Préda-ragadozó interakciók modellezésének lehetőségei R-ben.

Az előadások a következő témára: "Préda-ragadozó interakciók modellezésének lehetőségei R-ben."— Előadás másolata:

1 Préda-ragadozó interakciók modellezésének lehetőségei R-ben

2 Hogyan használjuk az R-t? Mint más emberek: - adatelemzés - statisztika - grafika Modellezés R-ben: – alkalmazott modellek – „magyarázó” modellek – demostráló modellek és modellezés

3 Ökológiai modellek Egy ökológiai rendszer vagy alrendszer matematikai modellje Folyamat (process) modellek: - rendszer megismerés, hipotézis tesztelés (préda-predátor modell, sejtautomaták) Szintézis (synthetic) modellek: ismeretek összefoglalása, döntéshozás (vízminőség, globális folyamatok)

4 A feladat(ok)…. 0. csomagok letöltése(simecol, odesolve), telepítése, ellenőrzése 1. A scriptek letöltése, értelmezése 1. Néhány példa kiszámítása 3. jegyzőkönyv elkészítése 4. jegyzőkönyvek elküldése (*.doc vagy *.odt- ben) az elek.zoltan@aotk.szie.hu címreelek.zoltan@aotk.szie.hu 5. elindulni lassan hazafelé…

5 1. Feladat: egy tipikus sztochasztikus Lotka Volterra-rendszer modellezése Egyenlő esélyek alacsony egyedszám(20,20), magas egyedszám(200, 200) Nem egyenlő esélyek (midnkét fajra) alacsony egyedszám(10-100), magas egyedszám(100-10) Ki a ragadozó, ki a préda?

6 2.feladat: Lotka Volterra-rendszer három paraméterrel, forrás, préda, ragadozó #########predator prey-model with three equations: predator, prey and resource (e.g. nutriens, grassland) library(odesolve) library(simecol) data(lv3) plot(sim(lv3)) solver(lv3) <- "lsoda" parms(lv3)<- list (b=0.1, c=0.5, d=0.1, e=0.4, f= 0.4, g=0.1) init(lv3)<- list (s=0.8, p=0.2, k=0.0) times(lv3)<- c(from=0, to=100, by=0.1), print(sim(lv3)) plot(sim(lv3)) # wrong! integration overlooks internal inputs plot(sim(lv3, hmax=1)) # integration with correct maximum time step

7 2. feladat Egyenlő esélyek egyedszám(20,20) Nem egyenlő esélyek (midnkét fajra) egyedszám(10-100), Resource: 1, 100

8 http://www.univet.hu/users/zelek/predacio/ http://simecol.r-forge.r-project.org/ T.J.Case (2000): An Illustrated Guide to Theoretical Ecology. Oxford University Press, New York.