G1 S CK RCP2 Sejthossz, L (mm) RCP3 RCP1 Idő (min) NETO új régi vég

A mikrofotográfia módszere mért változó: a sejthossz (L) a születéstől (BL) az osztódásig (DL) az idő függvényében (0 < t < CT) DL 5 min BL CT

A Schizosaccharomyces pombe növekedése 2.

A mérési pontokra illesztett modellek Lineáris L(t) = g·t + d Exponenciális L(t) = k·e l·t Bilineáris L(t) = h·ln{exp[a1·(t-t)/h] + exp[a2·(t-t)/h]} + e ahol t az RCP pozíciója, h pedig az átmenet élessége A legadekvátabb modell kiválasztási kritériumai Korrelációs koefficiens Reziduális standard deviáció s = (SSE/df)1/2 [df = nobs − npar] Akaike információs kritérium AIC = nobs·ln(SSE) + 2npar Schwarz Bayes információs kritérium SBIC = nobs·ln(SSE) + npar·ln(nobs)

Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (éles bilineáris eset) α1 = 0.0429 μm min-1 α2 = 0.0902 μm min-1 ε = 9.84 μm τ = 57.6 min η = 0.01 μm RCP

Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (sima bilineáris eset) α1 = 0.0413 μm min-1 α2 = 0.0782 μm min-1 ε = 10.2 μm τ = 59.7 min η = 0.500 μm RCP

Egy hasadó élesztő sejt növekedési mintázata (lineáris eset) γ = 0.0494 μm min-1 δ = 7.86 μm

A hasadó élesztő sejtnövekedése általában bilineáris, de gyakran nem éles

Hasadó élesztő sejtek „átlagos” növekedési mintázata (sima bilineáris) 1. α1 = 0.0478 μm min-1 α2 = 0.0628 μm min-1 ε = 10.8 μm τ = 64.3 min η = 0.087 μm RCP

Hasadó élesztő sejtek „átlagos” növekedési mintázata (sima bilineáris) 2. RCP

A hasadó élesztőgomba méretkontroll mechanizmusai 1. G2 / M checkpoint metaphase / anaphase checkpoint G1 / S checkpoint M G1 S G2 Cell division cryptic size control operating size control

A méret homeosztázisának biztosítása Modellek: sizer timer adder

A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 1. WT cdc2ts

A méretkontroll igazolása hasadó élesztőben 2. CT = −22.72 ∙ BL + 368.8 p = 0.000 CT = −2.213 ∙ BL + 135.5 p = 0.002 A

A méretkontroll pozícionálása hasadó élesztőben 1. A méretkontroll a G2 fázis közepén hat → G2 = „sizer + timer”

A méretkontroll pozícionálása hasadó élesztőben 2.

A hasadó élesztőgomba méretkontroll mechanizmusai 2.