Molekuláris interakciós ujjlenyomat

Az előadások a következő témára: "Molekuláris interakciós ujjlenyomat"— Előadás másolata:

1 Molekuláris interakciós ujjlenyomat
Málnási-Csizmadia András, Bikádi Zsolt, Hazai Eszter, Jelinek Balázs, Hári Péter, Simon Zoltán, Zhenhui Yang, Zahoránszky Gergely

2 Gyógyszerfejlesztés Nagyrészt szemiempirikus
A projekt áttekintése Gyógyszerfejlesztés Nagyrészt szemiempirikus Ismert/természetes hatóanyag továbbfejlesztése High Throughput Screening Pontos hatásmechanizmus nem ismert, és nem is kell az engedélyezéshez Mellékhatások Több fehérjepartner A gyógyszerjelölt molekula elvetését okozhatja Költséges (egy gyógyszer fejlesztése több 100 millió USD)

3 Komplex szolgáltatás A. Direct Similarity B. ZMOL Similarity
A projekt áttekintése Komplex szolgáltatás A. Direct Similarity B. ZMOL Similarity C. Molecular Interaction Fingerprint Alkalmas gyógyszerjelölt molekulák többszintű szűrésére Szerkezetvizsgálat Mellékhatás-vizsgálat Straight et al, Science

4 Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Virtua Drug Kft.
Résztvevők, partnerek Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán Virtua Drug Kft. Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter DELTA Elektronik Kft. Hári Péter, Akli Péter eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont Dr. Szathmáry Eörs

5 Cél Eszköz Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel
A projekt áttekintése Cél Mellékhatás-predikció a bioinformatika eszközeivel Eszköz Molekuláris dokkolás Dokkolási probléma: Két különálló molekula atomi koordinátáiból kiindulva hogyan adható meg kettejük komplexének szerkezete? Art Olson, TSRI

6 A projekt áttekintése

7 I. Adatgyűjtés, szelekció

8 II - III. Előkészítés és dokkolás

9 IV. Az eredmények értékelése
MOLEKULÁRIS INTERAKCIÓS UJJLENYOMAT (MIF) Egyedileg jellemzi a kismolekulát Kölcsönhatási partnerek előrejelzése A fehérjekészlet diszkriminátor-felületként működik kcal/mol 8,5 2,5 -2,5 -4,5 Ligandumok Fehérjék Hasonló MIF Hasonló kölcsönhatási partnerek Hasonló hatások, Hasonló mellékhatások

10 V. A szolgáltatás beindítása

11 Összkép

12 Szolgáltatás indítása 2007. december
Állapot, ütemterv Adatgyűjtés Gyógyszermolekulák és fehérjék 100% Mellékhatások % Előkészítés % Dokkolás % Értékelés március Szolgáltatás indítása december

13 Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Virtua Drug Kft.
Résztvevők, partnerek Eötvös Loránd Tudományegyetem, Biokémiai Tanszék Dr. Málnási-Csizmadia András, Jelinek Balázs, Zahoránszky Gergely, Zhenhui Yang, Simon Zoltán Virtua Drug Kft. Dr. Bikádi Zsolt, dr. Hazai Eszter DELTA Elektronik Kft. Hári Péter, Akli Péter eScience Regionális Egyetemi Tudásközpont Dr. Szathmáry Eörs