Biokémia Wunderlich Lívius PhD. BME 2016
Alapkövetelmények - Középiskolai kémia: Általános és szerves kémia fontos Szervetlen kémia kevésbé fontos (csak a biológiailag releváns elemek, vegyületek) Kémiai technológia nem kell - Középiskolai biológia: Sejttan, szervtan, élettan, biokémia fontos Rendszertan, genetika kevésbé fontos Szupra-individuális szintek, etológia nem kell
Tematika -Gyorstalpaló kémia -Gyorstalpaló sejtbiológia -Leíró biokémia -Enzimológia -Bioenergetika -Szénhidrát anyagcsere -Lipid anyagcsere -Fehérje anyagcsere -Nukleinsav anyagcsere -Replikáció, transzkripció, transzláció -Táplálkozás, biotranszformáció és ami még belefér…
Vizsgakövetelmény: Az előadáson elhangzott tananyag ??? Aláírás követelmény: , db rövid írásbeli ZH A két legjobb számít Összesített átlag legyen legalább 50% Nincs javítási lehetőség!!!
Ajánlott olvasmányok: Ádám et al.: Orvosi biokémia Csermely et al.: Bioorganikus kémia Mandl József: Biokémia Gergely et al.: Általános és bioszervetlen kémia …vagy bármely biokémia könyv viszonylag új verziója Wunderlich, Szarka: A biokémia alapjai biokemia.bme.hu
Kémia gyorstalpaló
Az atom szerkezete
Avogadro-szám: 6,022x10 23 = 1 mol anyag Töltés, tömeg
Az atomok szerkezete 2 e - atompályánként
Elemek: Azonos protonszámú atomok anyaghalmaza Vegyületek: Különböző protonszámú atomok anyaghalmaza Izotópok: Azonos protonszámú, de különböző neutronszámú atomok
Biogén elemek elktronhéjai
Az urán elektronhéjai
Atompályák
Különböző atompályák alakjai Alhéjak: milyen alakú atompályák vannak benne
Az alhéjak energiája
Elektronhéjak Elemek tulajdonságai: Milyen a legkülső elektronhéj/alhéj elektronszerkezete
Elektron-vonzó képesség és tömeg
Az elemek előfordulási valószínűsége
Atomos állapotban: Csak a nemesgázok Elemi állapotban is csak kevés elem, többi vegyületben A biológiailag fontos elemek ???
1. Ionos kötés: ΔEN > 2 Elsőrendű kötések
2. Fémes kötés
3. Kovalens kötés Elsőrendű kötések
3. Kovalens kötés Kötő és lazító molekulapályák
Elsőrendű kötések 3. Kovalens kötés
σ és π kötések σ kötés π kötés Kettős kovalens kötés az eténben Telítetlen vegyületek: Jóval reakcióképesebbek!
Datív (koordinatív) kötés
Hidrogén-kötés HF H2OH2O NH 3
Dipólus kölcsönhatás
Van der Waals / London féle erők
???
Szerves vegyületek Szénvázas vegyületek, többnyire H-t is tartalmaznak Elmosódó határvonal: Rendűség: Hány kötéssel kapcsolódik más atomhoz, mint a hidrogén Hidrofil illetve hidrofób molekulák/csoportok: Mennyire képesek a vízzel dipólus kölcsönhatásba lépni
Alkánok
Cikloalkánok
Aromás vegyületek Benzol
Heterociklusos aromás vegyületek Piridin Imidazol PirimidinPurin
Szénlánc eredetű csoportok
Szerves molekulák legfontosabb funkciós csoportjai: Acil ÉszterAcetálÉter ???
Izoméria 1. Kapcsolódási izoméria C2H6OC2H6O C3H6OC3H6O
1,2-pentadién 1,3-pentadién1,4-pentadién kumuláltkonjugáltizolált Izoméria 2. Helyzeti izoméria
Izoméria
3. Tautoméria
Geometriai izoméria
Sztereoizoméria Kiralitási centrum: 4 ligand C (N, P, S)
Sztereoizoméria Több kiralitási centrum esetén:
Epimerek Sztereoizoméria
Konformáció
???
Kémiai reakciók - Az atomok/ionok/molekulák reagálni képesek egymással. - A funkciós csoportok jelenléte nagymértékben befolyásolja az adott molekula hajlandóságát egy adott típusú kémiai reakcióra. x·A + y·B n·C + m·D [C] n ·[D] m [A] x ·[B] y K =
szubsztitúció addíció (elimináció) izomerizáció A reakciók típusai Mechanizmusok: - Elektrofil - Nukleofil - Gyökös
Sav-bázis reakciók: protonátmenet Redox reakciók: elektronátmenet Exergonikus reakciók: Maguktól végbemennek (ΔG: -) Endergonkus reakciók: Maguktól nem mennek végbe (ΔG: +)
Sav-bázis elméletek
Savak reakciója vízzel
Bázisok reakciója vízzel
Konjugált sav-bázis párok relatív erőssége
A víz autoprotolízise
Protonkoncentráció és pH
Egyensúlyi „állandó”
A víz disszociációja,a pH fogalma Tömeghatás törvénye
Teljes disszociáció
Gyenge savak pH-ja
Titrációs görbe: Erős savat erős bázissal
Többértékű gyenge sav titrálása
Pufferek: Gyenge sav + erős bázissal képzett sója, vagy Gyenge bázis + erős savval képzett sója
Pufferek pH-jának kiszámolása
A homeosztázist biztosító puffer-rendszerek
A Hisztidin puffer rendszer
A H 2 CO 3 /HCO 3 - puffer rendszer
Redox reakciók ??? Elektronátmenttel, vagy oxidációs szám változással járó reakciók