A HIV eredete(i) Több független átugrás 4 sikeres csoport:

Slides:



Advertisements
Hasonló előadás
Windows Virtualizáció
Advertisements

2005. szeptember 15. A CEBS CRD-hez kapcsolódó egyéb, előkészület alatt álló anyagai Seregdi László szeptember 15.
A Windows Azure egy skálázható számításifelhő-platform, amelyet a Microsoft hosztol a világ több pontján lévő adatközpontjaiban. Az Azure egyszerű,
KEVESEBB FELÜGYELET ÚJ ÜZLETI MODELLEK NAGYOBB TERMELÉKENYSÉG.
Licencelés Kovács Nóra Ker-Soft Kft.
2. előadás.
Készítette: Frankó Ádám Prog. Info, 14.csop.
AFRIKA Készítette: Csik Annamária Molnár Vivien Ring Evelin.
„Songlish” How not to be a „Bicky Chewnigh”. Lehet zöld az ég…
Windows Azure Infrastruktúra és platform a felhőben
HUNGARY’S PARLAMENT PARLAMENT MAGYARORSZÁG PARLAMENTJE PARLAMENTJE.
Számold meg a fekete pontokat!
AIDS Acquired ImmunoDeficiency Syndrome (Szerzett Immunhiányos Tünetegyüttes)
Árvai Zoltán Számalk Oktató központ.
Populáció növekedés október 1.
Müller Viktor A HIV múltja és jövője – honnan jött és hová tart? december 4. szerda ELTE TTK Déli Tömb fszt., Kitaibel Pál terem (0-823) Budapest,
Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja
A Windows 7 automatizált telepítése Windows AIK használatával
Reconciliation of essential process parameters for an enhanced predictability of arctic stratospheric ozone loss and its climate interactions
Krizsán Zoltán.  Ha az algoritmus sokáig dolgozik,  de el akarjuk kerülni a „fagyást”.  Kisebb a költsége, mint az új folyamatnak.  Programozás szempontjából.
1 Ismételt fogolydilemma játék sztochasztikus reaktív stratégiákkal 4. előadás Axelrod számítógépes versenyének megismétlése A nyereménymátrix és a stratégiák:
Ismételt fogolydilemma játék sztochasztikus reaktív stratégiákkal. 4
Ittzés Zsigmond Budapest Airport IT Infrastruktúra manager
Microsoft CRM online Strén András
SEVEN DONT'S AFTER A MEAL Hét dolog amit nemszabad tenni, étkezés után.
Egy GAZDAG HIBAJELENTÉS elég információt tartalmaz ahhoz, hogy AZONNALI LÉPÉSEKET lehessen tenni, a javítás érdekében.
Rendelkezésre álló erőforrások pontos ismerete Kiosztott feladatok közel „valósidejű” követése Átláthatóság Tervezési folyamatok támogatása.
Our Earth is a fragile planet that we must work hard to protect for many future generations to enjoy. We can protect our planet only if we work together.
Torr-1 Pierre Fermat, the great French mathematician (and lawyer) asked the following problem from Torricelli, the physician living in Firense: Find.
Sims-1 This chapter is about Simson line. The question arises in connection with orthic triangles: from which points should we draw perpendicular lines.
Entropy Lawrence Sklar: Up and Down, Left and Right, Past and Future.
Amerikai Magyar Baptista Gyülekezet, Alhambra
„Breaking news”. Matematikai modellezés az AIDS-kutatásban Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport
Az AIDS modellezése Müller Viktor ELTE Növényrendszertani és Ökológiai Tanszék.
Alapmodell + HIV-ellenes effektorsejtek Alapmodell: Folyamatfüggvények.
Az alacsony egyensúlyi szint problémája Callaway és Perelson Bull Math Biol 64: (2002) nyomán Hogyan magyarázható az alacsony egyensúlyi (?) vírusszint.
Legyőzhető-e a HIV-járvány a jelenlegi eszközeinkkel? Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport
A HIV-fertőzés ezer arca: a vírus, a betegség, a járvány
Megállíthatnánk-e a HIV-járványt, ha igazán akarnánk? Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport
Rugalmas, moduláris felépítés Rugalmas telepítés Jól tervezhető szerepkörök Folyamatos rendelkezésre állás Egyszerű felügyelet Elérés bárhonnan Postafiók.
A Microsoft Üzleti Intelligencia megoldása és platformja
Blog Fülöp Dávid MCT, MCPD Egy blog sémája Use Case-ek – Blog áttekintése – Egy blogpost megtekintése – Blogpost írása – Blogpost.
A klímaváltozás társadalmi hatásai Bozó László. Az éghajlati rendszer.
Cinema du look Posztmodern Neobarokk. Jean Jacques Beineix Luc Besson Leos Carax.
Vállalati infrastruktúra, mely minden igényt kielégít Felhasználóbarát eszközök és élmények.
Beginner Dialogues - In a motel / hotel Getting a room for the night - Good evening. Can I help you? - Yes, please. I'd like a room for the night. - Would.
A világon elsőként: NEMZETKÖZI VIRTUÁLIS SAKKISKOLA (  Világszerte elfogadott tény, melyet számos kutatási eredmény is.
Pozitron Emissziós Tomográfia (PET) olyan nukleáris orvosi képalkotási technika, amely - három dimenziós felvételt készít a test egy kiválasztott részének.
2009.IV.30.Argumentation techniques 1 Non-mirrorable argumentation techniques in English Analysis of theological texts aiming persuasion effects László.
A RITUXIMAB-FLUDARABINE-CYCLOPHOSPHAMIDE (RFC) KEZELÉS EREDMÉNYESSÉGÉT BEFOLYÁSOLÓ TÉNYEZŐK KRÓNIKUS LYMPHOID LEUKAEMIÁS (CLL) BETEGEINKBEN FACTORS PREDICTING.
Farkas Bálint | Technical Evangelist | Microsoft.
A HIV-fertőzés ezer arca: a vírus, a betegség, a járvány
“Tudásmegosztás és szervezeti problémamegoldás a mesterséges intelligencia korában” Levente Szabados Technológiai Igazgató.
A Büntetés-végrehajtási Szervezet helyzete és aktuális feladatai
Véradás Véradási szándékot és viselkedés befolyásoló tényezők feltárása, különös tekintettel a kommunikáció hatékonyságának vizsgálatára esettanulmány.
Pozitron Emissziós Tomográfia (PET)
Parazitizmus Def.: Olyan szervezetek, amelyek a gazdaállatot nem ölik meg (vagy nem azonnal), de súlyos fitnisz csökkenést okoz(hat)nak. (Az „ideális”
(Резьба по яичной скорлупе)
Farkas Bálint | Technical Evangelist | Microsoft
FAZEKAS ANDRÁS ISTVÁN PhD c. egyetemi docens
Mi a megbocsátás jelentősége? What is the significant of forgivness?
FAZEKAS ANDRÁS ISTVÁN PhD c. egyetemi docens
A sas törénete… A bemutatót készítette: Mike
Buy Protonix 40 Mg buy generic pantoprazole can i buy protonix over the counter where can i buy protonix buy pantoprazole buy pantoprazole online The main.
A nagyváradi villamosok megbízhatósági modellezése
„Agilis-e vagy?” – egy váltókezelő naplója
HWSW Meetup – Felhő és ami mögötte van
Emberpiac a Moszkva téren
(Резьба по яичной скорлупе)
Előadás másolata:

A HIV eredete(i) Több független átugrás 4 sikeres csoport: HIV-1 M és O csoportja HIV-2 A és B csoportja Több sikertelen csoport

Járványos törzsek: szűk időablak HIV-csoport Utolsó közös ős References HIV-1 group M 1920 (1902-39) 1937 (1925-49) Salemi et al. (2000) 1931 (1915-41) Korber et al. (2000) 1921 (1908-33) 1902 (1873-1922) 1908 (1884-1924) Worobey et al. (2008) HIV-1 group O 1920 (1890-1940) Lemey et al. (2004) 1905 (1866-1938) Wertheim & Worobey (2009) HIV-1 group N 1963 (1948-77) HIV-2 group A 1940 (1924-56) Lemey et al. (2003) 1932 (1906-55) HIV-2 group B 1945 (1931-59) 1935 (1907-61) Az összes sikeres HIV-csoport a 20. század első felében ugrott át emberre.

Az időzítés problémája Miért nem előbb? „Bushmeat” vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta Urbanizáció, megnövekedett mobilitás, stb. Parenterális átvitel? Léopoldville in 1896 (view from Mount Léopold) and c, around 1955 (the commercial centre). Nature 455, 605-606(2 October 2008) Source: Nature 455, 605.

Később miért nem? HIV emergence Kinshasa Brazzaville Cities Living wild chimps Global syringe production HIV-1-O HIV-1-M HIV-2-A and B 108 400k 107 2 million Also: why were group N and “group P” not successful? These two clades are evidence that primary jump could occur also after the time window—but could not initiate an epidemic. Treatments in Belgian Congo 106 # of people treated in millions Jenner. vacc. in millions Kinshasa 200k Brazzaville 105 300k 40k 104 1910 1930 1950 1970 Time

Hipotézis A HIV-járványok epicentrumai különlegesen kedvező körülményeket kínáltak a vírus heteroszexuális terjedéséhez. A jelenlegi terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) Akut fertőzés Körülmetélés Genitális fekélyek (Genital ulcer disease, GUD) Ugyanezek a tényezők játszhattak szerepet a HIV korai terjedésében.

Esettanulmány: Kinshasa A HIV-1 M csoportjának epicentruma Adatgyűjtés Tudományos irodalom (orvosi, virológiai, néprajzi, stb.) Eredeti archívum-feldolgozás

Esettanulmány: Kinshasa This is just to give an idea of the true scale of the archive research...

Esettanulmány: Kinshasa GUD csúcs a 20. század elején A mainál alacsonyabb körülmetélési ráta

Szimulációs modell Egyed alapú modell Kategóriák: HIV státusz (a fertőzés kora) GUD státusz (a fekély kora) Körülmetélt státusz Kategóriák: Egyedülálló férfi/nő Házas férfi/nő “Femmes libres” Prostituált (Commercial sex worker, CSW) Rögzített populációméret Dinamikus kapcsolati háló Időlépés: 1 hét, időtartam: 1 év. Sztochasztikus folyamatok. We wanted to make a quantitative assessment whether Kinshasa was indeed permissive for heterosexual HIV spread in this period, and if so, which factors were responsible.

Szimulációs modell: szexuális háló

Szimulációs modell: szexuális háló Stabil linkek

Szimulációs modell: szexuális háló Stabil linkek Rövid távú linkek

Szimulációs modell: szexuális háló Stabil linkek Rövid távú linkek CSW linkek Paraméterek: Yaoundé, friss adatok

Szimulációs modell: szexuális háló 1. HÉT

Szimulációs modell: szexuális háló 2. HÉT

Szimulációs modell: szexuális háló 3. HÉT

Szimulációs modell: a HIV terjedése 1. HÉT

Szimulációs modell: a HIV terjedése 2. HÉT

Szimulációs modell: a HIV terjedése 3. HÉT

Szimulációs lépés Szexuális linkek felbomlása és keletkezése Szexuális kontaktusok generálása HIV átadása a kontaktusokon keresztül GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése

Szimulációs lépés Szexuális linkek felbomlása és keletkezése Szexuális kontaktusok generálása HIV átadása a kontaktusokon keresztül GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése A szexuális hálózat szimulációja, amíg beáll az egyensúlyi struktúra.

Szimulációs lépés Szexuális linkek felbomlása és keletkezése Szexuális kontaktusok generálása HIV átadása a kontaktusokon keresztül GUD és HIV státusz, fertőzött időtartam frissítése A szexuális hálózat szimulációja, amíg beáll az egyensúlyi struktúra. HIV-fertőzés indítása egyetlen férfiben.

Szimulációs modell: paraméterek A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők: Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) Genitális fekélyek (GUD) Akut fertőzés Körülmetélés Kezdetben alacsony hatékonyság

A kapcsolati háló paraméterei

Kinshasa: történeti szcenáriók Prekoloniális falu: kis népesség, kiegyensúlyozott ivararány, nincs GUD. 1919: növekvő populáció, torzult ivararány, tomboló GUD-járványok, körülmetéletlen népcsoportok. 1929: további népességnövekedés 1958: további népességnövekedés, általános körülmetéltség, GUD-kontroll, normalizálódó ivararány

Eredmények#1: történeti szcenáriók 1000 futtatás minden szcenárióra 1919-ben és 1929-ben különösen kedveztek a feltételek a HIV terjedésének.

Érzékenységi vizsgálat Az eredmények robusztusak voltak a kapcsolati háló paraméterei az alap átviteli ráta a körülmetélés védőhatása a krónikus stádium fertőzőképessége tekintetében.

Eredmények#2: mely tényezők voltak fontosak? Az 1919-es beállításokból kiindulva teszteltük: 10-szeresen csökkentett populációméret kiegyensúlyozott ivararány GUD hiánya általános körülmetélés hatását.

Eredmények#2: mely tényezők voltak fontosak? A GUD-prevalencia volt messze a legerősebb tényező.

Összegzés A HIV-járvány elindulásában kulcsszerepe lehetett a gyarmati központokban kialakult GUD-járványoknak. Az „időablakot” valószínűleg a GUD-járványok visszaszorítására indított kezelési kampányok zárták be a 30-as évek közepén. A körülmetélés és a populációméret/szerkezet valószínűleg a GUD-gyakoriságon keresztül közvetett hatást fejtett ki. A nemi fekélyt okozó betegségek kontrollja kulcsfontosságú újabb HIV-törzsek kialakulásának megakadályozásában. (a GUD-járványok szerepe a többi járványos HIV-csoport kialakulásában is fontos lehetett: HIV-1 O Doualában (Kamerun), HIV-2 A és B Abidjanban (Elefántcsontpart)). This is a parsimonious explanation for the origin of HIV. The results also imply that new transmissions like group N and P cannot spread because the favourable conditions are no longer there.

Mire jók még a modellek?