Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Az előadás letöltése folymat van. Kérjük, várjon

Obekon Projekt Informatikai Háttere Budinszky András Vezsenyi József Pázmány Péter QSX Quality Katolikus Egyetem Software eXpert Kft Az informatika elsődleges.

Hasonló előadás


Az előadások a következő témára: "Obekon Projekt Informatikai Háttere Budinszky András Vezsenyi József Pázmány Péter QSX Quality Katolikus Egyetem Software eXpert Kft Az informatika elsődleges."— Előadás másolata:

1 Obekon Projekt Informatikai Háttere Budinszky András Vezsenyi József Pázmány Péter QSX Quality Katolikus Egyetem Software eXpert Kft Az informatika elsődleges szerepe a projekt megfelelő hátterének biztosítása. A projekt során igen nagy méretű és komplex bioinformatikai adatbázist kell létrehoznunk. Ebben tároljuk egyrészt a nagyszámú beteg, valamint kontrol egyedtől vett vér-, illetve zsírszövet minta feldolgozása során nyert adatokat, másrészt az egyedek körében begyűjtött szocio-, öko-, demográfiai-, valamint táplálkozási szokásaikra és fizikai aktivitásukra vonatkozó információkat. Ez a bioinformatikai adatbázis teszi lehetővé a különféle típusú adatok együttes kezelését, megőrzését, és a későbbiekben a feldolgozását, elemzését is. A nagymennyíségű adathoz jelentős kapacitású számítógépes hátteret kellett – két különböző helyszínen - új beszerzéssel, illetve bővítéssel létrehoznunk. Bevezetés Adatbázis Konfigurációk O B E K O N Richter: Quad Core IntelR XeonR X5355, 2x4MB Cache, 2.66GHz, 1333MHZ FSB. 16GB FB 667MHz Memory (8x2GB dual rank DIMMs). 8x300GB, SAS, 3.5-inch, rpm Hard Drive (hot plug). PERC 5/i Integrated RAID Controller Card. 48X CDRW/DVD Combo Drive, IDE, Half Height. 3.5" Internal Floppy Disk Drive. Two Hot Plug Power Supplies for Redundancy. Dell Remote Access Card, 5th Generation for PowerEdge Remote Management Pázmány (bővítés): IBM DS4000, DS47000, SAN16B, Fiber, 750GB IBM 730 GB RPM Hot-swap SATA Adatbázis szerkezete: Az összegyűjtött adatok az Oracle adatbázisban több típusba csoportosíthatók, és ezek a csoportok külön-külön táblákba kerülnek az alábbiak szerint: - azonosító adatok - anamnesis - családi anamnesis – apa - családi anamnesis – anya - családi anamnesis – testvér - obesitas - szenvedélybetegségek - fizikális vizsgálat - aktuális terápia - laboradatok - nőgyógyászati anamnesis - DNS adatok (SNP vizsgálatokhoz) - limfociták adatai - táplálkozási szokások - fizikai aktivitás - stb. Adatvédelem - Jogosultság kezelése Ez kettős szinten történik: - az adatbázist tároló számítógépekhez csak VPN kapcsolaton keresztül, „névre” szóló kulccsal lehet kívülről hozzáférni - az Oracle adatbázisban definiált rendszer-, illetve objektum privilégiumok biztosítják, hogy a konzorciumi tagok csak differenciáltan (előzetesen hozzárendelt jogok szerint) kérdezhessék le az adatokat. Adatáramlás - Logisztika megszervezése - Személyiség védelem biztosítása (adatok gyűjtésénél és tárolásánál is) - Oracle adatbázis megtervezése és létrehozása - Adatbázis elérés megszervezése (VPN kapcsolaton keresztűl, névre szóló „kulccsal”) - Bioinformatikai algoritmusok alkalmazása és továbbfejlesztése Alapadatok összegyűjtése Biztonsági másolatok készítése XLS adat-export készítése, személyes adatok nélkül XLS fájlok összegyűjtése Adatok feldolgozása, elemzések készítése XLS adatok kiegészítése a klinikai laboreredményekkel vagy a még hiányzó adatokkal Vér továbbítása az SE GSI laborba Vérvétel Vonalkód nyomtatása, felragasztása Kódgenerálás, adatok rögzítése az XLS fájlba Laboradatok elkészítése Az összes adat összegyűjtése egy központi adatbázisba Vér továbbítása a Richterbe Egyes eredmények lekérdezése A táplálkozási szokások, a fizikai aktivitás és a pszichoszociális tényezők felméréséből származó adatok


Letölteni ppt "Obekon Projekt Informatikai Háttere Budinszky András Vezsenyi József Pázmány Péter QSX Quality Katolikus Egyetem Software eXpert Kft Az informatika elsődleges."

Hasonló előadás


Google Hirdetések