Előadást letölteni
Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon
1
A HIV eredete(i) Több független átugrás 4 sikeres csoport:
HIV-1 M és O csoportja HIV-2 A és B csoportja Több sikertelen csoport
2
Járványos törzsek: szűk időablak
HIV-csoport Utolsó közös ős References HIV-1 group M 1920 ( ) 1937 ( ) Salemi et al. (2000) 1931 ( ) Korber et al. (2000) 1921 ( ) 1902 ( ) 1908 ( ) Worobey et al. (2008) HIV-1 group O 1920 ( ) Lemey et al. (2004) 1905 ( ) Wertheim & Worobey (2009) HIV-1 group N 1963 ( ) HIV-2 group A 1940 ( ) Lemey et al. (2003) 1932 ( ) HIV-2 group B 1945 ( ) 1935 ( ) Az összes sikeres HIV-csoport a 20. század első felében ugrott át emberre.
3
Az időzítés problémája
Miért nem előbb? „Bushmeat” vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta Urbanizáció, megnövekedett mobilitás, stb. Parenterális átvitel? Léopoldville in 1896 (view from Mount Léopold) and c, around 1955 (the commercial centre). Nature 455, (2 October 2008) Source: Nature 455, 605.
4
Később miért nem? HIV emergence Kinshasa Brazzaville Cities
Living wild chimps Global syringe production HIV-1-O HIV-1-M HIV-2-A and B 108 400k 107 2 million Also: why were group N and “group P” not successful? These two clades are evidence that primary jump could occur also after the time window—but could not initiate an epidemic. Treatments in Belgian Congo 106 # of people treated in millions Jenner. vacc. in millions Kinshasa 200k Brazzaville 105 300k 40k 104 1910 1930 1950 1970 Time
5
Hipotézis A HIV-járványok epicentrumai különlegesen kedvező körülményeket kínáltak a vírus heteroszexuális terjedéséhez. A jelenlegi terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) Akut fertőzés Körülmetélés Genitális fekélyek (Genital ulcer disease, GUD) Ugyanezek a tényezők játszhattak szerepet a HIV korai terjedésében.
6
Esettanulmány: Kinshasa
A HIV-1 M csoportjának epicentruma Adatgyűjtés Tudományos irodalom (orvosi, virológiai, néprajzi, stb.) Eredeti archívum-feldolgozás
7
Esettanulmány: Kinshasa
This is just to give an idea of the true scale of the archive research...
8
Esettanulmány: Kinshasa
GUD csúcs a 20. század elején A mainál alacsonyabb körülmetélési ráta
9
Szimulációs modell Egyed alapú modell Kategóriák:
HIV státusz (a fertőzés kora) GUD státusz (a fekély kora) Körülmetélt státusz Kategóriák: Egyedülálló férfi/nő Házas férfi/nő “Femmes libres” Prostituált (Commercial sex worker, CSW) Rögzített populációméret Dinamikus kapcsolati háló Időlépés: 1 hét, időtartam: 1 év. Sztochasztikus folyamatok. We wanted to make a quantitative assessment whether Kinshasa was indeed permissive for heterosexual HIV spread in this period, and if so, which factors were responsible.
10
Szimulációs modell: szexuális háló
11
Szimulációs modell: szexuális háló
Stabil linkek
12
Szimulációs modell: szexuális háló
Stabil linkek Rövid távú linkek
13
Szimulációs modell: szexuális háló
Stabil linkek Rövid távú linkek CSW linkek Paraméterek: Yaoundé, friss adatok
14
Szimulációs modell: szexuális háló
1. HÉT
15
Szimulációs modell: szexuális háló
2. HÉT
16
Szimulációs modell: szexuális háló
3. HÉT
17
Szimulációs modell: a HIV terjedése
1. HÉT
18
Szimulációs modell: a HIV terjedése
2. HÉT
19
Szimulációs modell: a HIV terjedése
3. HÉT
20
Szimulációs lépés Szexuális linkek felbomlása és keletkezése
Szexuális kontaktusok generálása HIV átadása a kontaktusokon keresztül GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése
21
Szimulációs lépés Szexuális linkek felbomlása és keletkezése
Szexuális kontaktusok generálása HIV átadása a kontaktusokon keresztül GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése A szexuális hálózat szimulációja, amíg beáll az egyensúlyi struktúra.
22
Szimulációs lépés Szexuális linkek felbomlása és keletkezése
Szexuális kontaktusok generálása HIV átadása a kontaktusokon keresztül GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése A szexuális hálózat szimulációja, amíg beáll az egyensúlyi struktúra. HIV-fertőzés indítása egyetlen férfiben.
23
Szimulációs modell: paraméterek
A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) Genitális fekélyek (GUD) Akut fertőzés Körülmetélés Kezdetben alacsony hatékonyság
24
A kapcsolati háló paraméterei
25
Kinshasa: történeti szcenáriók
Prekoloniális falu: kis népesség, kiegyensúlyozott ivararány, nincs GUD. 1919: növekvő populáció, torzult ivararány, tomboló GUD-járványok, körülmetéletlen népcsoportok. 1929: további népességnövekedés 1958: további népességnövekedés, általános körülmetéltség, GUD-kontroll, normalizálódó ivararány
26
Eredmények#1: történeti szcenáriók
1000 futtatás minden szcenárióra 1919-ben és 1929-ben különösen kedveztek a feltételek a HIV terjedésének.
27
Érzékenységi vizsgálat
Az eredmények robusztusak voltak a kapcsolati háló paraméterei az alap átviteli ráta a körülmetélés védőhatása a krónikus stádium fertőzőképessége tekintetében.
28
Eredmények#2: mely tényezők voltak fontosak?
Az 1919-es beállításokból kiindulva teszteltük: 10-szeresen csökkentett populációméret kiegyensúlyozott ivararány GUD hiánya általános körülmetélés hatását.
29
Eredmények#2: mely tényezők voltak fontosak?
A GUD-prevalencia volt messze a legerősebb tényező.
30
Összegzés A HIV-járvány elindulásában kulcsszerepe lehetett a gyarmati központokban kialakult GUD-járványoknak. Az „időablakot” valószínűleg a GUD-járványok visszaszorítására indított kezelési kampányok zárták be a 30-as évek közepén. A körülmetélés és a populációméret/szerkezet valószínűleg a GUD-gyakoriságon keresztül közvetett hatást fejtett ki. A nemi fekélyt okozó betegségek kontrollja kulcsfontosságú újabb HIV-törzsek kialakulásának megakadályozásában. (a GUD-járványok szerepe a többi járványos HIV-csoport kialakulásában is fontos lehetett: HIV-1 O Doualában (Kamerun), HIV-2 A és B Abidjanban (Elefántcsontpart)). This is a parsimonious explanation for the origin of HIV. The results also imply that new transmissions like group N and P cannot spread because the favourable conditions are no longer there.
31
Mire jók még a modellek?
Hasonló előadás
