Vasas Lívia, PhD vasas.livia@semmelweis-univ.hu 2019 A Nation Library of Medicine és adatbázisai Mozilla Firefox vagy Google Chrome böngésző Vasas Lívia,

Az előadások a következő témára: "Vasas Lívia, PhD vasas.livia@semmelweis-univ.hu 2019 A Nation Library of Medicine és adatbázisai Mozilla Firefox vagy Google Chrome böngésző Vasas Lívia,"— Előadás másolata:

1 Vasas Lívia, PhD vasas.livia@semmelweis-univ.hu 2019
A Nation Library of Medicine és adatbázisai Mozilla Firefox vagy Google Chrome böngésző Vasas Lívia, PhD 2019

2 Információ a PubMed történetéről https://www. nlm. nih
The National Library of Medicine started as a shelf of books in the Surgeon General’s office in 1836 but has grown to a collection of millions of print and electronic resources In 1879, Billings began the first comprehensive index of journal articles, the Index Medicus. It was inspired by his own experience: while writing his thesis on epilepsy, he was frustrated by the lack of a subject index to the medical literature. MEDLINE, NLM's online database, is an electronic version of that publication. MEDLINE contains over 14 million references dating back to the mid-1950s.

3

4 Rövidítések, összefüggések
NIH: National Institutes of Health NLM: National Library of Medicine: NCBI: National Center for Biotechnology Information MeSH: Medical Subject Heading PMC: PubMed Central AID: Article Identifier DOI: Digital Object Identifier ISSN: International Standard Serial Number Az NCBI az NLM-hez tartozik, az NLM pedig az NIH ágazata Több információ: .

5

6 Releváns információ a lehető legpontosabban, teljességre törekvően
túl sok a forrásanyag (nyomtatott és elektronikus könyv, folyóirat, portálok, honlapok, stb. túl sok folyóirat/közlemény és túl kevés az idő

7 MEDLINE – Az NLM gondozásában
A MEDLINE adatbázis az alábbi adatbázisok elektronikus változata 1996-tól ingyenes PubMed Index Medicus®, Index to Dental Literature, és The International Nursing Index, A MEDLINE a leggyakrabban használt orvostudományi bibliográfiai adatbázis

8 MEDLINE -1960 PubMed - 1996 orvostudományi bibliográfiai adatbázis www
MEDLINE PubMed orvostudományi bibliográfiai adatbázis Több, mint 28 millió rekord, 5600 folyóiratból (orvosi, fogászati, ápolástan, egészségügyi, orvostörténeti folyóiratok, valamint online könyvek is indexelve vannak) A MEDLINE rekordok MeSH (Medical Subject Headings) tárgyszavakat tartalmaznak A legtöbb rekord angol nyelvű, valamint absztrakt is olvasható

9 MEDLINE – a subset of PubMed https://www. nlm. nih

10 Különböző státuszú rekordok https://www. nlm. nih
<PubmedArticle> is one of the top document level elements in the PubmedArticleSet - contains the <MedlineCitation> and <PubmedData> elements. MedlineCitation> is a sub-document envelope containing the following elements: <PMID> <DateCreated> <DateCompleted> <DateRevised> <Article> <MedlineJournalInfo> <ChemicalList> <SupplMeshList> <CitationSubset> <CommentsCorrectionsList> <GeneSymbolList> <MeshHeadingList> <NumberofReferences> <PersonalNameSubjectList> <OtherID> <OtherAbstract> <KeywordList> <CoiStatement> <SpaceFlightMission> <InvestigatorList> <GeneralNote>. n-Data-Review n this status have undergone review at the journal issue level; i.e., the journal title, date of publication and volume/issue elements (referred to as the source data) are checked In-Process MEDLINE In-process records undergo rigorous quality assurance routines before they are elevated to MEDLINE status or to PubMed-not-MEDLINE status. Records in MEDLINE status are the only 'true' MEDLINE records PubMed-not-MEDLINE Records in this status are from journals included in MEDLINE and have undergone quality review but are not assigned MeSH headings because the cited item is not in scope for MEDLINE either by topic or by date of publication, or from non-MEDLINE journals and have undergone quality review. The specific categories of non-MEDLINE records in this status are: The records in Publisher MedlineCitation Status are: retrospective records . . .

11 Értékesebb adatok a MEDLINE rekordokban https://www. nlm. nih
A rekord típusa: MEDLINE Tartalmaz: MeSH kifejezéseket a publikáció típusát substance names (if applicable) ellenőrzöttek a bibliográfiai adatai

12

13

14

15

16

17

18 PubMed – alap keresés

19

20

21

22

23 https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00240-016-0882-9

24

25

26

27 Mozilla böngészőből indítva
Sign in lehetőség (2005-től) Regisztrációnál ne használjunk speciális karaktereket (pl. * . : á Ö ; szóköz) Közvetlenül az NCBI-ba register for an account

28 My NCBI: regisztráció utáni előnyök
A keresés mentése Save searches. Értesítők beállítása Set up automatic alerts. Saját gyűjtemény Create collections of citations. Igény szerint megosztás Share collections of citations.

29 Filterek beállítása Manage Filters…..
Properties - Subsets: MEDLINE records „Related Information” Create custom filter „in process” or as you like

30 Author information My NCBI – NCBI Site Preferencies – Author Information - On

31 PubMed lehetőségek Show additional filters Send to, Save search
Advanced search Results by year, by relevance PMC images search for Titles with your search terms free full-text articles in PMC Search details, Recent activities PubMed Commons stb.

32 Keresés mentése…Create alert …

33 Kollekciók …

34 PubMed DOI: /ICO A „substances” között van „collagen” Igaz Hamis Among the „Related information” are more connection with other databases Hol található Molecular Weight of Riboflavin? MedGen PubChem Compound

35 Feladat Állítson be egy értesítést - egy adott témáról
- egy személyről Hozzon létre egy kollekciót egy tetszőleges témáról, mely 4 rekordot tartalmaz

36 PubMed Advanced search

37

38 MeSH-ből indított keresés

39

40

41 From MESH

42 MeSH – retracted publications

43

44 Feladat MeSH term (Entry term): Broken Heart Syndrome
The subheading is: psychology The result in PubMed: „review” közlemények száma: Az elmúlt 5 év publikációi:

45 Konkrét folyóirat füzetre történő keresés

46

47

48

49 Klinikai lekérdezések

50

51

52 PMC

53

54 Ez a keresés még mindig nem jó ….
Kevés – sok találat - relevánsabb kulcsszavak – újragondolni a keresési folyamatot Csonkolás: * (inflammmatory, inflammation, stb. A közlemény típusokra kiemelt figyelem…

55

56 Helyes irodalomkeresési módszer
Kiválasztani az adatbázist (PubMed, PMC, stb…) Átgondolni a keresési stratégiát Lépésről lépésre végrehajtani (MeSH/ szabad szavas keresés, szűrők használata)

57 Saját adatbázis a hasznos rekordokból

58

59

60

61 MedlinePlus Health információ http://www. nlm. nih

62

63

64

65 Kérdések A MEDLINE kevesebb rekordot tartalmaz, mint a PubMed.
Igaz Hamis A DOI száma: /iovs A közlemény szerzője Szél Á . Igaz Hamis

66 Kérdések A „Cardiology” MeSH term, altárgyszava „trends”, mennyi „clinical trial” típusú rekordot tartalmaz a PubMed adatbázis? doi: / A publikáció típusa: Review article comparative study letter

67 Kérdés A 2013-ban megjelent cikk helyes DOI száma, a szerzők: Vasas L és Berhidi A: / /OH….29653 /OH

68 Kérdés Ebola fertőzést kapott egy gyermek. Kezdje a keresést a MeSH-ben. Hány „review” típusú publikációt talál a PubMed-ben?

69 Doi: 10.1371/journal.pntd.0001359 Ez nyílt hozzáférésű közlemény?
Igen Nem 10 ábrát tartalmaz a cikk. Igaz Hamis 53 tétel szerepel az irodalomjegyzékben.

70 doi: 10.1016/j.micron.2015.08.003 Ez nyílt hozzáférésű közlemény?
Igen Nem A táblázatok száma:

71 Köszönöm a figyelmet! Az információt etikusan kell
használni és idézni!