Genomika klinikai alkalmazásai 2.

Az előadások a következő témára: "Genomika klinikai alkalmazásai 2."— Előadás másolata:

1 Genomika klinikai alkalmazásai 2.
TUMOR CARDIOVASC/OBESITÁS ASTHMA NEUROPSYCHIATRIA Falus András

2 Asztma (Asthma bronchiale)
Asztma: krónikus légúti betegség. Jellemző a kis légutak epizódokban jelentkező gyulladása és szűkülete különböző triggerelő tényezőkre. Az asztma rohamok lehetnek enyhék és életveszélyesen súlyosak. Tünetei:légszomj, köhögés, zihálás, mellkasi fájdalom, és feszülés, valamint ezek kombinációi. A kiváltó okok lehetnek: allergének, fertőzés, fizikai munka, hirtelen éghajlatváltozás, légszennyezések, mint pl. cigarettafüst. Két fázis: korai tünetek: perccel, késői: 4-6 órával a provokáció (pl. antigén belélegzés) után. USA: 11 milliárd $/év

3 Elhunyt asztmás tinédzser tüdőszövettani vizsgálata
Elhunyt asztmás tinédzser tüdőszövettani vizsgálata. Fő jellemzők: I = gyulladás (gyulladási sejtek beáramlása), MP = mucus plugging: légutakat a nyák eldugaszolja, Légúti remodelling: SF= subepitéliális fibrózis: kollagén lerakódás, MH= miociták hipertrófiája és hiperpláziája: a simaizmok térfogatának és számának növekedése, N= neovasculáció: új erek képződése; ezek irreverzibilis változások

4 Az allergiás/atópiás betegségek előfordulása
> 160 millió asztmás van a világon, a leggyakoribb krónikus betegség gyermekkorban. Leggyakoribb allergiás betegségek: Nagy-Britannia: 30,6% (asztma: 13,1%-19,6%) Magyarországon az asztma előfordulása: 4,9% serdülő kor előtt, felnőtteknél hasonló nagyságrend Alacsony pl.: Indonézia: 1,6%

5 Az öröklődés vizsgálata Eredmények
Egypetéjű ikreknél az asztma konkordanciája: 26-75% Egyik szülő sem atópiás: 11-13%-a; mindkét szülő: 50-70% gyermekeknek igen Magyarország: Az asztmások gyerekeinek 26,7% atópiás (leggyakrabban asztmás) Asztma λs=2,0, bár egyes populációkban magasabb: >7 Imprinting jelenség: Az atópiára való hajlam kockázata azokban a gyermekekben sokszor nagyobb, akiknek az anyja atópiás.

6 Allergia kialakulása ALLERGÉN hizósejt MEDIÁTOROk IgE
antigén bemutató sejt (pl. dendritikus sejt) IgE keresztkötés MEDIÁTOROk (pl. hisztamin) B lymphocyta IgE FELSZABADULASA IL-4 IL-13 T helper (Th2) lymphocyta értágulat vascularis permeabilitás ELÖZMÉNY simaizom konstrikció gyomorsav AZONNALI ALLERGIAS JELENSÉGEK

7 Th0 sejt Th1 Th2

8 Példa az asztma gyakoriságának emelkedésére
A XX. század elején Budapesten évente egy-két új asztmás gyereket diagnosztizáltak, 2002-ben t.

9 Miért emelkednek az allergiás betegségek prevalencái?
Legelfogadottabb a tisztasághipotézis (Th1 trigger hipotézis) : a nyugati típusú társadalmakban nem engedjük, hogy a Th1 felé eltolódott immunválasz kialakuljon. Th1 érés (maturation) hipotézis: A Th1 érés defektussal született gyerekek régebben meghaltak, manapság a jobb egészségügyi ellátás miatt életben maradnak, de allergiások, asztmásak lesznek.

10 Miért emelkednek az allergiás betegségek prevalencái? (II)
Antibiotikumok használata A levegőben levő szennyeződések reagálnak az allergénekkel és agresszívabbá teszik őket. D vitamin adása kisgyerekeknek

11 EGÉR Asthma modell Provokáció Szenzitizálás I Szenzitizálás II
29 I.p. OVA (hasba) I.p. OVA OVA inhaláció + Al(OH) Al(OH) % 5 % Tüdő-szövettani vizsgálat BAL (bronchoalveoláris lavage ) sejtösszetétel vizsgálata BAL FACS analízis Szérum IgE mérés Génexpressziós vizsgálatok Légúti túlérzékenység mérése

12 Kemokinek

13 Kemokinek szerepe Eotaxinok Receptoruk: CCR3; Vonzzák: eosinofil, Th2
Eosinofilek degranulációja Eotaxin -/-: OVA szenzitizálás és provokáció után: hasonló AHR és eozinofilia mint a WT-ban: más kemokinek átveszik szerepét. MCP-1 (Monocyte Chemotactic Protein-1) Receptora: CCR2; Vonzza: monocita, (aktivált eozinofil), Bazofil degranuláció, Th2 polarizáció RANTES Receptor: CCR1,3,5; Vonzza: eozinofil Bazofil degranuláció, IgE termelés fokozása MIP-1a, MCP-3,4, MDC, IP-10 stb.

14 CC kemokin receptor 3: CCR3 és az asztma
CCR3: eozinofilek, hízósejtek, bazofilek, Th2 sejtek felszínén kemokin receptor: eotaxinok, RANTES, MCP-2,3,4, MIP-1a receptora Fontos szerep az eozinofilek kemotaxisában és a Th2 sejtek toborzásában OVA kezelt CCR3 KO: csökkent légúti eozinofília, de AHR volt

15 Eozinofilszám a tüdőben vad (üres hasáb) és CCR3 KO egér tüdejében és BAL-jában placebo (sham) és OVA kezelés után CCR3 KO

16 Transzkripciós faktorok szerepe T-bet:Th1; GATA-3: Th2 irányú differenciálódás kulcs faktorai

17 Humán eredmény: Asztmások tüdejében alacsonyabb a T-bet expresszió, mint nem-asztmásokban.
Előállítottak T-bet hiányos egereket. Az egereken spontán, a humán krónikus asztmához hasonló állapot alakult ki. AHR metakolinra, eozinofilek és limfociták perivaszkuláris és peribronchiális infiltrációja, kollagén lerakódás a légutak körül, simaizomsejtek hiperpláziája (remodelling)

18 Human asthma disease pathway

19 QTL QT: quantitative trait: valamilyen számmal definiálható jellemző. Pl.: LDL-C, vérnyomás, IgE szint, Discontinuous (dichotomous) jellemzők (pl.: ajakhasadék) is lehetnek QT-k: betegség megléte/hiánya. QT-kat is lehet dichotomizálni: pl. 130 feletti szisztolés vérnyomás a kóros. QTL: quantitative trait locus: olyan locus amelyik az adott jellemzővel együtt szegregál.

20 LOD = logarithm of odds, annak az esélynek a 10-es alapú logaritmusa, hogy két lókusz genetikailag kapcsolt, összehasonlítva annak az esélyével, hogy nem kapcsolt. Pl. LOD = 3 azt jelenti, hogy 1000x-es (103x) a valószínűsége annak, hogy két lókusz együtt öröklődik, mint annak, hogy nem (0 hipotézis). (A LOD score =3 felel meg a p=0,05-ös valószínűségnek.)

21 3 LOD csúcsot detektáltak összesen: 1: D2Mit359–D2Mit416 neve: Abhr1, LOD: 4,2; humán homológok: 10p11-13, 2q12-q14,9q22-q34: GATA-3, IL-1R antagonista 2: D2Mit238–D2Mit298 neve: Abhr2 LOD: 3.7, humán homológok: 9q33-q34, 2q14-q24: prostaglandin synthase 1 3: D7Mit21–D7Mit56 , LOD: 1,9, humán homológ: 19q13: IL-11

22 Jelölt gének -GATA-3, IL-1R antagonista -ProstaglandinE2: asztmások tüdejében emelkedett a szintje, simaizom proliferációt (remodelling) és eozinofilek túlélését fokozza. PGD2: hízósejt termeli, lipid mediátor, macrophage-derived chemokine (MDC)-t indukálja, ami kemoattraktánsa a Th2 sejteknek. -IL-11: B sejtek Ig termelését stimulálja, túlexpressziója megnövekedett légúti ellenállást okoz

23 Humán vizsgálatok Teljes genomszűrés
Eddig: 16 szűrés 12 populáción 20 régióval találtak kapcsolatot

24 Asztma genomszűrések eredményei

25 Példa genomszűrésre MARIE-HÉLÈNE DIZIER, et al
Példa genomszűrésre MARIE-HÉLÈNE DIZIER, et al. Genome Screen for Asthma and Related Phenotypes in the French EGEA Study Am J Respir Crit Care Med Vol 162. pp 1812–1818, 2000 Epidemiological Study on the Genetics and Environment of Asthma, Bronchial Hyperresponsiveness, and Atopy (EGEA): francia genomszűrés 107 „nukleáris” családot vizsgáltak, ahol legalább 2 testvérnek volt asztmája (493 résztvevő): sib pair analízis 254 mikroszatellita marker, 13 cM felbontás 2 lépcsős stratégia: 46 család először, 70% markerrel 61 család másodszor IBD (identical by descent) teszt lehetséges volt QT: bőrallergia teszt (skin prick teszt), IgE, eozinofilszám, bronchial responsiveness

26 Jelölt gének Asszociációs vizsgálatok

27

28 5q31-q33 IL-4, IL-13:  Az IL-4 gén közelében elhelyezkedő mikroszatellita marker és a nem-specifikus (össz) IgE szint között szoros összefüggést találtak. Egyes tanulmányokban az IL-4-589*T homozigótaságot asztmával, rhinitissel és atópiával hozták összefüggésbe. Újabb eredmények alapján az IL-13 promoter régiójában a –1111 pozícióban található polimorfizmus szignifikáns kapcsoltságot mutatott asztmával, légúti hiperreaktivitással és pozitív bőrpróbával. IL-13 Arg110Gln: erősebben kötődik receptorához, emelkedett IL-13 és IgE szint, asztma.

29 IL-13 Arg110Gln polimorfizmus szignifikánsan gyakrabban (P=0,007) fordul elő asztmában (Th2-es betegség), mint juvenilis arthritisben (JIA, Th1-es betegség)

30 CD14:. Szerepet játszik a T1/Th2 egyensúly kialakulásában
CD14:. Szerepet játszik a T1/Th2 egyensúly kialakulásában. Bakteriális LPS kötő receptor C/T polimorfizmus: A CC homozigóta: Csökkent sCD14 szint (s= solubilis), csökkent CD14 sűrűség monocitákon, Emelkedett IgE szint, több pozitív bőrpróba (vs TT). Magyarázat: CD14 kötés IL-12 termelést vált ki, segít az élet korai szakaszában a Th1 válasz kialakulásában.Alacsonyabb CD14-gyel Th2 válasz felé billenhet az egyensúly. A CD14-LPS kapcsolat magyarázhatja a gyermekkori fertőzés és az atópia közötti inverz kapcsolatot. LPS szerkezete

31 6p21.3 Az MHC tartomány: MHC II (HLA-D) allergénpeptidek prezentációja a “jobb” vagy “rosszabb” bemutatás más citokineket termelő Th sejtek aktivációját, tehát erősebb vagy gyengébb allergiás immunválaszt eredményez. Parlagfű Amb5 allergénjére reagáló fehérek 97,5%-a: DR2.2; nem reagáló: 22% DR2.2; Amb6, Der1 (poratka allergénje) és a Der2-vel kapcsolatban is találtak hasonlókat. TNFa: Gyulladási választ közvetítése  Asztma TNFa -308 G/A promóter polimorfizmus: az A allél magasabb expressziót és TNFa szinttel jár.

32

33 16p21 IL-4R: IL-4-nek (és az a alegység az IL-13-nak is) receptora  Atópia, asztma Ile50Val (I75V, ha a szignálpeptidet beleszámolják) az extracelluláris doménben helyezkedik el, valin esetén a receptor erősebben köti az IL-4-t. A Glu576Arg polimorfizmus a jelátviteli intermedierekhez való kötődést változtatja meg. Mindkét esetben a receptor felerősödött jelátvitelét tapasztalták. A vizsgálatok alapján úgy tűnik, hogy az 576-os arginin atópiára hajlamosító hatása domináns, míg az 50-es valin autoszomális recesszív öröklődést mutat. Az egyik vizsgálatban a Glu576Arg polimorfizmus nemcsak asztmára hajlamosított, de a polimorfizmust mutató asztmásokban a betegség tünetei súlyosabbak voltak, így ennek a génváltozatnak betegség-módosító hatása is feltételezhető.

34 17q11.2 RANTES, MCP-1, eotaxin: Leukociták gyulladáshoz vonzása (kemokinek)  Asztma Rantes -403 C/G AEDS, asztma, -28 G/A súlyos asztma (Japán és kínai populációk) MCP A/G: magasabb MCP-1 expresszió a G alléllel.

35 MCP-1 -2518 A/G vizsgálata asztmában és allergiában
MCP A/G vizsgálata asztmában és allergiában. A allél szignifikánsan gyakrabban fordult elő asztmásokban, mint nem-asztmásokban (34,4% vs 21.1%) Szalai C, Kozma GT, Nagy A, Bojszkó Á, Krikovszky D, Szabó T, Falus A. Polymorphism in the gene regulatory region of MCP-1 is associated with asthma susceptibility and severity. J Allergy Clin Immunol 2001 Sep;108(3):

36 “Asztma-gének” azonosítása pozícionális klónozással
A leszűkített, asszociáló területen gének keresése adatbankokban Gének expressziójának vizsgálata egér tüdőben (pl. asztmás vs egészséges) Kiválasztott gén(ek) funkcionális vizsgálata

37 FcεRIβ (MS4A2): CRTH2 (PTGDR): G1651A (3’UTR) (kínai pop.) GSTP1: Val105Ile (é-európai pop.) CC16 (secretoglobin): A38G (ausztrál pop.)

38 Chr11q13:59,500, ,500,000 kb SNP kb SNP MS4A2 (FcεRIβ) GPR44 (CRTH2)

39 Chr11q13: 61,850,000-62,050,000 kb.320 SNP kb SNP =cc16

40 pyknonok 127,998 egyedi szekvencia motívum min. 16 nt. hossz.
min. 40-szer fordul elő, min. 1-szer CR-ban (exon, UTR) mozaikos elhelyezkedés 1% csak repeat-ekben fordul elő, a többi bárhol egymástól mért táv.: nt. preferált (18-22 nt) miRNS? piknonok rev. komplementereinek NCR előfordulásaiban: RNS másodlagos-szerkezet predikció: intergenikus ter.-en intronban átíródik, sense- antisense viszonyban piknonnal Rigotsus et al. PNAS, April.25, 2006 60-80 nt. hair-pin struktúra

41 FractoSet-ek hierarchikus felépülése szekvencia-eltérésekkel és fraktál-szekvencián belüli és közötti pyknon-szekvenciákkal A pyknonok is meghatározott sorrendben, nagyobb egységekben rendeződnek?

42 61,850,000-62,050,000 régió fraktál-szerkezete (FractoGem)
Asztma 11q13: 61,850,000-62,050,000 régió fraktál-szerkezete (FractoGem) 22 db, fraktál-mintázatot kialakító FractoSet

43 Gén - környezet kölcsönhatás példái
PKU és phenylalanine fogyasztás Sarló sejtes anaemia gén - malária CCR5 receptor variáns HIV fertőzés és West Nile virus CYP2D6 gén mutáció – gyógyszer metabolizmus Common variants, called polymorphisms, occur at greater than 1% frequency I have given some examples of how exposure induced risk is modified in various ways Typically the effects are modest in magnitude. We are interested in how genetics modifies Exposure and exposure-related diseases Because…..

44 A környzeti expositiok hatását befolyásoló genetikai tényezők
Resistens Genotípus Rizikó szint (alacsony) Nincs Expositio Sensitive Genotípus We use this simple model to describe the process. There are sensitive and resistant genotypes in the population. Example: Could be metabolism, could be DNA repair, could be receptor that mediates viral infection. 1) Under conditions of no exposure genotype has no impact on risk 2) Under exposure conditions (could be viral, parasites) then you observe some difference in risk for genotypes. 3) At low exposure you only observe effects in susceptible population. There is data that supports this model. Resistens Genotípus 2X Rizikó Expositio Sensitive Genotípus 4X Rizikó

45 Genetikai betegségeket vizsgálunk …
Örökletesség: a betegség genetikai faktorok által meghatározott része Huntington Schizophrenia Gének Környezet Rheumatoid Arthritis Epilepsia 0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80% 90% 100 %

46 Ha önmagában vizsgáljuk: az egyes rizikófaktorok hatása egyenként mérsékelt
ApoE4: Alzheimer Factor Vleiden: DVT HLA: autoimmunity InsulinVNTR: T1DM HFE: Hemachromatosis CCR5: HIV infection CTLA4: Graves disease PPARg: T2DM NOD2 and 5q31: IBD ApoA5: triglycerides

47 Génexpressziós adatok és a génhálózatok „reverz” modellezése microarray adatokból
gén A gén B gén C gén D Expresszió Sejtek Génhálózatok? Génhálózat modell A B E C D microarray

48 A polymorph variánsok jelentősége
Egyes nagy penetranciájú allélikus variánsok közvetlen okai a betegségnek Huntington kór, cystás fibrosis, Duchenne typusú izomdystrophia Ugyanazon SNP diverz phenotypusban nyilvánulhat meg mtDNS mutatiok Ugyanazon betegség hátterében különböző gének alterációi állhatnak Leigh syndroma Legtöbb kórkép multigénes - egy adott gén csak korlátozott ‘penetranciával’ befolyásolja a betegség tüneteit A legtöbb betegség multifaktoriális, ahol a környezet is fontos szerepet játszik ALS Schizophrenia Autismus

49 Huntington kór poliglutamin betegség CAG repeat-ek

50 APOE genotypus és Alzheimer Kór: az egyes nucleotid cserék aminosav cserét okoznak:
– APOE2 ( C—158—R); APOE4 (C –112– R) Ezek az egyes nucleotid változások signifikánsan befolyásolják a betegség rizikóját: APOE4 negative betegnek 9% a rizikója az AD-ra APOE4 positive betegnek 29% rizikója (RR 4 - 5) Két APOE4 allele még nagyobb rizikót eredményez (50% 80 évesen), RR: 10 APOE2 positive beteg RR: 0.5

51 A polymorph variánsok jelentősége
Egyes nagy penetranciájú allélikus variánsok közvetlen okai a betegségnek Huntington kór, cystás fibrosis, Duchenne typusú izomdystrophia Ugyanazon SNP diverz phenotypusban nyilvánulhat meg mtDNS mutatiok Ugyanazon betegség hátterében különböző gének alterációi állhatnak Leigh syndroma Legtöbb kórkép multigénes - egy adott gén csak korlátozott ‘penetranciával’ befolyásolja a betegség tüneteit A legtöbb betegség multifaktoriális, ahol a környezet is fontos szerepet játszik ALS Schizophrenia Autismus

52 A polymorph variánsok jelentősége
Egyes nagy penetranciájú allélikus variánsok közvetlen okai a betegségnek Huntington kór, cystás fibrosis, Duchenne typusú izomdystrophia Ugyanazon SNP diverz phenotypusban nyilvánulhat meg mtDNS mutatiok Ugyanazon betegség hátterében különböző gének alterációi állhatnak Leigh syndroma Legtöbb kórkép multigénes - egy adott gén csak korlátozott ‘penetranciával’ befolyásolja a betegség tüneteit A legtöbb betegség multifaktoriális, ahol a környezet is fontos szerepet játszik ALS Schizophrenia Autismus

53 A dystrophin génben 2836-2838GAG (a 22
A dystrophin génben GAG (a 22. exonban) deletióval rendelkező családban calpain deficiencia. A phenotypus extrem enyhe Pt. 2 Pt. 1.

54 A dystrophin génben 2836-2838GAG (a 22. exonban) deletió
A calpain cDNS-ben nincs mutatio, de hiányzik ill. csökkent mértékben expressálódik a protein

55 A polymorph variánsok jelentősége
Egyes nagy penetranciájú allélikus variánsok közvetlen okai a betegségnek Huntington kór, cystás fibrosis, Duchenne typusú izomdystrophia Ugyanazon SNP diverz phenotypusban nyilvánulhat meg mtDNS mutatiok Ugyanazon betegség hátterében különböző gének alterációi állhatnak Leigh syndroma Legtöbb kórkép multigénes - egy adott gén csak korlátozott ‘penetranciával’ befolyásolja a betegség tüneteit A legtöbb betegség multifaktoriális, ahol a környezet is fontos szerepet játszik ALS Schizophrenia Autismus

56 ALS (amyotropiás lateralsclerosis)
80-90% - sporadikus (SALS) 10-20% - familiaris (FALS) 20%-a a FALS eseteknek SOD1 mutatio FALS - általában autosomalis dominans Juvenilis formák gyakrabban recessívek

57 Amit tudunk? Typus Öröklés Gén Locus ALS1 AD 21q22 ALS2 AR 2q33-35
AR, XD* 15q ALS6 16 ALS7 20 A betegség kezdete ≥ 45 év Több férfi érintett, mint nő Nem ismerünk hajlamosító környezeti tényezőt Nincs etnikai ill. földrajzi predispozíció

58 Szabadgyök kötő, az oxidative stressztől védő functio
Missense mutatio „toxic gain of function” A SOD1 knockout egér: phenotypusa norm. A mutáns SOD1-et overexpressáló egér: ALS Szabadgyök kötő, az oxidative stressztől védő functio SOD1 88 mutatio: 77 substitutio 3 insertio 2 deletio

59 Amit gondolunk Esetlegesen szerepet játszó gének
APEX (apurinic/apyrimidine endonuclease) APOE4 NEFH (Neurofilament Heavy Subunit) NAIP (neuronal apoptosis inhibitory polypeptide) EAAT2 (excitatory amino acid transporter) KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes NSDP: Nervous System Disease Pathway

60 Perifériás vér lymphocyták vizsgálata neuropsychiátriai genomikai
NAGY KIHÍVÁS Perifériás vér lymphocyták vizsgálata neuropsychiátriai genomikai következtetés

61 SCHIZOPHRENIA 1% az incidencia a populációban
A schizophren betegekkel kapcsolatban álló egyének között az incidencia magasabb

62 Genotipizálás: teljes genom linkage : 322 gén az érintett 2 Mb-on
(néhány ismert, pl GAD2) Expressziós vizsgálat: 2545 eltérően kifejeződő gén Pathway z value Galactose metabolism Purine metabolism Huntington disease Regulation of p27 phosphorylation during cell cycle progr

63 „bibliomics” 39,000 bio-molecular kapcsolat: 5,400 gén
abstract (neuropsych+immune-inflammation) „bibliomics” 39,000 bio-molecular kapcsolat: 5,400 gén Cytoscape –

64

65 * Minden génnél SNP LOD score és gén expresszió kombináció
= Z-score. * Minden gén Z érték és a szomszédos Z értékek kapcsolása * a hálózat összes csomópontja, ami >Z küszöb

66 Hét gén

67

68 Minden potenciális csomópont gyógyszertarget molekula

69 A komplex öröklődés rejtélye: Autismus
Az autismus az alábbi 3 tünetcsoporttal jellemzett neuropsychiatriai syndroma –Kommunikációs/Nyelvi Zavarok –Kóros szocialis interactiok –Restrictive, repetitive viselkedés Kezdet: 3 év alatt Az egyik leggyakoribb genetikus neurodevelopmentalis rendellenesség Relative Risk testvérekben = 50 Általánosan magas genetikai kockázat, de sok gén érintett

70 Az autismus coexistenciája egyéb neurodevelopmentalis betegségekkel
Autismus: nemcsak egyetlen tünet A viselkedészavarok széles spektruma A phenotypus pontosítása, endophenotypus mgh. döntő (pl. az érzelmek megfigyelésének hiánya az autizmus egyik endophenotypusának) OCD AUTISM Epilepsy 30% Rare disorder 10% Social behavior Language

71 Autism genomics

72 Strong correlation with AUTISM
Isodicentric chromosome 15 (Idic15) (duplications of the multi-disorder critical region of 15q11–14) Maternal inheritence 1. Lymphoblast cell lines derived from individuals with both autism and Idic15. array-based comparative genomic hybridization 2. Whole-genome expression profiling 112 transcripts significantly dysregulated UPREGULATION ubiquitin protein ligase E3A (UBE3A; 15q11–q13), HERC2 DOWNREGULATION APP and SUMO1 NEURONAL APOPTOSIS dysregulation of ubiquitination genotoxicity

73 CGH Baron et al Human Molecular Genetics, 2006, 15:1-17
Centroid hierarchia clustering

74 UBE3A upregulation at both mRNA and protein level

75 Contribution to understanding mechanism of autism based on these data
dysregulated ubiquitination neuronalis apoptosis (ko: csökkent motorikus aktivitás) ubiquitin-like inappropriate reduction in apoptosis ?

76 A komplex genetika feltételei
Nagy mintaszám: Kollaboráció Homogén populáció A phenotypusok, endophenotypusok precízebb újra definiálása (tünetek kezdete, képalkotó eljárások) Új analitikai módszerek, több tízezer SNP Teljes genom vizsgálatok (CGH, expresszió) „Candidate pathway analysis”